科研产出
不同食物对大草蛉生长发育和繁殖的影响及转录组比较分析
《南方农业学报 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：[目的]分析不同食物对大草蛉(Chrysopa pallens)生长发育和繁殖的影响及转录组差异,以筛选大草蛉幼虫的室内替代食物,为大草蛉的规模化饲养提供理论依据.[方法]采用豆蚜(Aphis craccivora)若蚜、麦长管蚜(Sito-bion avenae)若蚜、斜纹夜蛾(Spodoptera litura)2龄幼虫、草地贪夜蛾(Spodoptera frugiperda)2龄幼虫4种不同食物,分别对大草蛉1、2、3龄幼虫进行室内人工饲养,研究不同食物及其取食阶段对大草蛉生长发育和繁殖的影响.根据不同食物对大草蛉生物学特性的影响,对取食豆蚜和草地贪夜蛾的大草蛉3龄幼虫进行转录组测序分析.[结果]在3个不同取食阶段,取食豆蚜和麦长管蚜的大草蛉幼虫均可正常发育化蛹;从1、2龄开始取食斜纹夜蛾和草地贪夜蛾的大草蛉幼虫发育至蛹期的存活率较低,从3龄开始取食斜纹夜蛾和草地贪夜蛾对大草蛉幼虫生长发育的影响较小,大部分可发育至蛹期.大草蛉3龄幼虫取食4种不同食物对雌雄成虫寿命和雌成虫产卵前期、产卵历期均无显著影响(P>0.05),但取食豆蚜、麦长管蚜的单雌产卵量和卵孵化率均显著高于取食斜纹夜蛾、草地贪夜蛾(P<0.05).转录组分析结果表明,取食草地贪夜蛾与豆蚜的大草蛉间共有680个差异表达基因(DEGs),其中333个上调表达,347个下调表达,GO功能注释和富集分析结果表明,DEGs主要富集在细胞组分中膜的组成部分、膜的内含成分等条目;KEGG信号通路富集分析结果表明,DEGs主要富集在外源性细胞色素P450代谢、抗坏血酸和醛酸代谢等通路.[结论]大草蛉各龄幼虫均能捕食豆蚜若蚜、麦长管蚜若蚜、斜纹夜蛾2龄幼虫、草地贪夜蛾2龄幼虫;随着虫龄增大,大草蛉对不同食物的适应能力增强,从3龄幼虫起取食斜纹夜蛾、草地贪夜蛾对大草蛉生长发育和繁殖的影响较小.取食草地贪夜蛾与豆蚜的大草蛉间DEGs与物质运输、细胞免疫、能量代谢等密切相关.
全文链接
请求原文
伴矿景天对低温胁迫响应的转录组分析
《农业科技与技术(英文) 》 2025
摘要：为探究伴矿景天对低温胁迫的响应机制,对常温 22℃(对照)及 10℃、-2℃低温胁迫处理 6 h后伴矿景天的表型进行观察,测定叶片中SOD和POD酶活性及MDA含量等生理指标,并对其进行转录组分析.结果表明,低温胁迫导致伴矿景天SOD和POD酶活性及MDA含量、可溶性糖和可溶性蛋白质含量、相对电导率均显著上升.转录组数据经过优化后共得到了 78 803 个unigenes,其平均长度为 871.13 bp,N50 值为1 510 bp.与对照相比,10 和-2℃低温的转录组测序分别获得 8 391 和 10 730 个差异基因.差异基因主要富集于对非生物刺激的响应(包括温度刺激响应)、DNA结合转录因子活性及氨基酸代谢过程,伴矿景天中黄酮类化合物生物合成和MAPK信号通路的激活可能在植物低温响应中起关键作用.在低温胁迫下,伴矿景天通过显著提高抗氧化酶活性和积累渗透调节物质来增强其抗逆性,同时转录组分析表明黄酮生物合成、MAPK信号通路、氮代谢及植物激素信号转导等代谢通路在伴矿景天的低温胁迫响应中起到至关重要的作用.
