科研产出
核辐射诱变创制低镉水稻新种质
《核农学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：辐射诱变技术广泛应用于作物基因功能研究和品种培育。为提高从诱变群体中筛选与鉴定变异的效率，本研究针对特定育种目标性状变异进行筛选，M2诱变群体在实验室采用水培方式育苗，根据核辐射诱发突变的变异特性，结合高通量测序手段构建了核辐射多基因液相探针捕获技术体系。利用该体系从水稻诱变群体中鉴定重金属镉运输跨膜蛋白基因OsNramp5突变体。结果表明，在池栽和中轻度镉污染土壤稻田常规种植模式下，OsNramp5突变新品系糙米镉含量显著低于国家稻谷中镉限量标准(0.2 mg·kg-1)。本研究为核辐射诱变特定育种目标性状变异筛选构建了高效的筛选技术体系，并提高了突变鉴定的精准率，为特定育种目标性状变异高通量筛选提供了技术支撑。
全文链接
请求原文
不同施肥措施对水蜜桃园土壤线虫群落结构和多样性的影响
《生态学杂志 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：土壤线虫群落结构是指示土壤环境和生态系统功能变化的重要指标。以新建水蜜桃园为研究对象，以常规管理为对照（HCK）,采用Illumina Miseq测序技术研究了施用饼肥（HB）、种植绿肥（光叶紫光苕，HG）、硒肥（HX）、绿肥+饼肥（HGB）、硒肥+饼肥（HXB）等不同施肥措施对成都平原水蜜桃园土壤线虫结构及其多样性的调控，并探讨了其主要影响因素。结果表明：所获桃园土壤样品线虫种群隶属17纲92科133属，其中肾形虫属（Colpoda）和拟丽突属（Acrobeloides）为土壤优势线虫类群（相对丰度平均值分别为38.16%和20.77%）,相对丰度在硒肥处理中最高、绿肥处理中最低；不同施肥措施土壤线虫的ACE丰富度指数差异并不显著，Shannon多样性指数在绿肥处理中显著高于其他处理特别是绿肥+饼肥处理，同时，饼肥、硒肥与硒肥+饼肥处理也显著高于绿肥+饼肥处理。聚类分析将6种施肥措施下土壤线虫群落划分为两类，饼肥、绿肥、绿肥+饼肥处理为一类，其他3种施肥措施归为一类。冗余分析表明，土壤pH和硝态氮（NO3--N）含量是影响水蜜桃园土壤线虫群落结构的主要因子。由此可见，施肥措施通过影响土壤理化性状，特别是pH值和硝态氮水平调控土壤线虫群落的组成和多样性。
全文链接
请求原文
传统鲊鱼固态发酵过程中细菌群落与挥发性风味物质的相关性
《食品与机械 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：目的:了解传统鲊鱼发酵过程中微生物演替及挥发性风味物质的变化规律.方法:采用传统微生物计数、高通量测序、气相色谱—质谱联用等方法,探究传统鲊鱼固态发酵过程中(0~180 d)微生物菌消长和挥发性风味化合物的变化以及两者的相关性.结果:传统微生物计数和高通量测序两种方法得出葡萄球菌、乳酸菌类是传统发酵鲊鱼发酵过程中的主要优势细菌属.在发酵0~180 d的样品中共检出挥发性化合物69种,主要包括酸类、醇类、醛类、酮类、含N化合物、含苯化合物、芳香烷烃化合物、酯类,其种类和含量随着发酵时间变化而变化.相关性分析发现,葡萄球菌与含N化合物类呈正相关,与醇类化合物负相关;乳酸菌与壬酸、1-辛烯-3-醇、壬醛、肉豆蔻醛、2,4-二甲基苯乙烯、癸烯、己酸乙酯显著正相关(0.01 全文链接
请求原文
野葛根际固氮微生物群落分布特征及其影响因素
