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资源类型: 中文期刊
关键词:SSR(模糊匹配)
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椪柑二倍体种间杂交胚抢救及后代倍性鉴定

分子植物育种 2021 北大核心 CSCD

摘要:中国拥有丰富优质的地方柑橘良种,但由于种籽数较多,商品性不好。无核育种是地方柑橘品种改良的主要目标,主要通过二倍体和四倍体杂交获得三倍体。但柑橘四倍体品种有限,有报道表明柑橘二倍体和二倍体杂交可以获得三倍体,不仅节约培育四倍体的时间,还可以缩短育种周期。本研究利用胚抢救体系辅助流式细胞仪检测和SSR分子标记鉴定技术,提高柑橘二倍体和二倍体杂交后代获得多倍体的概率,为探究二倍体和二倍体大规模杂交获得多倍体提供技术支持。本研究采用3个柑橘二倍体花粉与湖南地方品种‘椪柑8306’进行种间杂交,利用未成熟的种子进行胚抢救获得再生植株,经流式细胞仪和气孔电镜检测鉴定植株倍性,利用SSR标记鉴定杂交后代基因型。结果显示,通过胚抢救技术对杂交后100 d的幼果中未成熟种子进行培养,共获得405株植株。移栽存活70株,通过流式细胞仪检测和电镜检测,发现获得多倍体13株,其中四倍体1株,三倍体12株,多倍体的诱导率达到18.57%。通过SSR分子标记和毛细管电泳检测,发现多倍体均为同源多倍体,且引物4可以很好地对亲本和子代的特异性进行区分。本研究建立柑橘二倍体和二倍体杂交获得多倍体的胚抢救技术体系和多倍体的早期鉴定体系,获得了一批多倍体新种质,这一技术体系对柑橘多倍体资源的育种具有重要意义。

关键词: 胚抢救 流式细胞仪检测 SSR 椪柑 多倍体

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基于农艺性状和SSR标记亲缘关系分析的江华苦茶品系评价

分子植物育种 2021 北大核心 CSCD

摘要:为选出适制红茶的品系,本研究对25个江华苦茶品系进行了叶长、叶宽、叶身、叶色、叶片着生状态、花蕊高低、叶形、PPO活性、水浸出物、茶多酚、氨基酸、咖啡碱、酚氨比和发酵性共14个农艺性状的统计和聚类分析和SSR分子标记的亲缘关系分析。结果表明:(1)叶长、叶宽、叶身、叶色、叶片着生状态、花蕊高低、叶型是生物学性状的主要因素,变异系数分别为15.46%、11.20%、19.79%、49.99%、50.68%、9.48%、24.62%;PPO活性、水浸出物、茶多酚、氨基酸、咖啡碱、酚氨比和发酵性是影响做红茶品质的重要因素,变异系数分别为7.81%、5.95%、11.87%、14.73%、9.91%、19.62%、13.55%,将25个品系分为3个大类4个亚类;(2)基于20个SSR标记的25个江华苦茶新品系的相似系数,其中,相似系数最大的为0.97,最小的为0.70,相似系数的平均值为0.76,25个品系的相似程度较高;基于SM相似系数的SAHN聚类结果显示,遗传背景相似的资源大都能聚在了一起,在相似系数平均值0.76处,将参试品系分成4个类群;(3)结合分子标记和性状数据分成的9个类群中,首先考虑发酵性,兼顾功能成分,最终选择A36-1、B13-1、B6-2、B17-2、B19-1、A24-2、B19-2、A3-1、A9-1、B1-1、A8-1,共11个优势红茶备选单株。