全文链接
请求原文
紫叶甘蓝型油菜花青素合成的转录组-代谢组联合分析
《华北农学报 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：通过筛选甘蓝型油菜绿叶和紫叶突变体叶片中差异表达基因和差异代谢物，为解析花青素合成机理奠定理论基础。对苗期叶片呈紫色的甘蓝型油菜(PL)和叶片呈绿色的甘蓝型油菜ZS11(GL)幼苗表型观察发现，PL在长出2片真叶(3周)时紫色斑驳分布，随着发育紫色逐渐加深，抽薹期后紫色逐渐变浅最终消失(>16周),GL叶片则全时期呈绿色；转录组KEGG分析在第6,13,16周找到2 523个共差异表达基因，上述差异表达基因在花青素合成途径显著富集。与花青素合成相关的24个基因显著差异表达，包括3个MYBL2、1个C4H、1个F3H、2个F3′H、2个TT8、3个DFR、4个ANS、5个UGT、3个TT19,上述基因在第6,13周PL叶片中表达量均高于GL。选取8个差异表达基因进行qRT-PCR验证，结果与转录组分析数据趋势一致。花青素靶向代谢组共检测到50种花青素，其中29种积累差异显著；PL相对于GL有16种花青素积累上调，13种花青素积累下调。PL叶片中多种矢车菊素积累量显著增加，而矮牵牛素积累量显著下降，花青素合成途径中差异表达基因和差异代谢物的表达量均达到显著水平。TT8及其靶基因(DFR、ANS、UGT、TT19)在发育早期(6～13周)的上调促进了PL中以矢车菊素为主的花青素的积累以及矮牵牛素为主的花青素的减少，导致叶片叶色出现差异。而发育后期(13～16周),这些花青素合成基因的下调和花青素的降解可能导致花青素积累的减少，使PL由紫叶转变为绿叶。
全文链接
请求原文
'融安金柑''滑皮金柑'及'脆蜜金柑'贮藏期品质、贮藏特性及果皮转录组分析
《中国农业科学 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：【目的】金柑是带皮食用的柑橘类水果,果皮性状不仅关系到消费者口感,也对金柑采后贮藏保鲜产生一定影响。同一遗传背景下的3个金柑品种—‘融安金柑’‘滑皮金柑’及‘脆蜜金柑’果皮差异大。比较3个品种贮藏过程中的内在品质和贮藏特性,并对其果皮进行转录组分析,探讨3个品种金柑果皮差异对其采后特性的影响,旨在为金柑品质调控及采后贮藏保鲜提供新思路新方法。【方法】在商业成熟度采收‘融安金柑’‘滑皮金柑’及‘脆蜜金柑’果实进行贮藏试验,测定贮藏期间果实失水率、可溶性固形物、酸、硬度、剪切力、果皮木质素及纤维素,并对3个品种成熟果皮组织材料进行转录组测序并验证。【结果】采后贮藏分析表明,‘滑皮金柑’失水率高于‘融安金柑’及‘脆蜜金柑’,最早出现果皮皱缩现象,贮藏第99天时,滑皮金柑失水率达38.6%,显著高于‘融安金柑’的5.8%和‘脆蜜金柑’的14.3%。3个品种可溶性固形物和酸含量在贮藏期总体呈上升趋势,‘脆蜜金柑’可溶性固形物含量始终高于其他两者,贮藏22 d后,‘滑皮金柑’酸含量迅速下降并持续低于‘脆蜜金柑’和‘融安金柑’。‘脆蜜金柑’和‘滑皮金柑’内在品质优于‘融安金柑’。从结构上来看,‘融安金柑’贮藏过程中变化较大,贮藏第44天时细胞已破损明显。‘滑皮金柑’‘脆蜜金柑’果实硬度、剪切力显著强于‘融安金柑’;‘滑皮金柑’‘脆蜜金柑’果皮木质素含量(A280·g-1)分别为1.41和1.31,显著高于‘融安金柑’木质素含量（1.12）,两者在纤维素含量上也显著高于‘融安金柑’。针对果皮的转录组分析表明,‘融安金柑’‘滑皮金柑’及‘脆蜜金柑’果皮在苯丙烷生物合成途径上存在显著差异,‘滑皮金柑’与‘脆蜜金柑’差异较小,‘融安金柑’与二者差异均较大。基因表达分析显示,‘滑皮金柑’及‘脆蜜金柑’9个木质素合成相关基因表达量均显著高于‘融安金柑’。【结论】3个金柑品种常温条件下可短期贮藏,采后一个月内销售完较为适宜。采后贮藏过程中‘滑皮金柑’因水分散失过快最早失去商品价值,‘脆蜜金柑’外观和内在品质最好。‘脆蜜金柑’果实硬度、剪切力、贮藏性较强与果皮木质素和纤维素含量较高、有色层和白皮层细胞排列紧密密切相关。苯丙烷生物合成代谢较弱引起木质素含量差异与‘融安金柑’果皮韧性差密切相关。
