利用WGCNA对受白粉菌侵染后的拟南芥转录组差异基因分析

尚鸿运; 高志勇; 《分子植物育种 》 2020 北大核心 CSCD

摘要：加权基因共表达网络分析(WGCNA)是一种用于鉴定协同表达的基因模块的方法.为探究拟南芥天然抗病基因,本研究利用WGCNA分析拟南芥受白粉菌UCSC1 (Erysiphe cichoracearum)侵染后的表达情况,挖掘其转录组的差异表达基因,构建基因共表达网络并识别协同表达的基因模块.筛选出与白粉菌侵染最相关的基因模块,并进行验证分析以确认鉴定的基因.功能富集分析结果表明:模块基因富集于机体获得性免疫,水杨酸生物合成等多个抗病相关通路,值得继续挖掘与拟南芥抗病过程的更多功能性关联.其他基因功能仍需鉴定,本研究为拟南芥抗病及植物育种研究提供了新思路.

关键词： 加权基因共表达网络 拟南芥 白粉菌 转录组