科研产出
基于EST-SSR的祁门种群体遗传多样性和亲缘关系分析
《茶叶科学 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：利用24对EST-SSR引物对祁门种群体66个单株和安徽1号进行遗传多样性和亲缘关系分析。结果表明:祁门种群体具有相对较高的遗传多样性,24对引物共检测到等位位点69个,平均2.88个;引物多态性含量PIC为0.18~0.85,平均值为0.47;杂合度观测值(Ho)在0.09~0.96之间,平均值为0.41;杂合度期望值(He)在0.23~0.76之间,平均值为0.50;群体内的Shannon指数I为0.39~1.50,平均0.89。根据相似系数矩阵按UPGMA法进行聚类,在相似系数平均值0.50处可将参试的67份材料划分为六大类,其中第Ⅰ类含有44个祁门种群体单株及安徽1号,占总数的67.16%,是祁门种的核心类群。
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利用简单重复序列(SSR)标记分析太湖稻区现代粳稻品种的遗传多样性
《农业生物技术学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：太湖地区有丰富的粳稻(Oryza satiua ssp.japonica)种植资源,随着品种大面积推广应用,育种材料的遗传基础趋窄,相似性增高,使粳稻育种突破困难。本研究利用分布于水稻(Oryza satiua L.)12条染色体上的24对简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)引物对太湖地区的42份粳稻品种进行遗传多样性分析。结果表明,有23对SSR引物在42份粳稻材料间表现出多态性;23对引物共检测到105个等位基因,每对SSR引物检测到等位基因为2~8个,平均为4.57个,有效等位基因共有56.43个,平均每个位点为2.45个。每个多态位点的多态信息含量(polymorphism information content,PIC)变幅为0.083 0~0.8079,平均为0.496 6;每个粳稻材料多态性位点数的变幅为6~19,等位基因总数的变幅为27~55;42份粳稻品种间的遗传相似系数变幅为0.391~0.990,平均为0.610,遗传相似系数在0.50~0.80之间的材料占全部的74.45%,供试材料相似度高;非加权配对算术平均法(unweighed pair group method with arithmetic mean;UPGMA)聚类结果显示,遗传相似系数为0.50,42份粳稻材料可以分为两个类群,一个类群包含19份常规粳稻,另一个类群包括其他23份杂交粳稻。结果显示,太湖地区的粳稻品种总体上遗传背景相似度高,遗传多样性不够丰富,育种工作有待进一步加强新的基因资源引进和利用,创新水稻育种材料。本研究结果为新品种选育提供技术支持和理论根据。
关键词： 粳稻 简单重复序列(SSR)标记 遗传多样性
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辣椒种质遗传多样性的EST-SSR分析
《植物遗传资源学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：辣椒(Capsicum annuum L.)是一种重要的蔬菜作物,分析辣椒种质的遗传多样性对于辣椒种质的收集、鉴定和利用都有重要的意义。EST-SSR标记是一种位于转录区的SSR标记,能够检测出转录区的多态性,进而能够反映出种质之间真实的遗传多样性。本研究利用33个EST-SSR标记分析了31份辣椒种质的遗传多样性。EST-SSR标记在测试的辣椒种质上共检测出91个等位基因,平均每个位点扩增出2.76个等位基因,最多扩增出6个等位基因,多态性信息含量(PIC)最小为0.03,最大为0.74,平均为0.38。系统聚类分析将31份种质分为2大类,聚类结果表现出了一定程度的与果实性状的相关性。主坐标分析的结果基本上与聚类分析的结果一致,但更加详细地表现了辣椒种质之间的遗传变异。
关键词： 辣椒 遗传多样性 EST-SSR 聚类分析 主坐标分析
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湖南柚类资源及近缘种的SRAP遗传多样性分析
《湖南农业科学 》 2013