《微生物学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：【目的】研究野葛根际固氮微生物群落的空间分布特征,同时结合地理气候因子、土壤理化性质探讨影响野葛根际固氮微生物群落的空间分布特征的主要因素。【方法】在野葛广泛分布的广西、江西和湖南采集17份野葛根际土壤,测定土壤常规理化性质,进行基于MiSeq测序平台的nifH基因高通量测序,采用多元统计分析方法探索固氮微生物群落结构与环境因子之间的关系。【结果】不同采样区域固氮微生物α多样性无显著差异;同一采样区内各样点的固氮微生物群落结构与组成较相似,而不同采样区之间固氮微生物群落结构与组成差异较大,这表明固氮微生物群落存在明显的区域性分布特征。野葛根际土壤中固氮微生物主要归属于变形菌门(Proteobacteria)(相对丰度>60%),在目水平上,已注释出的固氮微生物主要归属于根瘤菌目(Rhizobiales)和伯克氏菌目(Burkholderiales)。根瘤菌目相对丰度在江西采样区最高,伯克氏菌目相对丰度在湖南采样区最高。pH、交换性钙、全钾、海拔和年平均气温对土壤固氮微生物群落结构的影响较大。优势种群伯克氏菌目与pH、交换性钙和全钾正相关,与C/N负相关;优势种群根瘤菌目与pH、交换性钙、海拔和年均温负相关,与全钾和砂粒含量正相关。【结论】不同地理区域野葛根际土壤中固氮微生物α多样性无显著差异,但固氮微生物群落结构与组成存在明显的区域性分布特征。其群落组成受地理环境和土壤理化性质的共同影响,且固氮微生物不同种群对环境因子的响应存在差异。
全文链接
请求原文
风味小龙虾中优势腐败菌与挥发性化合物的表征（英文）
《Agricultural Science & Technology 》 2021
摘要：为破解常温贮藏风味小龙虾易腐败变质的难题,该文应用高通量测序和气相-质谱分析技术(SPME-GC-MS)揭示风味小龙虾在正常和腐败时的微生物群落结构和挥发性风味化合物特征。结果表明:从微生物群落结构来分析,冷藏鲜虾HNA组以嗜水气单胞菌属(57%)、巨形球菌属(7.7%)、弧菌属(6.6%)、不动杆菌属(5%)、柠檬酸杆菌属(4.9%)、肠杆菌属(1.49%)为主;经过卤制冷藏的HND组以葡萄球菌属(17.04%)、气球菌属(4.46%)、黄单胞菌属(4.16%)、明串球菌(4.62%)、肠球菌属(2.77%)等为主;随着样品腐败变质,腐败组HNE和HNC的细菌多样性减少,优势腐败菌快速生长,且以肠球菌属、芽孢杆菌属、乳杆菌属、明串球菌属、魏斯氏菌属为主。从挥发性化合物成分来分析,未腐败组HNA和HND以烷烃类、醛类和酯类化合物为主;而腐败组HNE和HNC以醇类、酸类、含苯化合物、萜类、含N及含S化合物和醚类化合物为主,这说明随着样品腐败变质,挥发性化合物的含量和种类发生了变化。相关性分析结果表明肠球菌属、乳杆菌属和杆菌属与醇类、酸类、含苯类、萜类、醚类、含N及含S化合物呈显著正相关,而气单胞菌属、巨形球菌属、不动杆菌属、柠檬酸杆菌和弧菌与烷烃类和酯类化合物呈显著正相关,明串球菌与醇类呈显著正相关。总之,通过高通量测序和气相-质谱分析技术鉴定出的优势腐败菌和挥发性化合物可为常温储藏熟制风味小龙虾提供理论指导。
关键词： 小龙虾 高通量测序 气相-质谱分析技术 微生物群落结构 挥发性化合物
全文链接
请求原文
绿肥间作对茶树根际土壤真菌群落的影响
《茶叶通讯 》 2020
