部分常用水稻品种的指纹图谱构建和遗传多样性分析

刘春林; 甘玉姿; 辛业芸; 《杂交水稻 》 2016 北大核心 CSCD

摘要：以不同类型的90份常用水稻品种为材料,利用筛选的19对SSR多态性引物构建了其指纹图谱,并分析了其遗传多样性。结果表明,19对SSR引物在90份水稻材料中共扩增出71个多态性片段,每个SSR位点可检测到2~7个等位基因,平均为3.74个;多态信息含量(PIC)值在0.228 3~0.790 6之间,平均值为0.542 1;Shannon信息指数(I)在0.244 9~1.796 1之间,平均值为1.021。聚类分析表明,90份材料的遗传相似系数在0.59~1之间,以遗传相似系数值0.66为阈值,可以将供试材料分成5个群,聚类结果较好地体现了各品种之间的亲缘关系。

关键词： 水稻 SSR标记 遗传多样性 指纹图谱

 全文链接 请求原文

玉米木质形成素类AGP蛋白基因家族的生物信息学分析

胡颖; 《生物技术 》 2016 北大核心 CSCD

摘要：[目的]鉴定玉米木质形成素类AGP蛋白(Xylogen-like arabinogalactan protein,XYLP)基因家族成员,并预测分析其理化性质、蛋白结构和系统发生树。[方法]采用生物信息学方法鉴定玉米XYLP成员,对其蛋白的理化性质、疏水性、亚细胞定位、系统发生树、结构域、蛋白质二/三级结构等方面进行预测和分析。[结果]从玉米基因组中共鉴定出16个ZmXYLPs基因;其蛋白产物全长在126~304氨基酸之间,理论等电点在5.53~9.18之间,不稳定系数在25.19~55.66之间,平均疏水指数在-0.098~0.698之间,主要定位在质膜上;二级结构均由α螺旋、无规则卷曲和延伸链组成,但是三级结构各不相同。[结论]ZmXYLPs多数是定位在质膜上的疏水稳定性蛋白,其中13个ZmXYLPs和At XYLPs分别聚在两个独立进化分支中。ZmXYLPs二级结构元件的比例和相继次序各不相同,其聚合角度和空间相邻关系也存在明显差异。

关键词： 玉米 木质形成素 阿拉伯半乳糖蛋白 理化性质 结构特征

 全文链接 请求原文

灰毡毛忍冬MADS-box基因家族AGL15基因的克隆、生物信息学和表达分析

蔡嘉洛; 朱贻霖; 陈林; 樊悦; 刘峰; 张亚丽; 欧阳琳; 刘湘丹; 《中草药 》 2016 北大核心 CSCD

摘要：目的基于前期对灰毡毛忍冬Lonicera macranthoides转录组测序结果,从灰毡毛忍冬RNA中克隆灰毡毛忍冬MADS-box基因家族蕾期延长相关基因AGL15,并对其进行生物信息学及表达分析。方法对灰毡毛忍冬总RNA进行反转录酶链式反应(reverse transcription-PCR,RT-PCR)和c DNA末端快速扩增反应(rapid amplification of c DNA ends,RACE),获得完整的开放阅读框(ORF)。运用生物信息学的方法对该序列进行同源性分析和相似性比较,预测编码蛋白,并对其进行各种理化性质分析。运用半定量PCR测得该基因在灰毡毛忍冬不同部位的表达情况。结果获得AGL15基因,ORF长795 bp,编码264个氨基酸,与葡萄Vitis vinifera中MADS-box基因家族AGL15基因相似性最高,且包含MADS和K-box的保守序列。AGL15蛋白无跨膜区域,定位于细胞质中,在灰毡毛忍冬各部位均有表达。结论首次从灰毡毛忍冬中克隆得到可能控制蕾期延长的基因,分析了其在灰毡毛忍冬不同部位表达差异性,为灰毡毛忍冬蕾期延长研究提供参考。

