科研产出
烟草花叶病毒山西番茄分离物的全基因组序列测定及分析
《中国蔬菜 》 2017 北大核心
摘要:为明确山西省晋中市侵染番茄的病毒种类,采用双链RNA(double-stranded RNA,ds RNA)技术和非序列依赖PCR扩增(sequence-independent amplification,SIA)方法对感病番茄进行分子鉴定。序列测定及分析发现,具有花叶、卷曲症状的番茄为烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)所侵染。进一步克隆TMV番茄分离物(TMV-SXFQ)的全基因组序列,得到TMV-SXFQ(Gen Bank登录号为JX993906)全长为6 394 bp,含4个开放阅读框(open reading frame,ORF)。序列比对分析表明,TMV-SXFQ与烟草花叶病毒属其他分离物的同源性为86.3%~99.6%;系统进化分析表明,TMV-SXFQ与韩国分离物IM聚为一簇、亲缘关系最近。
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茯砖茶"金花"菌的分离、鉴定及转化葛根产物研究
《茶叶科学 》 2016 CSCD
摘要:为研究茯砖茶中“金花”菌是否能在葛根上生长,并进行生物转化,得到活性更高的发酵产物。从茯 砖茶中分离出一株优势菌株 LS1,并进行鉴定;以野葛、粉葛、葛渣为底物进行固体发酵,以 DPPH 自由基 清除法比较发酵前后产物抗氧化活性,并测定了总黄酮含量及采用高效液相色谱法检测葛根素质量浓度。结 果表明,LS1 经形态学观察及 ITS-5.8S rDNA 序列分析,鉴定为冠突散囊菌 Eurotium cristatum,GenBank 登录 号为 KR812327;野葛、粉葛、葛渣固体发酵后总黄酮和葛根素含量分别提高了 15.97%、12.33%、20.69%和 20.48%、7%、20.29%。
山西西葫芦花叶病病原鉴定与部分序列分析
《山西农业大学学报(自然科学版) 》 2016
摘要:利用双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)技术和非序列依赖PCR扩增(sequence-independent amplification,SIA)方法对感病西葫芦进行了分子鉴定。序列测定及分析发现,具有明显花叶和斑驳症状的西葫芦受到黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)的侵染。为进一步明确黄瓜花叶病毒山西西葫芦分离物(CMV-XHL)的分类地位,克隆了CMV-XHL RNA3的外壳蛋白和移动蛋白基因全序列。通过序列比对分析,发现CMV-XHL CP核苷酸序列和氨基酸序列与CMV亚组ⅠB中CMV烟草分离物(CMV-SG)的相似性最高,分别为98.6%和99.5%;MP核苷酸序列和氨基酸序列与CMV亚组Ⅰ分离物的相似性最高,为93.2%~94.6%。MP和CP氨基酸序列系统进化分析表明,CMV-XHL与中国大多数CMV分离物聚为一类,属于CMV亚组Ⅰ中的成员。研究结果对西葫芦病毒病的防治提供一定的理论依据。
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湖南省永州地区柑橘慢衰病与黄龙病病原鉴定及分布调查
《植物保护 》 2016 北大核心 CSCD
摘要:为明确湖南省柑橘黄化症状与柑橘慢衰病和柑橘黄龙病的相关性,应用形态学和分子生物学方法对湖南省永州地区表现黄化症状的柑橘进行了两种病原的鉴定及分布调查。结果表明,造成该地区柑橘黄化现象的主要原因为柑橘半穿刺线虫和黄龙病菌对柑橘的侵染。所检样本中,柑橘慢衰病平均发生率为82.1%,土壤中的半穿刺线虫群体密度最高达到3 077条/100mL。永州地区柑橘黄龙病病菌属于韧皮部杆菌属类细菌亚洲种,平均检出率为64.3%。柑橘半穿刺线虫和黄龙病菌在柑橘园存在混合侵染现象,混合侵染率为53.6%。柑橘半穿刺线虫在永州地区柑橘产区分布广泛,是造成柑橘黄化症状的重要病因,重视并有效防控柑橘半穿刺线虫已迫在眉睫。
关键词: 柑橘慢衰病 柑橘黄龙病 柑橘半穿刺线虫 病原鉴定 分布调查
