科研产出
16个茶树品种(系)遗传多样性及遗传结构的SSR标记分析
《湖南农业科学 》 2011
摘要：利用32对SSR引物对湖南省茶叶研究所选育的16个茶树品种(系)进行了遗传多样性和遗传结构分析。结果表明:32对引物共检测到等位位点88个,每个引物为2～4个,平均2.75个;遗传多态性信息含量(PIC)在0.12～0.80之间,平均值为0.55。观测杂合度(Ho)在0.11～0.94之间,平均值为0.58;期望杂合度He大小在0.25～0.84之间,平均值为0.62;群体的Shannon指数最小为0.40,最大为1.88,平均值为1.11。湖南省茶叶研究所选育的茶树品种(系)间具有相对较高的遗传多样性。基于SSR数据以SAHN邻接法对供试品种(系)进行UPGMA遗传相似性聚类,并绘制树状聚类图,按相似系数为0.55可将参试的16份茶树品种(系)分为三大类。
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84个茶树品种遗传多样性及亲缘关系的SSR分析
《湖南农业大学学报(自然科学版) 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：利用33对多态性SSR引物对84个茶树品种进行亲缘关系和遗传多样性分析,并基于SSR数据,对供试品种进行UPGMA遗传相似性聚类分析。结果表明:参试品种具有较高的遗传多样性(共检测到94个等位位点,每个引物2～4个,平均2.85个;引物多态性信息含量为0.20～0.79,平均值为0.56;可观测等位位点数最多9个,最少3个,平均4.79个;杂合度观测值为0.08～0.97,平均值为0.53;杂合度期望值为0.14～0.86,平均值为0.62;群体内的Shannon指数平均值为1.17);聚类分析结果显示,阿萨姆茶等6个品种各自形成了单独的分支,其余78个品种聚成1个大类群,在相似系数0.54处,这个大类群又可分为6个亚类群。
关键词： 茶树 遗传多样性 亲缘关系 简单重复序列 非加权组平均法
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利用SSR分析普通野生稻自然居群交配系统
《中国水稻科学 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：采用SSR标记技术检测了6个自然居群的遗传多样性和交配系统参数,旨在了解其居群交配系统,为有效原位保护、异位保存提供指导。结果表明,6个居群遗传多样性水平存在差异(基因多样性指数变幅为0.3166～0.6075),居群间分化明显(Fst=0.4220)。广东高州大岭居群和广东高州朋山居群有过剩的杂合子(F<0),而另外4个居群有过剩的纯合体(F>0)。普通野生稻6个取样居群交配系统为混合交配类型,居群之间的异交率相差较大(多位点异交率变幅为15.1%～41.8%,单位点异交率变幅为10.1%～28.5%)。6个居群的多位点异交率都高于单位点异交率,而且位点亲本相关度比较大,说明居群内存在一定程度的近交。同时,各居群单位点相关度与多位点相关度差值较大,表明居群内存在亚结构。还讨论了进一步改善普通野生稻原位和异位保护的措施。
关键词： 普通野生稻 交配系统 原位保护 异位保存 遗传多样性 简单重复序列 保育生物学
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莲藕腐败病病原菌致病性及遗传差异性的研究
《长江蔬菜 》 2010
摘要：对采自湖南省不同地区的莲藕腐败病病原菌进行了藕块菌丝块和菌丝体接种、藕叶菌丝块和孢子悬浮液喷雾等人工接种,以测定其致病性。试验结果表明,用病原菌菌丝块对嫩藕藕块进行接种发病率最高,发病最重,可作为室内莲藕抗腐败病品种筛选、病原菌致病性室内测定的首选接种方法。试验结果还表明,来源于非莲藕寄主的镰刀菌对莲藕具有一定的侵染性,使莲藕呈现典型的腐败病症状。此外,应用RAPD分子标记技术对供试镰刀菌菌株进行遗传多样性分析,UPGMA聚类分析显示:供试菌株间存在着一定的遗传差异性。
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“黄金茶”特异种质资源遗传多样性和亲缘关系的ISSR分析
《茶叶科学 》 2010 北大核心 CSCD
摘要：利用ISSR分子标记对珍稀地方种质资源"黄金茶"的110个株系进行遗传多样性和亲缘关系分析。从100条ISSR引物中筛选出18条多态性高、重复性好的引物,分别对供试材料的基因组进行扩增,共获得205条清晰可辨的谱带,其中多态性带187条,多态性比率达91.22%,反映了黄金茶群体基因组DNA多态性较高。110个黄金茶株系的平均有效等位基因数为1.51,平均Nei’s基因多样性指数为0.30,平均Shannon信息指数为0.45,说明黄金茶群体的遗传多样性较高。110个黄金茶株系间的Jaccard相似系数在0.22~1.00之间,平均值为0.55。根据相似系数平均值,用UPGMA法将供试的110个株系分成七大类群,并绘制ISSR聚类树状图,揭示了黄金茶群体各株系之间的亲缘关系。该研究为今后加强对黄金茶特异种质资源的保护和利用、优良品种的选育及杂交亲本的选配等从分子水平上提供了一定的参考依据。
