科研产出
利用EST-SSR标记研究黄金茶群体遗传多样性及遗传分化
《茶叶科学 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：利用19对茶树EST-SSR引物对黄金茶群体的38个单株进行了遗传多样性和亲缘关系分析。19对引物共检测到等位位点37个,每个引物1~3个,平均1.95个;期望杂合度(He)在0.03~0.65之间,平均值0.32;观测杂合度(Ho)在0~0.97之间,平均值0.33;群体内的Shannon指数0.55。以上结果均说明黄金茶群体的遗传多样性较低。基于EST-SSR数据以SAHN邻接法对供试种质资源进行UPGMA遗传相似性聚类,并绘制树状聚类图,按相似系数0.77可将参试的38份种质资源分为六大类。根据不同单株间的相似系数可为黄金茶群体的遗传改良提供一定参考。同时,AMOVA分析表明,黄金茶群体的遗传变异21.77%发生在种群间,78.23%发生于单株间,不同区域的种群间基因流为1.80,这可以为黄金茶群体的保护提供一定理论依据。
关键词： 茶树 黄金茶群体 EST-SSR 遗传多样性 亲缘关系
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应用SSR和ISSR标记分析非AA型野生稻资源的遗传多样性
《湖南农业科学 》 2008 CSCD
摘要：利用SSR、ISSR标记分析了24份非AA型野生稻及4份AA型对照的遗传多样性。结果表明,11对SSR引物共检测到104个多态性片段,平均每个引物扩增多态性片段9.5个。非AA型野生稻的特异性片段74个,占总片段数的71.2%;8个ISSR引物共检测到166个多态性片段,平均每个引物扩增多态性片段20.8个。非AA型野生稻的特异性片段113个,占总片段数的68.7%。两种标记构建的亲缘关系树基本相似。非AA型野生稻遗传多样性丰富,且具有很多独特的性状,可以为水稻育种提供丰富的种质资源。
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普通野生稻保护和未保护居群遗传多样性的比较
《植物遗传资源学报 》 2007 CSCD
摘要：为了评价普通野生稻自然居群遗传多样性,用24对SSR引物对5个保护居群(江西东乡庵家山JXD、湖南茶陵HNC、湖南江永HNJ、广东高州大岭GDD、海南儋州HND)和3个未保护居群(广西武宣GXW、广西来宾GXL、广东高州朋山GDP),共计356个单株进行了遗传多样性分析。24个位点均表现为多态,其中18个位点表现杂合子不足,RM339位点观察杂合度最高,RM336位点预期杂合度最高。SSR分析结果表明,8个居群的遗传多样性都较高,其中5个保护居群的Ae变幅为1.780(JXD)~2.504(HNJ),He变幅为0.397(JXD)~0.555(HNJ);3个未保护居群Ae变幅为2.153(GDP)~3.226(GXL),He变幅为0.492(GDP)~0.640(GXL)。5个保护居群与3个未保护居群之间的遗传距离较大(0.6585)。这说明虽然有些居群得到了保护,但未保护居群的保护、收集价值仍然很大。居群间遗传分化明显(Fst=0.399),居群间遗传距离最小的HNJ居群与GXL居群的相似系数也只有0.43。F-统计显示所用居群都偏离了Hardy-W e inbery平衡(F is=0.147),其中GDD、GDP、HND居群F is<0,表现为杂合子过剩;居群JXD的F is为0.109,表现轻微的杂合子缺乏;HNC、HNJ、GXW、GXL的F is>0,F is值变幅为0.315(GXW)~0.473(HNJ),说明这4个居群中杂合子不足,可能与这些居群自交比例高有关。
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3种黄鳝遗传多样性分析
《湖南农业大学学报(自然科学版) 》 2004 北大核心 CSCD
摘要：为更好地保护和开发利用黄鳝资源,从40个随机引物中选取30个重复性好、扩增稳定的随机引物,应用RAPD技术对黄鳝属中产自缅甸的山黄鳝、印度尼西亚的穴黄鳝、中国黄鳝的DNA进行遗传多样性分析.共检测到315个位点,3种黄鳝种群间的多态位点比例为85.08%,遗传多样性指数为0.157 5.DPS2003种群遗传分析软件包分析显示,3种黄鳝种群间的遗传距离为0.710 3, 相似度系数为0.289 7,表明3种黄鳝都具有较高的遗传变异.
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湖南烟溪病圃稻瘟病菌的有性态及微卫星标记的遗传多样性分析
《中国水稻科学 》 2004 北大核心 CSCD
摘要：用 2对稻瘟病菌的两性能育菌株 (交配型 1.1和交配型 1.2 )测定了来自湖南烟溪病圃上的 4年 12 4个稻瘟病菌株的交配型 ,用微卫星分子标记分析其中 10 5个菌株的遗传多样性及其亲缘关系。12 4个菌株中 ,2 8个为交配型 1.1,39个为交配型 1.2 ,5 7个不育 ,分别占供试菌株的 2 2 .5 8%、31.4 5 %和 4 5 .97% ;在 0 .6 7相似性的基础上 ,7对微卫星引物扩增出的标记可将 10 5个菌株区分为 6个系谱群。
湖南两类稻瘟病生态系病菌群体遗传多样性研究
《湖南农业大学学报(自然科学版) 》 2003 北大核心 CSCD
摘要：从湖南山区和丘陵区两类稻瘟病生态系中的60个水稻品种上采集稻瘟病标样,经单孢分离获得103个菌株.采用Pot2-PCR指纹分析,结果表明,稻瘟病山区和丘陵区生态系病菌群体都具有明显的遗传多样性,山区病菌群体遗传组成比丘陵区更为复杂,且两类生态系的稻瘟病菌群体内都存在较大的异质性和变异潜能.
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