摘要：利用SRAP标记研究了46份湖南柚类地方种质资源及近缘种的遗传多样性与亲缘关系。结果表明:17对SRAP引物组合从供试材料中共检测出283条扩增带,平均每对引物组合可检测到16.6条;其中多态性条带235条,多态性比例83.0%;基因多态性信息量(PIC)变幅为0.431 7~0.770 0,平均为0.544 3;获得了22个SRAP特异性标记。UPGMA聚类结果显示,46份柚类资源及近缘种在欧式遗传距离0.795时分成7个组群,其中40份柚类品种被归类为5个组群,主要由沙田柚品种群、文旦柚品种群和杂种柚品种群组成,聚类结果呈现出明显的地域生态特征。
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湖南柚种质资源的遗传多样性和亲缘关系
《湖南农业大学学报(自然科学版) 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：采用形态学标记与序列相关扩增多态性(SRAP)分子标记技术,对分布于湖南特定生态条件下的47份地方柚类种质资源的遗传多样性及亲缘关系进行分析。结果表明:①根据花与果实性状等形态学标记进行聚类分析,在欧式遗传距离10处可将柚类资源分为6个组群;②基于柚资源的SRAP分子标记进行分析,47份地方柚资源间的遗传相似系数为0.65～0.93,在相似系数0.798处可分为7个组群;③SRAP标记扩增结果表明,17对引物共扩增出319条带,其中275条带具有多态性,平均每对引物扩增出多态性带16.2条,多态性比率86.52%,基因多样度0.724 3,表明湖南柚类品种间具有丰富的遗传多样性;④将形态学标记聚类结果与SRAP分子标记聚类结果进行比较,发现二者都能很好地将柚类品种进行分类,SRAP标记不受环境因素影响,所揭示的柚类种质间的遗传差异更准确。综合以上结果,利用SRAP标记产生的特异性遗传标记可以区别大部分湖南地方柚类种质资源。
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甘蓝型油菜自交系的SSR遗传多样性分析
《湖南农业科学 》 2012
摘要：利用SSR标记对16份甘蓝型油菜自交系进行遗传多样性分析。结果表明:34对引物共扩增出72条清晰的谱带,片段长度在100～650 bp之间,引物PIC值介于0.12～0.73之间,平均为0.39;供试材料间的遗传相似系数在0.52～0.90之间,平均为0.63,其中pol-CMS恢复系间的遗传差异较大,pol-CMS不育系间与温敏核不育系间的差异较小;在遗传相似系数0.685处可将供试材料分为3个类群,聚类结果与已知的系谱来源基本一致。
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镰刀菌属遗传多样性的ISSR分析
《长江蔬菜 》 2012
摘要：对运用分子生物学手段研究镰刀菌属的遗传多样性进展进行了综述,并对ISSR分子标记技术在镰刀菌属遗传多样性方面的应用前景作出了分析与展望。
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基于EST-SSR标记的云南无性系茶树良种遗传多样性分析及指纹图谱构建
《茶叶科学 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：分析茶树品种遗传多样性和构建茶树品种分子指纹图谱对茶树育种、品种鉴别、品种权益保护、苗木纯度检测等具有重要意义。利用SSR标记对28份无性系茶树品种遗传多样性和指纹图谱进行了研究。22对引物共检测到等位位点56个,平均每对引物产生2.55个;共检测到97个基因型,平均每对引物所扩增的基因型有4.41个,遗传多态性信息含量为0.279~0.709,平均0.527,表明SSR标记具有较高的多态性。品种间的遗传相似系数为0.642~0.973之间,平均为0.797,表明品种间的遗传差异较小,遗传多样性较低,遗传基础较窄。根据SSR标记特点,将SSR引物扩增统计的"0"、"1"转换成基因型,通过不同基因型组合,构建了云南无性系茶树品种的分子指纹图谱,使每个品种都获得了1个22位数的指纹图谱号码,进而可将不同品种完全区分鉴别。
湖南甘薯品种遗传多样性的SSR分析
《湖南农业科学 》 2011
摘要：利用SSR分子标记对来自湖南31份甘薯品种进行遗传多样性分析,探讨了湖南甘薯地方品种与育成品种之间的遗传多样性。结果表明:12对SSR引物扩增出74个等位基因位点,平均每对引物获得6个等位基因位点。湖南甘薯育成品种间遗传距离为0.272 7～0.894 7,平均0.511 5;湖南甘薯地方品种间遗传距离为0.288 1～0.814 8,平均0.524 0;湖南甘薯育成品种与地方品种间遗传距离为0.288 1～0.703 7,平均0.516 7。表明湖南甘薯品种遗传多样性丰富。
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