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辣椒炭疽病菌拮抗内生菌筛选及其对辣椒采后保鲜效果的研究
《现代食品科技 》 2016 北大核心
摘要:从辣椒果实中分离、筛选出了一株对辣椒炭疽病菌具有拮抗作用的内生细菌P5,通过菌体、菌落形态观察、生理生化测定及16S r DNA序列分析,鉴定P5为枯草芽孢杆菌。以辣椒炭疽病作为指示菌,测定其发酵滤液理化性质。用发酵滤液处理辣椒进行采后保鲜研究,测定品质指标:质量损失率、腐烂率、可滴定酸含量、Vc含量、总糖含量、叶绿素含量等品质指标。结果表明,发酵滤液热稳定性良好,在p H 8.0以下,40~100℃范围内,抑菌活性稳定无变化,121℃处理30 min活性有所下降,为对照组的85%;对p H稳定,在室温下,p H 2.0~12范围内,抑菌活性不发生变化;对紫外线稳定,经紫外光照射12 h,其活性仍为对照的89.87%。发酵滤液处理过的辣椒保鲜效果明显优于无菌水对照组,显著降低了辣椒失重率和腐烂率,并有效抑制了果实中可滴定酸、Vc、总糖、叶绿素等含量的减少,对辣椒有显著的保鲜效果。
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茯砖茶“金花”菌的分离、鉴定及转化葛根产物研究
《茶叶科学 》 2016 北大核心 CSCD
摘要:为研究茯砖茶中"金花"菌是否能在葛根上生长,并进行生物转化,得到活性更高的发酵产物。从茯砖茶中分离出一株优势菌株LS1,并进行鉴定;以野葛、粉葛、葛渣为底物进行固体发酵,以DPPH自由基清除法比较发酵前后产物抗氧化活性,并测定了总黄酮含量及采用高效液相色谱法检测葛根素质量浓度。结果表明,LS1经形态学观察及ITS-5.8S r DNA序列分析,鉴定为冠突散囊菌Eurotium cristatum,Gen Bank登录号为KR812327;野葛、粉葛、葛渣固体发酵后总黄酮和葛根素含量分别提高了15.97%、12.33%、20.69%和20.48%、7%、20.29%。
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辣椒VQ基因家族的鉴定与低温胁迫下的表达分析
《湖南中医药大学学报 》 2016
摘要:目的从辣椒(Capsicum annuum L.)全基因组中鉴定VQ基因,并进行基因结构、基因进化、染色体定位以及组织表达和低温诱导表达分析。方法利用辣椒基因组数据库,通过生物信息学方法,鉴定辣椒基因(Ca VQ)家族成员;利用MEME、GSDS 2.0、DNAMAN8、Map Inspect等软件进行基因结构及染色体定位分析;采用MEGA6.0软件进行系统进化树分析;利用RNA-seq数据及q RT-PCR的方法进行辣椒组织表达模式和低温胁迫分析。结果辣椒全基因组中含有29个Ca VQ基因;Ca VQ基因结构相对简单,不均匀地分布在辣椒各染色体上;Ca VQ基因家族分为2组(GroupⅠ和GroupⅡ)及6个亚组(GroupⅠa、GroupⅠb、GroupⅠc、GroupⅡa、GroupⅡb和GroupⅡc);不同组织中Ca VQ基因的表达量具有一定差异,低温胁迫可抑制或激活部分Ca VQ基因表达量。结论 Ca VQ基因家族包括29个成员,分为2组,6个亚组,分布于10条染色体上,其组织表达模式及基因响应具有多样性。
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湖南早籼稻品种芽期和苗期耐冷性初步研究
《杂交水稻 》 2015 北大核心 CSCD
摘要:以16个湖南地区推广的早籼稻品种为材料,设置9个芽期低温胁迫处理,以死苗率为指标探讨了早籼稻芽期耐冷性的适宜鉴定方法,并鉴定了部分品种的苗期耐冷性。结果表明,8℃/7 d低温处理下早籼稻品种死苗率的方差和变异系数大,能较好地鉴别品种间耐冷性差异,是早籼稻芽期耐冷性鉴定的最合理方式;相关分析表明,早籼稻苗期耐冷性与芽期耐冷性鉴定结果基本一致;在苗期低温胁迫下耐冷水稻品种能够维持较高的游离脯氨酸含量,同时保持叶绿素和丙二醛含量的相对稳定;部分早籼稻品种的芽期和苗期耐冷性较差,不适宜采用直播栽培。
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