您好，欢迎访问湖南省农业科学院 机构知识库！

辣椒转录组SSR挖掘及其多态性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王运生 1 ; 田雪亮 2 ; 茆振川 2 ; 邹学校 3 ; 谢丙炎 2 ;

作者机构： 1.湖南农业大学生物安全科学技术学院

2.中国农业科学院蔬菜花卉研究所

3.湖南省农业科学院蔬菜研究所

关键词： 辣椒;转录组;EST-SSR

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2012 年 39 卷 01 期

页码： 168-174

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用SSR检索程序从两个辣椒转录组共221037条unigenes(97.3Mb)中筛选得到17319个SSR位点(7.83%),其发生频率为1/56kb。其中以单核苷重复基序为主导类型,占总SSR的56.30%;其次是二、三核苷酸重复基序,其出现频率分别为19.16%和23.18%。对所有含SSR位点EST序列设计的10468对引物进行E-PCR多态性检测,获得1538对E-PCR多态性引物。随机选取20对引物进行验证,其中7对(36.84%)在10个不同类型辣椒材料中表现出多态性,PIC值范围为0.33～0.89,平均为0.67,将10个辣椒材料分为3类。这些潜在的多态性EST-SSR的开发为辣椒遗传多样性分析、图谱构建提供了更丰富的候选分子标记。

  • 相关文献

[1]辣椒种质遗传多样性的EST-SSR分析. 张竹青,邹学校. 2013

[2]2011-15-3等4个茶树新品系亲缘关系的EST-SSR分析. 段继华,罗意,黄飞毅,董丽娟,李赛君. 2015

[3]茶树新品系“53-34”父本的EST-SSR标记鉴定. 段继华,罗意,黄飞毅,康彦凯,郭嘉懿,董丽娟,李赛君. 2016

[4]茶树品种“玉绿”和“玉笋”父本的EST-SSR标记鉴定. 董丽娟,杨阳,刘振,王旭,宁静. 2009

[5]利用EST-SSR标记研究黄金茶群体遗传多样性及遗传分化. 刘振,赵洋,梁国强,赵熙. 2009

[6]基于EST-SSR的祁门种群体遗传多样性和亲缘关系分析. 雷雨,段继华,罗意,黄飞毅,董丽娟. 2015

[7]利用WGCNA对受白粉菌侵染后的拟南芥转录组差异基因分析. 尚鸿运,高志勇. 2020

[8]镉胁迫下西瓜的转录组测序分析. 王志伟,李涵,邹甜,孙波,孙小武. 2018

[9]紫叶甘蓝型油菜花青素合成的转录组-代谢组联合分析. 周弘峰,朱思颖,贺丹,刘丽莉,陈道宗,谭晨,张大为,严明理. 2024

[10]'融安金柑''滑皮金柑'及'脆蜜金柑'贮藏期品质、贮藏特性及果皮转录组分析. 刘恋,唐志鹏,李菲菲,熊江,吕壁纹,马小川,唐超兰,李泽航,周铁,盛玲,卢晓鹏. 2021

[11]不同食物对大草蛉生长发育和繁殖的影响及转录组比较分析. 方洁,肖艳松,史子涵,左昌昊,智磊,周观星,包强,谭琳. 2025

[12]伴矿景天对低温胁迫响应的转录组分析. 毛洋,陈希,王博,陈锦. 2025

[13]辣椒病毒病发生规律调查. 潘川芝,戴良英,邹学校. 2002

[14]辣椒疮痂病的发生与防治. 戴良英,唐莉,邹学校. 2002

[15]辣椒多年数量性状基因效应相关研究. . 2002

[16]用单管逆转录-聚合酶链式反应检测辣椒黄瓜花叶病毒. 谭新球,罗源华,何明远,戴建平,张战泓,刘勇. 2005

[17]辣椒的离体再生研究进展. 姚元干. 2002

[18]辣椒主要病害抗性的杂种优势研究. 陈文超,刘荣云,张竹青,马艳青,戴雄泽,杨宇红. 2003

[19]PP<,333>对辣椒抗寒性和幼苗生长发育的影响. 杨晓. 2003

[20]不同栽培模式对辣椒产量和产值的影响. 重辉,杨剑,彭莹. 2015

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：湖南省农业科学院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台