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关键词:SSR(模糊匹配)
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利用SSR标记鉴定油菜杂交品种沣油737种子纯度的研究

农业开发与装备 2014

摘要:纯度鉴定是油菜种子质量控制的关键环节。本研究通过对甘蓝型油菜基因组上72个SSR标记进行筛选,获得1对能将沣油737杂交种与母本区分开的SSR引物CB10373,其扩增产物带型清晰、差异明显、扩增稳定。利用该引物对沣油737的16个杂交制种样品进行纯度分析,并与田间种植鉴定结果进行对比分析,结果表明利用SSR标记鉴定油菜杂交种纯度是准确可靠地,可满足油菜种子纯度快速检测的需要。

关键词: 油菜 SSR 沣油737 纯度鉴定

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四个杂交水稻骨干恢复系的多态性分析

福建农业学报 2014

摘要:选取均匀分布于水稻12条染色体上的134对SSR(Simple Sequence Repeats,SSR)标记,对明恢63、明恢86、航1号和航2号等4个具有相似遗传背景的水稻骨干恢复系进行遗传多态性分析。结果表明,经航天诱变选育的"航1号、航2号"与原种明恢86之间存在不同程度的遗传多样性。在筛选的134对SSR引物中,具有多态性标记为39对,多态性频率为29.10%。每个标记位点的平均等位基因数为2.10个,变幅为1~4个,平均多态性信息含量指数(PIC)为0.37。聚类分析结果表明,当以0.87为阀值时可将航天诱变选育的"航1号、航2号"与原种"明恢86"区分开。其中在标记RM234两侧邻近的7个含有重要基因区段的SSR标记中有5个标记存在多态性,表明明恢86在航天诱变过程中可能在具有重要生物学功能的基因座发生了突变,再经系统选育成航1号、航2号优良恢复系,为航天诱变中因发生有利变异而选育新品种提供分子证据。

关键词: 航天育种 骨干恢复系 SSR 多态性

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一种简便的南瓜杂交种纯度SSR鉴定方法

中国农学通报 2014 北大核心 CSCD

摘要:针对目前南瓜杂交种纯度SSR鉴定方法操作繁琐,难以用于生产实践的问题,笔者介绍了一种简便的南瓜杂交种纯度SSR检测方法。该方法的基因组提取过程不需研磨、冷冻、离心、晾干等操作步骤,检测周期小于3 min,PCR反应体系与聚丙烯酰胺凝胶电泳的银染步骤,比常规方法更节约时间和成本,整个检测周期小于4 h,每人每天可完成480个样品的检测,且结果与田间鉴定结果吻合率达到99%。该方法可为南瓜杂交种的大规模快速纯度鉴定提供依据。

关键词: 南瓜 杂交种 SSR 纯度鉴定

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甘蓝型油菜pol-CMS杂交种纯度SSR鉴定与田间鉴定单株吻合率研究

湖南农业科学 2013

摘要:为探讨SSR标记技术在甘蓝型油菜pol-CMS杂交种纯度鉴定中的准确性,研究采用SSR标记技术和田间种植鉴定两种方法对3个推广面积较大的油菜杂交种样品纯度进行一一对比分析,结果表明:两种鉴定方法的鉴定偏差在2%以内,单株鉴定结果吻合率在97%以上,表明利用SSR标记鉴定甘蓝型油菜杂交种纯度是准确可靠的。

关键词: 甘蓝型油菜 pol-CMS SSR 田间鉴定 吻合率

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SSR分子标记研究进展

安徽农业科学 2013 北大核心

摘要:SSR标记广泛分布于基因组中,呈孟德尔遗传,多态性丰富,信息量大,已被作为一种理想的分子标记之一而广泛应用。文中重点介绍了SSR标记的开发和SSR技术试验体系的研究进展,旨在为SSR分子标记的研究与应用提供参考信息。