摘要：通过IonS5TM XL高通量测序技术探讨了茶园间作光叶苕子-茶肥1号(CF)、湘野豌1号-田菁(TJ)、肥田萝卜-圆叶决明(JM))对茶树根际土壤真菌群落结构特征和土壤养分的影响.结果 表明:与对照(无间作)相比,间作绿肥提高了土壤有机质、全氮、碱解氮、有效磷和速效钾的含量,其提高幅度分别为1.19%~23.79%、0.87%~12.17%、4.37%~14.34%、23.08%~62.12%和7.70%~44.06%.茶树根际土壤真菌Shannon指数和Chaos指数的变化趋势均为TJ>CK>JM>CF,其中TJ与CF处理间差异显著(P<0.05),其他处理间差异不显著(P>0.05).被孢霉门(Mortierellomycota)、子囊菌门(Ascomycota)和担子菌门(Basidiomycota)为茶树根际土壤中三大优势真菌门,绿肥间作提高了担子菌门的相对丰度,降低了球囊菌门(Glomeromycota)和罗兹菌门(Rozellomycota)的相对丰度;被孢霉纲(Mortierellomycetes)、银耳纲(Tremellomycetes)和粪壳菌纲(Sordariomycets)为三大优势菌纲;沙蜥属(Saitozyma)、被孢霉属(Mortierell)和镰刀霉属(Fusarium)为3大优势菌属.冗余(RDA)分析结果显示,土壤全磷、有效磷、有机质、全氮和碱解氮影响茶树根际土壤真菌群落结构.经FUNGuild软件平台分析显示,茶树根际包含如下生态功能群:未定义腐生菌、丛枝菌根、真菌寄生菌、木质腐生菌、动物病原菌、植物病原菌、外生真菌等.茶园间作绿肥翻埋还田,能有效调节茶树根际土壤真菌群组成,改善茶园土壤生态环境,是实现茶叶绿色可持续发展的重要措施.
全文链接
请求原文
大豆不同生育期叶际光合细菌群落结构特征
《南方农业学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：[目的]探究大豆不同生育期叶际光合细菌群落结构多样性及其分布特征,揭示大豆生育期与光合细菌群落结构变化间的关系,为促进光合细菌在农业生产中的应用提供参考依据.[方法]对5个生育期(苗期、出枝期、花期、鼓粒期和成熟期)大豆叶际光合细菌的Puf M基因序列进行PCR扩增,并对PCR扩增产物进行Illumina高通量测序,分析大豆叶际光合细菌群落多样性及分布特征.[结果]从大豆5个生育期叶片样品中共检测到光合细菌2门、5纲、36属、84种.不同生育期大豆叶片样品中光合细菌的群落组成和结构存在一定差异,在相对丰度方面表现为成熟期>苗期>出枝期>花期>鼓粒期;在多样性方面表现为苗期>出枝期>花期>鼓粒期>成熟期.大豆不同生育期的叶际光合细菌在门、纲、属和种分类水平上的优势菌群及所占比例分别为变形菌门(Proteobacteria)(92.11%~99.29%)、α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)(75.17%~97.40%)、甲基杆菌属(Methylobacterium)(60.67%~95.09%)和扭脱甲基杆菌(Methylo-bacterium extorquens)(36.89%~87.88%),随着分类水平逐渐细化,不同生育期对大豆叶际光合细菌群落组成和分布的影响越大.[结论]生育期对大豆叶际光合细菌群落结构有重要影响,实际生产中可通过在大豆不同生育期施用不同的光合细菌以促进优势群落形成,从而促进大豆生长.
