文献类型： 中文期刊
作者： 尚鸿运 1 ; 高志勇 1 ;
作者机构： 1.武汉大学生命科学学院杂交水稻国家重点实验室
关键词： 加权基因共表达网络;拟南芥;白粉菌;转录组
期刊名称： 分子植物育种
ISSN： 1672-416X
年卷期： 2020 年 020 期
页码： 6734-6742
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 加权基因共表达网络分析(WGCNA)是一种用于鉴定协同表达的基因模块的方法.为探究拟南芥天然抗病基因,本研究利用WGCNA分析拟南芥受白粉菌UCSC1 (Erysiphe cichoracearum)侵染后的表达情况,挖掘其转录组的差异表达基因,构建基因共表达网络并识别协同表达的基因模块.筛选出与白粉菌侵染最相关的基因模块,并进行验证分析以确认鉴定的基因.功能富集分析结果表明:模块基因富集于机体获得性免疫,水杨酸生物合成等多个抗病相关通路,值得继续挖掘与拟南芥抗病过程的更多功能性关联.其他基因功能仍需鉴定,本研究为拟南芥抗病及植物育种研究提供了新思路.
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