科研产出
中国普通野生稻重要农艺性状的遗传多样性研究
《植物遗传资源学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：普通野生稻(Oryza rufipogon Griff.)是水稻(O.sativa L.)的野生近缘种,是水稻遗传改良的重要资源.本研究以覆盖除云南外的中国普通野生稻分布区的1777份种质资源为对象,进行抽穗期、花药长度、粒长、粒宽和粒重5个重要农艺性状的遗传多样性、主成分和方差分析.结果 表明,中国普通野生稻具有丰富的遗传多样性,抽穗期、花药长度、粒长、粒宽和粒重的变异系数分别是6.36%、17.10%、7.32%、8.86%和15.90%,多样性指数分别是1.30、1.47、1.45、1.39和1.33.主成分分析表明第1和第2主成分主要与产量性状有关,累计贡献率达到83.31%;第3主成分主要与抽穗期有关,前3个主成分的累积贡献率约为95.46%.主成分分析结合聚类分析,发现普通野生稻群体可以分成3个类群,类群1主要来自江西和湖南,类群2主要来自于广西和广东大部分区域和福建,类群3主要来自于海南和广东南部区域的湛江市,样品的聚类关系和地理位置成正相关.以地理群为因素对5个重要农艺性状进行方差分析,结果显示花药长度、抽穗期和粒长变异在不同地理群间的变异占总变异的比例分别为69.09%、57.98%和77.56%,而粒宽变异所占比例为6.20%,花药长度、抽穗期和粒长变异在普通野生稻地理群间差异起决定作用.
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镉低积累水稻资源的镉积累稳定性及遗传相似性分析
《植物遗传资源学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：以9311为高镉对照,湘晚籼12号为相邻低镉对照,2014-2017年经田间鉴定筛选出的15份镉低积累水稻资源为参试材料,鉴定精米的相对降镉率并筛选出年度间相对降镉率差异不显著的资源;采用45对SSR引物检测15份资源的遗传多样性,提出遗传距离大且相对降镉率高的育种可用资源.2018年试验结果表明,15份低镉水稻资源的精米镉含量都低于湘晚籼12号,相对降镉率大于50%的有10份,变幅为50.8%~83.5%;小于50%的有5份,变幅为1.9%~49.8%;2019年试验结果表明,7份生育期相近的资源,相对降镉率都大于50%,变幅为60.1%~78.7%;2年试验结果的综合分析表明,4份低镉资源BS82、X211、7W172、7W216的镉积累在年度间无显著性差异,且相对降镉率都在50%以上.15份镉低积累资源总体遗传多样性较为丰富(Na=4.311、Ne=3.257、Ho=0.041、He=0.657、I=1.207、Nei′s=0.639、PIC=0.612);遗传相似系数(GS)的平均值为0.377,BS82和X211、BS82和7W172(7W216)、X211和7W172(7W216)的遗传相似系数分别为0.319、0.447、0.426,表明亲缘关系较远.由上说明BS82、X211、7W172、7W216是镉低积累新品种选育的可利用的宝贵资源.
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江华苦茶的亲缘关系与遗传多样性研究
《茶叶通讯 》 2019
摘要：采用荧光SSR分子标记与cpDNA序列分析技术相结合的方法,对江华苦茶4个自然居群的32份资源进行遗传多样性、亲缘关系和遗传分化研究.结果表明:cpDNA变异率约为0.78%,分为5个单倍型,单倍型多样性为Hd=0.726,核苷酸多样性为 π=0.00233,遗传多样性较高;H3是基础的单倍型,H4和H5之间只有一个位点的差异,亲缘关系最近;居群遗传分化系数较高(FST=0.26019),基因流较低(Nm=0.71),cpDNA变异主要在居群内(89.29%),居群间遗传分化程度较低;中性检测和失配分析结果表明江华苦茶没有发生扩张事件.荧光SSR分子标记Ho、He和Nei分别为0.56、0.65和0.64,遗传多样性较高;3号和27号样品与其他样品相似度低于75%,4、8、13、16、17、20、21、31、32相互之间相似度高于85%,亲缘关系最近;群体间的遗传分化系数较小(FST=0.0971),基因流较高(Nm=2.3254),核基因遗传变异主要出现在居群内(90.98%),居群间遗传分化程度较低.
关键词： 江华苦茶 SSR cpDNA 遗传多样性 亲缘关系 遗传分化
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江永普通野生稻遗传多样性和籼粳基因频率监测分析
《植物遗传资源学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：以栽培稻的8个籼-粳测验种为对照,采用39对SSR引物检测了江永野生稻居群在1982年、2008年、2017年的遗传多样性,采用38对In Del引物检测了江永野生稻居群在1982年、2008年、2017年的籼-粳基因频率.结果表明:在1982年取样保存在异位圃的40份样本的遗传多样性稍高于2008年、2017年原位保护区样本的遗传多样性;2008年取的样本数虽然比2017年多,但两次取的样本之间遗传多样性几乎没差异.不同年份取的样本之间的遗传分化系数Fst都很小,基因流Nm都较大,分化不明显.通过聚类分析和主坐标分析(PCo A),发现野生稻居群与4份栽培粳稻聚为一类,4份栽培籼稻单独聚成一类,显示江永野生稻与粳稻的血缘近于籼稻;籼-粳基因频率的分析表明,野生稻样本多属粳稻型,少数属偏粳稻型,原位保护区的偏粳稻类型单株数占取样单株总数的比例,2008年比1982年的增加了10.0%,2017年比2008年的增加了1.6%,显示江永野生稻原位保护区生境条件有利野生稻从粳稻型向偏粳稻型变异,随着野生稻产生环境适应性变异,籼型基因频率在提高.