关键词: 江华苦茶 农艺性状 SSR 聚类分析 品种选育

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江华苦茶的亲缘关系与遗传多样性研究

茶叶通讯 2019

摘要:采用荧光SSR分子标记与cpDNA序列分析技术相结合的方法,对江华苦茶4个自然居群的32份资源进行遗传多样性、亲缘关系和遗传分化研究.结果表明:cpDNA变异率约为0.78%,分为5个单倍型,单倍型多样性为Hd=0.726,核苷酸多样性为 π=0.00233,遗传多样性较高;H3是基础的单倍型,H4和H5之间只有一个位点的差异,亲缘关系最近;居群遗传分化系数较高(FST=0.26019),基因流较低(Nm=0.71),cpDNA变异主要在居群内(89.29%),居群间遗传分化程度较低;中性检测和失配分析结果表明江华苦茶没有发生扩张事件.荧光SSR分子标记Ho、He和Nei分别为0.56、0.65和0.64,遗传多样性较高;3号和27号样品与其他样品相似度低于75%,4、8、13、16、17、20、21、31、32相互之间相似度高于85%,亲缘关系最近;群体间的遗传分化系数较小(FST=0.0971),基因流较高(Nm=2.3254),核基因遗传变异主要出现在居群内(90.98%),居群间遗传分化程度较低.

关键词: 江华苦茶 SSR cpDNA 遗传多样性 亲缘关系 遗传分化

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两个茄子品种纯度SSR鉴定与田间检测分析

分子植物育种 2018 北大核心 CSCD

摘要:为了鉴定国内大面积推广的两个茄子杂交品种早红茄1号和早红茄2号种子纯度,本研究运用SSR分子标记结合田间植株形态观察检测。结果发现,引物I30和K08均能在早红茄1号双亲本间扩增出差异互补的条带,引物M11能在早红茄2号双亲本间扩增出差异互补条带。基于引物筛选结果,利用引物K08和M11分别对2个品种进行鉴定,早红茄1号和早红茄2号纯度分别为95.3%和96.9%,与田间检测结果无显著差异(分别为95.8%和97.2%)。表明,SSR标记是一种准确、简单高效的茄子种子纯度鉴定方法。

关键词: 茄子 SSR 田间形态鉴定 种子纯度鉴定

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基于SSR标记的中籼型两系杂交水稻亲本遗传差异分析

杂交水稻 2017 北大核心 CSCD

摘要:利用48对SSR引物对50份中籼型两系杂交水稻骨干亲本或改良系进行了遗传多样性分析。结果表明,基于SSR分子标记的遗传聚类结果与供试材料的系谱关系高度一致,不育系和恢复系明显聚类为2个群组(Ⅰ和Ⅱ),2个群组内的平均遗传距离差异不明显。湖南隆平高科种业科学研究院有限公司选育的多数不育系材料聚合为不育系群组下的一个单独亚组(Ⅰ-4),且在4个不育系亚组中具有最大的组内平均遗传距离。华占衍生系和广东常规稻独立于9311衍生系或近缘系,且已明显分化为2个亚组(Ⅱ-2和Ⅱ-3)。华占衍生系或近缘系组存在一定程度的同质化问题,为进一步拓展此群组与湖南隆平高科种业科学研究院有限公司不育系群组之间的遗传距离,提高群组间的杂种优势水平,需继续引入华南优质、高抗、广适种质进行改良。

关键词: 两系杂交水稻 亲本 SSR 遗传差异

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基于SSR标记的中籼型两系杂交水稻亲本遗传差异分析(英文)

Agricultural Science & Technology 2017

摘要:利用48对SSR引物对50份中籼型两系杂交水稻骨干亲本或改良系进行了遗传多样性分析。结果表明,基于SSR分子标记的遗传聚类结果与供试材料的系谱关系高度一致,不育系和恢复系明显聚类为2个群组(I和II),2个群组内的平均遗传距离差异不明显。湖南隆平高科种业科学研究院有限公司选育的多数不育系材料聚合为不育系群组下的一个单独亚组(I-4),且在4个不育系亚组中具有最大的组内平均遗传距离。华占衍生系和广东常规稻独立于9311衍生系或近缘系,且已明显分化为2个亚组(II-2和II-3)。华占衍生系或近缘系组存在一定程度的同质化问题,为进一步拓展此群组与湖南隆平高科种业科学研究院有限公司不育系群组之间的遗传距离,提高群组间的杂种优势水平,需继续引入华南优质、高抗、广适种质进行改良。