全文链接
请求原文
西瓜枯萎病不同发病阶段根际微生物群 落结构分析
《农业科学与技术(英文版) 》 2020
摘要：通过高通量测序分析西瓜枯萎病不同发病阶段根际土壤微生物群落结构,以探明根际微生物优势菌群在西瓜枯萎病发生过程中差异.以种植前土壤(CK1),发病高峰期土壤(CK2),发病稳定期土壤(CK3)样品,利用Illumina-Hiseq高通量测序平台对根际土壤进行16S和ITS rDNA测序分析.结果显示:根际土壤细菌多样性表现为CK1>CK3>CK2,其中CK1与CK3之间无显著性差异,与CK2之间差异性显著,在属水平上,发病高峰期主要富集优势细菌群有Mizugakiibacter(21.9299%)、罗河杆菌属(Rhodanobacter,5.0933%)、乳杆菌属(Lactobacillus,3.1921%).根际土壤真菌多样性表现为CK1>CK3>CK2,三者呈显著差异性;在属水平上,发病高峰期主要富集优势真菌群有散尾鬼笔属(Lysurus,54.4601%)、 团丝核菌属(Papulaspora,12.4252%)、端梗孢属(Acrophialophora,3.1729%).试验结果表明,西瓜枯萎病发病高峰期土壤中细菌、真菌的多样性及丰富度均有下降,随着发病逐渐稳定,根际土壤中细菌、真菌多样性和丰富度得到一定程度的恢复.
关键词： 西瓜枯萎病 土壤细菌多样性 土壤真菌多样性 高通量测序
全文链接
请求原文
烟草黑胫病拮抗细菌菌群的筛选
《湖南农业大学学报(自然科学版) 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：从湖南烟区烟草黑胫病重发田块采集根际土壤样品共900份,经富集培养后筛选出195个对烟草黑胫病菌有拮抗效果的细菌菌群。菌群Miseq高通量测序结果表明:不动杆菌属(Acinetobacter)和寡养单胞菌属(Stenotrophomonas)为拮抗细菌菌群共有的优势属。挑选5个抑菌效果较好菌群施入烟田土壤,B44R菌群对烟草黑胫病防效达51.56%。将这5个细菌菌群进行拮抗菌株分离筛选,获得的拮抗菌株分别属于芽孢杆菌属、不动杆菌属、寡养单胞菌属和克雷伯氏菌属。施入菌群后的土壤高通量测序结果显示这些拮抗细菌菌群可在土壤中定殖,其中不动杆菌属和芽孢杆菌属的种群数量显著增加。
全文链接
请求原文
西瓜枯萎病不同发病阶段根际微生物群落结构分析
《湖南农业科学 》 2019
摘要：通过高通量测序分析西瓜枯萎病不同发病阶段根际土壤微生物群落结构,以探明根际微生物优势菌群在西瓜枯萎病发生过程中的差异.以种植前土壤(CK1),发病高峰期土壤(CK2),发病稳定期土壤(CK3)样品,利用Illumina-Hiseq高通量测序平台对根际土壤进行16S和ITS rDNA测序分析.结果显示:根际土壤细菌多样性表现为CK1>CK3>CK2,其中CK1与CK3之间无显著性差异,与CK2之间差异性显著,在属水平上,发病高峰期主要富集优势细菌群有Mizugakiibacter(21.9299%)、罗河杆菌属(Rhodanobacter,5.0933%)、乳杆菌属(Lactobacillus,3.1921%).根际土壤真菌多样性表现为CK1>CK3>CK2,三者呈显著差异性,在属水平上,发病高峰期主要富集优势真菌群有散尾鬼笔属(Lysurus,54.4601%)、团丝核菌属(Papulaspora,12.4252%)、端梗孢属(Acrophialophora,3.1729%).试验结果表明,在西瓜枯萎病发病高峰期根际土壤中细菌、真菌的多样性及丰富度均有所下降,随着发病逐渐稳定,根际土壤中细菌、真菌多样性和丰富度得到一定程度的恢复.
关键词： 西瓜枯萎病 土壤细菌多样性 土壤真菌多样性 高通量测序
全文链接
请求原文
