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基于EST-SSR的祁门种群体遗传多样性和亲缘关系分析

文献类型： 中文期刊

作者： 雷雨 1 ; 段继华 1 ; 罗意 1 ; 黄飞毅 1 ; 董丽娟 1 ;

作者机构： 1.湖南省茶叶研究所国家茶树改良中心湖南分中心

关键词： 祁门种群体;EST-SSR;遗传多样性;亲缘关系

期刊名称： 茶叶科学

ISSN： 1000-369X

年卷期： 2015 年 04 期

页码： 329-335

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用24对EST-SSR引物对祁门种群体66个单株和安徽1号进行遗传多样性和亲缘关系分析。结果表明:祁门种群体具有相对较高的遗传多样性,24对引物共检测到等位位点69个,平均2.88个;引物多态性含量PIC为0.18~0.85,平均值为0.47;杂合度观测值(Ho)在0.09~0.96之间,平均值为0.41;杂合度期望值(He)在0.23~0.76之间,平均值为0.50;群体内的Shannon指数I为0.39~1.50,平均0.89。根据相似系数矩阵按UPGMA法进行聚类,在相似系数平均值0.50处可将参试的67份材料划分为六大类,其中第Ⅰ类含有44个祁门种群体单株及安徽1号,占总数的67.16%,是祁门种的核心类群。

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