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利用RAPD和ISSR标记分析青麻种质遗传多样性
《植物遗传资源学报 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：利用RAPD和ISSR分子标记检测来自全国11个省(市)的48份青麻种质资源的遗传多样性,为青麻资源利用和育种提供分子生物学依据。在48份青麻种质资源中,17条RAPD引物扩增出191条带,多态条带比率为87.43%;9条ISSR引物扩增出82条带,多态条带比率为88.89%,扩增产物片段大小都在0.1～3.0kb之间。两种分子标记的结果呈显著正相关(r=0.80)。基于UPGMA聚类,野生种和栽培种各自聚为相应的类别。
利用EST-SSR标记研究黄金茶群体遗传多样性及遗传分化
《茶叶科学 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：利用19对茶树EST-SSR引物对黄金茶群体的38个单株进行了遗传多样性和亲缘关系分析。19对引物共检测到等位位点37个,每个引物1~3个,平均1.95个;期望杂合度(He)在0.03~0.65之间,平均值0.32;观测杂合度(Ho)在0~0.97之间,平均值0.33;群体内的Shannon指数0.55。以上结果均说明黄金茶群体的遗传多样性较低。基于EST-SSR数据以SAHN邻接法对供试种质资源进行UPGMA遗传相似性聚类,并绘制树状聚类图,按相似系数0.77可将参试的38份种质资源分为六大类。根据不同单株间的相似系数可为黄金茶群体的遗传改良提供一定参考。同时,AMOVA分析表明,黄金茶群体的遗传变异21.77%发生在种群间,78.23%发生于单株间,不同区域的种群间基因流为1.80,这可以为黄金茶群体的保护提供一定理论依据。
关键词： 茶树 黄金茶群体 EST-SSR 遗传多样性 亲缘关系
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应用SSR和ISSR标记分析非AA型野生稻资源的遗传多样性
《湖南农业科学 》 2008 CSCD
摘要：利用SSR、ISSR标记分析了24份非AA型野生稻及4份AA型对照的遗传多样性。结果表明,11对SSR引物共检测到104个多态性片段,平均每个引物扩增多态性片段9.5个。非AA型野生稻的特异性片段74个,占总片段数的71.2%;8个ISSR引物共检测到166个多态性片段,平均每个引物扩增多态性片段20.8个。非AA型野生稻的特异性片段113个,占总片段数的68.7%。两种标记构建的亲缘关系树基本相似。非AA型野生稻遗传多样性丰富,且具有很多独特的性状,可以为水稻育种提供丰富的种质资源。
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普通野生稻保护和未保护居群遗传多样性的比较
《植物遗传资源学报 》 2007 CSCD
摘要：为了评价普通野生稻自然居群遗传多样性,用24对SSR引物对5个保护居群(江西东乡庵家山JXD、湖南茶陵HNC、湖南江永HNJ、广东高州大岭GDD、海南儋州HND)和3个未保护居群(广西武宣GXW、广西来宾GXL、广东高州朋山GDP),共计356个单株进行了遗传多样性分析。24个位点均表现为多态,其中18个位点表现杂合子不足,RM339位点观察杂合度最高,RM336位点预期杂合度最高。SSR分析结果表明,8个居群的遗传多样性都较高,其中5个保护居群的Ae变幅为1.780(JXD)~2.504(HNJ),He变幅为0.397(JXD)~0.555(HNJ);3个未保护居群Ae变幅为2.153(GDP)~3.226(GXL),He变幅为0.492(GDP)~0.640(GXL)。5个保护居群与3个未保护居群之间的遗传距离较大(0.6585)。这说明虽然有些居群得到了保护,但未保护居群的保护、收集价值仍然很大。居群间遗传分化明显(Fst=0.399),居群间遗传距离最小的HNJ居群与GXL居群的相似系数也只有0.43。F-统计显示所用居群都偏离了Hardy-W e inbery平衡(F is=0.147),其中GDD、GDP、HND居群F is<0,表现为杂合子过剩;居群JXD的F is为0.109,表现轻微的杂合子缺乏;HNC、HNJ、GXW、GXL的F is>0,F is值变幅为0.315(GXW)~0.473(HNJ),说明这4个居群中杂合子不足,可能与这些居群自交比例高有关。
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