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基于主要农艺性状和trnH-psbA序列的辣椒聚类分析
《中国农学通报 》 2019 CSCD
摘要：旨在研究辣椒种质的遗传多样性和筛选核心种质资源.对98份辣椒种质的株高、株幅和主茎高等主要农艺性状和叶绿体的trnH-psbA序列进行了调查和分析.98份辣椒种质的农艺性状有较大区别,特别是单果重、果长、叶片叶绿素、株高等性状表现为显著或极显著的差异;同时,基于trnH-psbA序列可以将所有种质分成三大类,分别含种质29、31和38个;综合农艺性状和trnH-psbA序列筛选出31份核心种质.辣椒种质存在较高的遗传多样性,通过筛选的核心种质代表了98份种质的遗传多样性,可以应用于育种.
关键词： 辣椒 农艺性状 trnH-psbA序列 核心种质 遗传多样性
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湖南芝麻种质资源农艺性状的遗传多样性
《湖南农业大学学报(自然科学版) 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：采用主成分分析和聚类分析的方法,对收集的湖南省63份芝麻种质资源的12个质量性状和9个数量性状进行遗传多样性分析。结果表明:湖南省芝麻资源具有广泛的遗传多样性,12个质量性状中,茎秆绒毛的遗传多样性指数最高,为1.310,叶序的最低,为0;9个数量性状中,空梢尖长的变异系数最大,为39.962%,千粒质量的最小,为12.397%;9个数量性状的主成分分析结果表明,前4个主成分的累计贡献率达74.076%。63份种质可分为4大类:第Ⅰ类(24份)可作为选育四棱以上芝麻品种的候选群体;第Ⅱ类(34份)可作为选育丰产型品种的候选群体;第Ⅲ类(2份)可作为选育矮秆型品种及蒴果长度较长品种的候选群体;第Ⅳ类(3份)可作为选育分枝型品种的候选群体。
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城步峒茶资源主要生化成分遗传多样性分析
《茶叶通讯 》 2019
摘要：为了深入研究湖南四大地方茶树群体资源之一的城步峒茶,从原产地收集筛选了17份有代表性的资源进行生化成分评价鉴定和遗传多样性分析.结果表明:17份资源生化成分存在丰富的多样性和变异,平均遗传多样性指数达2.34,平均变异系数达24.43%;多变量主成分分析,前4个主成分代表了17份资源生化成分多样性85.197%的信息;对17份资源15个生化成分进行聚类,可分为3大类群,第1大类群为红绿茶兼制的资源,第2大类群也是红绿茶兼制的资源,第3大类群为适制红茶的资源;并从中初步筛选出一批生化成分特异的资源,其中高茶多酚资源17份,高咖啡碱资源2份,高酯型儿茶素资源2份.
关键词： 城步峒茶 种质资源 生化成分 遗传多样性 主成分分析 聚类分析
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基于淀粉合成基因TRAP标记的甘薯种质资源遗传多样性分析
《湖南农业科学 》 2018
摘要：为探究淀粉合成相关基因在甘薯种质资源中的遗传多样性,通过对锚定引物的筛选构建了基于淀粉合成基因的TRAP分子标记技术,并对59份不同作用类型的甘薯种质资源进行遗传多样性分析。TRAP分子标记筛选结果表明:SAI/me2、AGPase/em4和β-Amylase/me2这3对引物组合在分子标记中存在较为丰富的多态性片段,结果重复性好,可作为TRAP分子标记;其中,AGPase/em4分子标记的区分能力最强,能将59份甘薯资源进行较好的区分。甘薯种质资源遗传多样性分析结果表明:不同类型的甘薯种质资源之间无明显的遗传群体区分。研究表明,甘薯基因组为六倍体起源,其淀粉合成相关基因存在多基因遗传作用,在不同甘薯种质资源之间存在一定的遗传差异,因而可以开发成有效的分子标记。
关键词： 甘薯 淀粉合成基因 遗传多样性 TRAP分子标记 聚类分析
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基于叶绿体rbcL和trnH-psbA序列的湖南茶树资源遗传多样性与亲缘关系研究
《热带作物学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：DNA序列分析在物种进化、亲缘关系、遗传多样性研究中得到了广泛应用。采用筛选的叶绿体rbc L序列和trn H-psb A序列对湖南新收集的26份茶树种质资源进行亲缘关系和遗传多样性分析。结果表明:扩增的序列在去除边缘不准确的部分后,分别获得了582 bp(rbc L)和426 bp(trn H-psb A)的片段序列,rbc L序列的变异位点共27个,占扩增位点数的5.15%,trn H-psb A序列的变异位点共134个,占扩增总位点数的31.46%。rbc L序列在26个参试材料中共产生17个单倍型,Hd和π分别为0.961和0.008 32,trn H-psb A序列共产生26个单倍型,Hd和π分别为0.998和0.046 79,收集的茶树资源具有较高的遗传多样性。采用MEGA 6.0软件按照UPGMA法分别对rbc L序列和trn H-psb A序列构建了分子系统树,各序列对参试材料的聚类结果有一定差异,rbc L序列和trn H-psb A序列在自展数值大于50%情况下分别将参试材料分为了3个类群和4个类群。参试资源除部分江华苦茶由于亲缘关系较近而聚在一起外,大部分资源都单独形成1个分支,彼此间亲缘关系较远。
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