关键词: 两系杂交水稻 亲本 SSR 遗传差异

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基于油菜F_1杂种种皮鉴别其母本的SSR检测方法及应用

中国农学通报 2015 CSCD

摘要:甘蓝型油菜杂交种中雄性不育母本假杂种是影响种子纯度的关键。为了探索一种能准确鉴定油菜杂交种中母本假杂种的方法,利用CTAB小样法分别提取油菜F1杂种种皮和幼苗的总DNA,进而筛选种皮与幼苗的SSR谱带存在差异的引物,并用于鉴别杂交种制种样品中母本基因型假杂种。结果表明:F1杂种种皮的SSR电泳谱带与其母本相同,利用筛选到的多态性SSR引物对2个国审品种的6份杂交制种样品中母本基因型假杂种鉴定的结果与田间单株鉴定吻合率达98%以上,说明利用F1杂种种皮与幼胚存在多态性的SSR标记鉴定杂交种的母本基因型假杂种是可靠的。该技术方法可以克服目前油菜杂交种SSR纯度鉴定对亲本的依赖,为种子生产、管理和经营部门种子纯度质量的有效监控提供技术参考。

关键词: 油菜 杂交种 种皮 SSR 母本

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利用SSR标记技术鉴定南瓜杂交种纯度的研究

分子植物育种 2014 CSCD

摘要:为研究SSR标记技术在南瓜杂交种纯度鉴定上的可行性,本研究利用选取的33对南瓜SSR引物,对2个中国南瓜杂交品种(大果蜜本与蜜宝)和2个中国南瓜杂交组合(P12与P13)的杂交种样品进行了纯度鉴定,并与田间形态鉴定结果进行了对比分析。研究结果表明,SSR鉴定与田间种植鉴定的结果差异在0.7%~1.8%之间,相关系数达到0.999,达到极显著相关水平,并进一步建立回归方程。本研究结果证实了SSR标记技术应用于南瓜杂交种纯度鉴定工作的可行性与可靠性,为南瓜杂交种纯度鉴定提供技术与理论支持。

关键词: 中国南瓜 杂交种 SSR 纯度鉴定

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基于SSR标记技术的油菜杂交品种沣油958的种子纯度鉴定

现代农业科技 2014

摘要:种子纯度是影响杂交油菜品种发挥杂种优势的重要因素。该研究利用SSR标记技术对国审杂交油菜新品种沣油958进行纯度鉴定,并与田间种植鉴定进行对比分析,结果表明:SSR鉴定与田间种植纯度鉴定结果非常接近,用SSR标记技术鉴定该品种纯度是可靠的。利用SSR标记进行纯度鉴定可以不受季节、鉴定人员经验影响,周期短,结果更为客观真实,是监控杂交油菜生产、销售的种子纯度质量的有效手段,在油菜杂交种纯度鉴定中具有明显的应用价值。

关键词: 油菜 SSR 沣油958 纯度鉴定

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茶树新品种“湘波绿2号”父本的SSR标记鉴定

茶叶通讯 2014

摘要:为在分子水平上鉴定"湘波绿2号"的父本,本研究采用SSR标记对其母本和5个可能父本进行了分析。结果表明,筛选的29对引物共检测到83个等位位点,每个引物1~4个,平均2.86个。湘波绿2号与福鼎大白茶及5个可能父本的相同位点数分别占其扩增总位点数的71.93%、64.91%、94.74%、66.67%、52.63%和70.18%,最多的为湘波绿,最少的为云大72-04。7份供试材料间相似系数变幅为0.45~0.80,平均0.55,其中湘波绿2号与湘波绿的相似系数最大(0.80)。根据相似系数UPGMA聚类,在相似系数0.55处将参试7份材料分为5类。参试材料的相似系数和亲缘关系树状图在分子水平上显示了湘波绿与湘波绿2号的亲缘关系最近,可能为湘波绿2号的父本。

关键词: 茶树 湘波绿2号 SSR 父本鉴定

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