科研产出
湖南省柚类种质资源的花粉形态研究
《园艺学报 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：应用扫描电镜观察了湖南省47份柚类和5份其他柑橘类的花粉形态,统计了花粉表型性状,结果表明其花粉形态具有十分丰富的多样性。花粉大小和形状差异很大,最大花粉的体积(极轴长×赤道轴长)是最小的2.04倍,大部分材料的花粉为椭球形。除道县野橘花粉表面沟壑满布,无明显网眼和网脊外,其他材料的花粉均呈网状分布,网眼近圆形,大小不一,不同材料的网眼大小和分布密度存在较大差异。除山下红温州蜜柑的花粉多为瘪粒,不易观察外,其他材料的花粉大部分具有4条萌发沟,少数有5条萌发沟,萌发沟沿极轴方向以等距环状分布,沟长直达两极。花粉为长椭球形的材料多为酸柚、酸橙或柠檬等酸度较高的类型,其网眼较大,网脊较宽,萌发孔多嵌在萌发沟内,不太明显;反之亦然。按照花粉表型性状对52份材料进行了聚类分析,在遗传距离1.2处大致分为5个组群。讨论了花粉形态对于湖南省地方柚类分类和遗传多样性研究的参考价值。
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湖南省草莓灰霉病菌遗传多样性研究
《中国蔬菜 》 2016 北大核心
摘要：为探明湖南省草莓灰霉病菌群体遗传结构、分化及变异规律,采用荧光标记技术对湖南省9个地理菌群的180株草莓灰霉病菌基因组DNA进行SSR分析。结果表明:9对SSR引物共检测到56个观察等位基因(Na),平均值为6.22;有效等位基因(Ne)为1.27~4.89,平均值为3.44;不同位点的基因多样性指数(H)为0.21~0.80,平均值为0.65;不同位点Shannon’s信息指数(I)为0.37~1.83,平均值为1.34。供试180株样品9个SSR多态性位点上多态性信息量PIC变化范围为0.13~0.91,不同位点PIC差异大,这一规律与I和H基本一致。不同SSR位点总的遗传多样性(Ht)为0.21~0.77,平均值为0.65;群内遗传多样性(Hs)为0.19~0.50,平均值为0.40;遗传分化系数(Gst)为0.10~0.46,平均值为0.37;基因流(Nm)为0.58~4.47,平均值为1.16。不同地理菌群平均观察等位基因(Na)、有效等位基因数目(Ne)分别为2.93和2.07,Shannon’s信息指数(I)平均为0.67,基因多样性指数(H)平均为0.40,平均多态性位点数(NP)、多态位点百分率(P)分别为6.78和75%。依据不同地理菌群之间的遗传距离(0.2797~1.9225),将供试湖南省9个地理菌群分为4大类:第Ⅰ大类主要由长沙、邵阳、岳阳、衡阳、张家界、湘潭种群组成;第Ⅱ大类主要由郴州种群组成;第Ⅲ大类主要由株洲种群组成;第Ⅳ大类由常德种群组成。总之,湖南省各地草莓灰霉病菌群体遗传多样性丰富,但地理群体间差异小,病菌遗传变异主要来自群体内部,不同地区间存在病菌的移动。
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湖南地方柚资源及其近缘种多样性的SRAP分子评价
《湖南农业大学学报(自然科学版) 》 2016 北大核心 CSCD
摘要：以湖南本地柚类资源为试材,应用SRAP标记对41份柚类资源及5份近缘种的遗传多样性进行分析与鉴定。结果表明:平均每个引物组合可扩增出16.6条谱带,17对SRAP引物共扩增出283条谱带,其中多态性谱带235条,多态率为83.0%,基因多样度变幅为0.431 7~0.770 0,平均基因多样度为0.544 3;获得了21个基因型的37个SRAP特异性标记,不同引物组合可将42个基因型完全分开;柚类及近缘种等位基因平均数、平均杂合位点占比、SRAP表型杂合度(H0)分别为9.02、67.77%和0.343。聚类分析结果显示,41份柚种质及5份近缘种材料在遗传相似系数0.792处可分为6个组群:第1、2组群分别由24个和11个柚的地方品种构成;第3组群为柚的种间杂种类型,包括菠萝香柚、慈利金香柚、慈利甜柚2号和慈利水柚子;第4组群由慈利柚09–1、金瓜两杂种柚和酸橙、臭皮柑两近缘种组成;第5组群包括无核大红甜橙和温州蜜柑;第6组群为柠檬。综合SRAP标记结果与形态特征分析,认为慈利金香柚可能源于以柚类为母本、以橙类(或宽皮橘类)为父本的自然种间杂交后代。
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基于EST-SSR的祁门种群体遗传多样性和亲缘关系分析
《茶叶科学 》 2015 北大核心 CSCD
摘要：利用24对EST-SSR引物对祁门种群体66个单株和安徽1号进行遗传多样性和亲缘关系分析。结果表明:祁门种群体具有相对较高的遗传多样性,24对引物共检测到等位位点69个,平均2.88个;引物多态性含量PIC为0.18~0.85,平均值为0.47;杂合度观测值(Ho)在0.09~0.96之间,平均值为0.41;杂合度期望值(He)在0.23~0.76之间,平均值为0.50;群体内的Shannon指数I为0.39~1.50,平均0.89。根据相似系数矩阵按UPGMA法进行聚类,在相似系数平均值0.50处可将参试的67份材料划分为六大类,其中第Ⅰ类含有44个祁门种群体单株及安徽1号,占总数的67.16%,是祁门种的核心类群。
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利用简单重复序列(SSR)标记分析太湖稻区现代粳稻品种的遗传多样性
《农业生物技术学报 》 2014 北大核心 CSCD
