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镉胁迫下西瓜的转录组测序分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王志伟 1 ; 李涵 1 ; 邹甜 1 ; 孙波 1 ; 孙小武 1 ;

作者机构： 1.湖南农业大学园艺园林学院;湖南省蔬菜研究所;湖南省作物研究所

关键词： 西瓜;镉胁迫;转录组;差异基因;高通量测序

期刊名称： 湖南农业大学学报(自然科学版)

ISSN： 1007-1032

年卷期： 2018 年 05 期

页码： 506-513

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以西瓜品种和欣(HX)和黑媚娘(HMN)的幼苗叶片为材料,经60 mg/kg氯化镉溶液处理(以未经氯化镉溶液处理的为对照)后,采用Illumina测序技术对转录组进行高通量测序,探讨西瓜镉胁迫的分子机理。结果表明:在黑媚娘处理组(HMN)和对照组(HMNCK)中共检测到8 579条差异基因,其中有4 297条基因表达显著上调,4 282条基因表达明显下调;在和欣处理组(HX)和对照组(HXCK)中共检测到7 108条差异基因,其中有3 662条基因表达显著上调,3 446条基因表达显著下调;不同组间差异基因的维恩图表明,HMN和HX组间有5 656条差异基因;根据不同数据库的注释信息,发现西瓜体内与镉胁迫相关的差异表达基因主要包括响应光合作用、信号转导、次生物质代谢、转录因子等相关基因;转录因子MYB、AP2/EREBP、bHLH、NAC和WRKY家族可能在西瓜响应镉胁迫中具有重要作用。用q RT–PCR技术对随机挑选的7条基因进行荧光定量验证,结果与Illumina测序数据一致,证实了差异表达基因数据的有效性。

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