全文链接
请求原文
利用WGCNA对受白粉菌侵染后的拟南芥转录组差异基因分析
《分子植物育种 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：加权基因共表达网络分析(WGCNA)是一种用于鉴定协同表达的基因模块的方法.为探究拟南芥天然抗病基因,本研究利用WGCNA分析拟南芥受白粉菌UCSC1 (Erysiphe cichoracearum)侵染后的表达情况,挖掘其转录组的差异表达基因,构建基因共表达网络并识别协同表达的基因模块.筛选出与白粉菌侵染最相关的基因模块,并进行验证分析以确认鉴定的基因.功能富集分析结果表明:模块基因富集于机体获得性免疫,水杨酸生物合成等多个抗病相关通路,值得继续挖掘与拟南芥抗病过程的更多功能性关联.其他基因功能仍需鉴定,本研究为拟南芥抗病及植物育种研究提供了新思路.
全文链接
请求原文
镉胁迫下西瓜的转录组测序分析
《湖南农业大学学报(自然科学版) 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：以西瓜品种和欣(HX)和黑媚娘(HMN)的幼苗叶片为材料,经60 mg/kg氯化镉溶液处理(以未经氯化镉溶液处理的为对照)后,采用Illumina测序技术对转录组进行高通量测序,探讨西瓜镉胁迫的分子机理。结果表明:在黑媚娘处理组(HMN)和对照组(HMNCK)中共检测到8 579条差异基因,其中有4 297条基因表达显著上调,4 282条基因表达明显下调;在和欣处理组(HX)和对照组(HXCK)中共检测到7 108条差异基因,其中有3 662条基因表达显著上调,3 446条基因表达显著下调;不同组间差异基因的维恩图表明,HMN和HX组间有5 656条差异基因;根据不同数据库的注释信息,发现西瓜体内与镉胁迫相关的差异表达基因主要包括响应光合作用、信号转导、次生物质代谢、转录因子等相关基因;转录因子MYB、AP2/EREBP、bHLH、NAC和WRKY家族可能在西瓜响应镉胁迫中具有重要作用。用q RT–PCR技术对随机挑选的7条基因进行荧光定量验证,结果与Illumina测序数据一致,证实了差异表达基因数据的有效性。
全文链接
请求原文
辣椒转录组SSR挖掘及其多态性分析
《园艺学报 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：利用SSR检索程序从两个辣椒转录组共221037条unigenes(97.3Mb)中筛选得到17319个SSR位点(7.83%),其发生频率为1/56kb。其中以单核苷重复基序为主导类型,占总SSR的56.30%;其次是二、三核苷酸重复基序,其出现频率分别为19.16%和23.18%。对所有含SSR位点EST序列设计的10468对引物进行E-PCR多态性检测,获得1538对E-PCR多态性引物。随机选取20对引物进行验证,其中7对(36.84%)在10个不同类型辣椒材料中表现出多态性,PIC值范围为0.33～0.89,平均为0.67,将10个辣椒材料分为3类。这些潜在的多态性EST-SSR的开发为辣椒遗传多样性分析、图谱构建提供了更丰富的候选分子标记。
首页上一页1下一页尾页