摘要：太湖地区有丰富的粳稻(Oryza satiua ssp.japonica)种植资源,随着品种大面积推广应用,育种材料的遗传基础趋窄,相似性增高,使粳稻育种突破困难。本研究利用分布于水稻(Oryza satiua L.)12条染色体上的24对简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)引物对太湖地区的42份粳稻品种进行遗传多样性分析。结果表明,有23对SSR引物在42份粳稻材料间表现出多态性;23对引物共检测到105个等位基因,每对SSR引物检测到等位基因为2~8个,平均为4.57个,有效等位基因共有56.43个,平均每个位点为2.45个。每个多态位点的多态信息含量(polymorphism information content,PIC)变幅为0.083 0~0.8079,平均为0.496 6;每个粳稻材料多态性位点数的变幅为6~19,等位基因总数的变幅为27~55;42份粳稻品种间的遗传相似系数变幅为0.391~0.990,平均为0.610,遗传相似系数在0.50~0.80之间的材料占全部的74.45%,供试材料相似度高;非加权配对算术平均法(unweighed pair group method with arithmetic mean;UPGMA)聚类结果显示,遗传相似系数为0.50,42份粳稻材料可以分为两个类群,一个类群包含19份常规粳稻,另一个类群包括其他23份杂交粳稻。结果显示,太湖地区的粳稻品种总体上遗传背景相似度高,遗传多样性不够丰富,育种工作有待进一步加强新的基因资源引进和利用,创新水稻育种材料。本研究结果为新品种选育提供技术支持和理论根据。
关键词： 粳稻 简单重复序列(SSR)标记 遗传多样性
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湖南柚种质资源的遗传多样性和亲缘关系
《湖南农业大学学报(自然科学版) 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：采用形态学标记与序列相关扩增多态性(SRAP)分子标记技术,对分布于湖南特定生态条件下的47份地方柚类种质资源的遗传多样性及亲缘关系进行分析。结果表明:①根据花与果实性状等形态学标记进行聚类分析,在欧式遗传距离10处可将柚类资源分为6个组群;②基于柚资源的SRAP分子标记进行分析,47份地方柚资源间的遗传相似系数为0.65～0.93,在相似系数0.798处可分为7个组群;③SRAP标记扩增结果表明,17对引物共扩增出319条带,其中275条带具有多态性,平均每对引物扩增出多态性带16.2条,多态性比率86.52%,基因多样度0.724 3,表明湖南柚类品种间具有丰富的遗传多样性;④将形态学标记聚类结果与SRAP分子标记聚类结果进行比较,发现二者都能很好地将柚类品种进行分类,SRAP标记不受环境因素影响,所揭示的柚类种质间的遗传差异更准确。综合以上结果,利用SRAP标记产生的特异性遗传标记可以区别大部分湖南地方柚类种质资源。
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湖南柚类资源及近缘种的SRAP遗传多样性分析
《湖南农业科学 》 2013
摘要：利用SRAP标记研究了46份湖南柚类地方种质资源及近缘种的遗传多样性与亲缘关系。结果表明:17对SRAP引物组合从供试材料中共检测出283条扩增带,平均每对引物组合可检测到16.6条;其中多态性条带235条,多态性比例83.0%;基因多态性信息量(PIC)变幅为0.431 7~0.770 0,平均为0.544 3;获得了22个SRAP特异性标记。UPGMA聚类结果显示,46份柚类资源及近缘种在欧式遗传距离0.795时分成7个组群,其中40份柚类品种被归类为5个组群,主要由沙田柚品种群、文旦柚品种群和杂种柚品种群组成,聚类结果呈现出明显的地域生态特征。
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辣椒种质遗传多样性的EST-SSR分析
《植物遗传资源学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：辣椒(Capsicum annuum L.)是一种重要的蔬菜作物,分析辣椒种质的遗传多样性对于辣椒种质的收集、鉴定和利用都有重要的意义。EST-SSR标记是一种位于转录区的SSR标记,能够检测出转录区的多态性,进而能够反映出种质之间真实的遗传多样性。本研究利用33个EST-SSR标记分析了31份辣椒种质的遗传多样性。EST-SSR标记在测试的辣椒种质上共检测出91个等位基因,平均每个位点扩增出2.76个等位基因,最多扩增出6个等位基因,多态性信息含量(PIC)最小为0.03,最大为0.74,平均为0.38。系统聚类分析将31份种质分为2大类,聚类结果表现出了一定程度的与果实性状的相关性。主坐标分析的结果基本上与聚类分析的结果一致,但更加详细地表现了辣椒种质之间的遗传变异。
关键词： 辣椒 遗传多样性 EST-SSR 聚类分析 主坐标分析
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甘蓝型油菜自交系的SSR遗传多样性分析
《湖南农业科学 》 2012
摘要：利用SSR标记对16份甘蓝型油菜自交系进行遗传多样性分析。结果表明:34对引物共扩增出72条清晰的谱带,片段长度在100～650 bp之间,引物PIC值介于0.12～0.73之间,平均为0.39;供试材料间的遗传相似系数在0.52～0.90之间,平均为0.63,其中pol-CMS恢复系间的遗传差异较大,pol-CMS不育系间与温敏核不育系间的差异较小;在遗传相似系数0.685处可将供试材料分为3个类群,聚类结果与已知的系谱来源基本一致。
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