关键词: SSR 分子标记 研究进展

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SSR分子标记技术研究紫菜薹资源的亲缘关系(英文)

Agricultural Science & Technology 2012

摘要:[目的]利用SSR分子标记技术研究紫菜薹资源的亲缘关系。[方法]用从大白菜引物中筛选出的65对引物,对收集到的45份紫菜薹地方资源进行SSR分析,并对结果进行聚类分析。[结果]试验共筛选出23对SSR引物;聚类分析表明,紫菜薹亲缘关系表现出较为明显的地域性,大致可分为四川、湖南、湖北3个类群;同时,45份资源的相似系数都大于0.5(介于0.5470~0.9107之间),表明紫菜薹各品种间亲缘关系较近,遗传基础较为狭窄。[结论]该研究为紫菜薹地方品种资源的鉴定、保护以及育种利用提供了理论和技术依据。

关键词: 紫菜薹 红菜薹 SSR 种质 亲缘

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甘蓝型油菜自交系的SSR遗传多样性分析

湖南农业科学 2012

摘要:利用SSR标记对16份甘蓝型油菜自交系进行遗传多样性分析。结果表明:34对引物共扩增出72条清晰的谱带,片段长度在100~650 bp之间,引物PIC值介于0.12~0.73之间,平均为0.39;供试材料间的遗传相似系数在0.52~0.90之间,平均为0.63,其中pol-CMS恢复系间的遗传差异较大,pol-CMS不育系间与温敏核不育系间的差异较小;在遗传相似系数0.685处可将供试材料分为3个类群,聚类结果与已知的系谱来源基本一致。

关键词: 甘蓝型油菜 SSR 遗传多样性

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辣椒杂交种纯度快速鉴定体系建立与应用分析

中国农学通报 2012 北大核心 CSCD

摘要:为了解决辣椒杂交种快速鉴定的问题,有必要建立辣椒杂交种的室内纯度鉴定体系,以兴蔬种业的32个品种的父本、母本和F1共96份为试验材料,利用150对SSR引物对96份材料进行了PCR扩增,寻找扩增差异。扩增结果发现,150对引物中51对能扩增出清晰条带,19对多态性较好,5对引物能够区别兴蔬种业32个品种的父本、母本及其F1。SSR分子标记能够快速准确地鉴定辣椒杂交种纯度,与田间鉴定结果一致,且成本低廉。

关键词: 辣椒 SSR 纯度

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一种快速的油菜杂交种纯度SSR鉴定方法

分子植物育种 2012 CSCD

摘要:SSR标记技术是农作物品种纯度鉴定主要手段之一。本研究介绍了一种适合油菜杂交种纯度鉴定的快速SSR检测方法,检测时间比目前常规的SSR检测缩短5h,且操作过程不需要研磨、离心沉淀、冷冻、晾干和溶解等操作,每人每天可完成480个单株的检测。将该方法用于2个油菜杂交品种制种样品的纯度检测,并与醇溶蛋白电泳和田间种植的鉴定结果进行比较,结果表明醇溶蛋白电泳和快速SSR检测结果差异不显著,且极显著相关(r=0.991),田间种植鉴定结果高于上述两种方法,但相关性均达到显著水平。该检测方法可以为油菜杂交种纯度鉴定提供可靠依据。

关键词: 油菜杂交种 SSR 纯度鉴定

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利用SSR分析红菜苔的遗传多样性

植物遗传资源学报 2012 北大核心 CSCD

摘要:红菜苔是我国独有的蔬菜资源,深受消费者喜爱。利用63对SSR引物检测来自全国的45份红菜苔种质资源的遗传多样性,63对引物扩增出124条带,平均每条引物扩增出近2条带,扩增产物片段大小都在150~300bp之间,相似系数在0.56~0.89之间。结果表明,红菜苔具有丰富的遗传多样性,本研究为菜苔资源的利用和育种提供了分子生物学依据。

关键词: 红菜苔 种质资源 SSR 遗传多样性