关键词： 灰毡毛忍冬 蕾期延长 基因克隆 生物信息学分析 基因表达

 全文链接 请求原文

袁隆平科学思维之我见

《科学通报 》 2016 北大核心 CSCD

摘要：在20世纪的长空里,烂如星辰的科技文明造就了许多奇迹,"东方魔稻"这一神话般的奇迹,它不仅使一个泱泱大国——中国走出了吃粮受限的低谷,而且在世界范围内也掀起了一股"绿色风暴",给不同肤色的人民带来福音.这是一个中国科学家创造的奇迹,他就是"杂交水稻之父"袁隆平,在世界农业发展史册上已定格了他的名字和成就,他的影响将延伸至21世纪或者更久更远.回顾袁隆平先生研究杂交水稻的历史,他的确走过的

 全文链接 请求原文

不同豚草防治区土表节肢动物多样性的比较

陈红松; 罗敏; 郭薇; 李敏; 《中国科学:生命科学 》 2016 北大核心 CSCD

摘要：豚草(Ambrosia artemisiifolia)是一种世界性恶性杂草,也是入侵我国的重要杂草之一,其不仅对入侵地的植物种群多样性造成极大的破坏,同时也严重危害土表节肢动物多样性.世界各国都在积极地采取各项措施控制豚草的进一步扩散和危害,其中生物防治是一种高效、安全、经济的防治措施.由此,通过小区试验比较了生物防治(广聚萤叶甲(Ophraella communa)和豚草卷蛾(Epiblema strenuana))区和化学药剂防治(农达)区内土表节肢动物多样性,并运用多样性指数、丰富度指数、优势集中性指数、均匀度指数等指标进行分析、评价.通过对70个试验小区进行8次的系统取样调查,共采集到2个纲,13个目,86个科,16838个节肢动物个体,其中弹尾目、蜘蛛目、膜翅目、同翅目等的节肢动物是优势物种,弹尾目的个体数量是各科目之最,占总个体数的35.7%.不同控制措施防治豚草,天敌昆虫豚草卷蛾和广聚萤叶甲防治小区的多样性指数、丰富度指数、均匀度指数均较化学药剂防治区和CK高,而优势集中性指数较化学药剂防治区和CK低.生物防治各小区的各项指数随时间的波动性明显较化学防治区和CK的小,两种天敌昆虫防治的高梯度小区较低梯度的波动性稍小,联合防治小区较单一天敌防治小区的波动小.可见,利用豚草天敌昆虫豚草卷蛾和广聚萤叶甲防治豚草对生态系统的节肢动物多样性具有明显的改善作用.本研究结果进一步证实了可利用天敌昆虫豚草卷蛾和广聚萤叶甲防治豚草来恢复豚草发生区的生态系统,生态学意义深远.

关键词： 豚草 广聚萤叶甲 豚草卷蛾 农达 节肢动物 多样性

 全文链接 请求原文

DEAD-box基因家族在拟南芥生长发育中的作用

彭雄波; 《植物科学学报 》 2016 北大核心 CSCD

摘要：在RNA代谢过程中,需要许多蛋白和核酸的参与,其中一类蛋白就是RNA解旋酶。RNA解旋酶通过水解ATP获得能量来参与RNA代谢的多个方面,包括核内转录、pre-mRNA的剪切、核糖体发生、核质运输、蛋白质翻译、RNA降解、细胞器内基因的表达。DEAD-box蛋白家族是RNA解旋酶中最大的亚家族,它具有9个保守结构域,因motifyⅡ的保守氨基酸序列Asp-Glu-Ala-Asp(DEAD)而命名。该家族在酵母、拟南芥(Arabidopsis thaliana Heynh.)和人类基因组中都有较多的家庭成员。近年来,研究者对拟南芥DEAD-box蛋白家族的结构和功能进行了一些研究,本文着重总结DEAD-box基因家族对拟南芥生长发育的影响。

关键词： DEAD-box 拟南芥 生长发育 RNA解旋酶

 全文链接 请求原文

单细胞技术进展及其在植物研究中的应用

孙蒙祥; 《植物科学学报 》 2016 北大核心 CSCD

摘要：多细胞生物体的生存依赖于不同类型细胞特异性的功能分工,不同类型的细胞尽管基因组相同,但有其独特的发育过程和应对环境变化的能力。生物学的一大挑战就是揭示基因如何在正确的位置、正确的时间表达到正确的水平,最近出现了很多通过细胞类型特异性方法研究单细胞组学的工具,这些新技术使我们能通过空前分辨率,理解多细胞生物体内不同类型的单个细胞基因表达特点及其适应环境变化的机制。单细胞样品的获取一直是单细胞研究的一大技术瓶颈,因此本文将以如何获得起始材料为重点,探讨单细胞研究的样品标记、单细胞分离及获取、组学数据分析和结果验证等技术方法及其在植物研究中的应用。

关键词： 细胞类型特异性 荧光激活细胞分离 激光显微切割 微流控芯片 单细胞技术

 全文链接 请求原文

新邵县超级杂交稻“种三产四”丰产工程示范推广的实践

陈石桥; 彭既明; 《杂交水稻 》 2016 北大核心 CSCD

摘要：2009—2015年超级杂交稻"种三产四"丰产工程在新邵县实施7 a,为水稻超高产栽培展示了广阔的前景。总结了成功经验与高产栽培技术。

关键词： 超级杂交稻 “种三产四” 丰产工程 示范 栽培技术

 全文链接 请求原文

甘蓝型油菜GPAT9基因克隆与生物信息学分析

刘少锋; 邬贤梦; 官春云; 熊兴华; 《分子植物育种 》 2016 北大核心 CSCD

摘要：GPAT9基因是参与植物体中油脂代谢的重要基因之一,在甘蓝型油菜中该基因还未被深入研究。为了研究甘蓝型油菜中GPAT9基因,通过查找拟南芥At GPAT9基因(At5G60620),并以At GPAT9基因编号到Brassica Database数据库检索到白菜、甘蓝GPAT9基因序列,然后对拟南芥、白菜和甘蓝GPAT9序列进行比对。根据比对结果设计出一对引物,从甘蓝型油菜湘油15中克隆得到一条长度为1 131 bp大小的GPAT9 CDs序列,将其命名为Bn GPAT9。Bn GPAT9基因共编码376个氨基酸,相对分子量为43.25 k D,等电点为8.97,不稳定系数为46.46;Bn GPAT9编码的蛋白有三个跨膜结构域,没有信号肽;该蛋白的二级结构中α螺旋为38.03%,β折叠为21.28%,β转角为9.04%,无规则卷曲为31.65%。分析表明:无论核苷酸序列还是氨基酸序列聚类均显示Bn GPAT9与拟南芥、白菜和甘蓝GPAT9亲缘关系近;Bn GPAT9具有溶血磷脂酰基转移酶(LPLAT)的结构域LPCAT1-like和GPAT9特有的活性位点。从序列分析、理化性质分析、二级结构预测、亚细胞定位和功能结构域分析等都表明克隆到的基因为甘蓝型油菜Bn GPAT9基因,属于GPAT基因家族成员。

关键词： 甘蓝型油菜 GPAT9 基因克隆 生物信息学

 全文链接 请求原文

红莲型细胞质雄性不育的发现利用研究及展望

朱仁山; 李绍清; 李阳生; 余金洪; 黄文超; 朱英国; 《科学通报 》 2016 北大核心 CSCD

摘要：自杂交水稻研究50年来,红莲型杂交水稻采取基础研究、应用研究、产业化相结合的模式为杂交水稻事业的发展做出重要贡献.红莲型细胞质雄性不育基因orf H79位于线粒体基因atp6下游,编码79个氨基酸,具细胞毒性,与电子传递链复合体Ⅲ的蛋白亚基互作,机理研究结果表明这种互作可能引起ROS的上升而导致花粉败育.对两个育性恢复基因Rf5,Rf6的研究结果表明,这两个PPR基因均不能与不育基因转录本直接互作,其中RF5与GRP162及RFC3等蛋白互作,以蛋白复合体的形式加工不育基因转录本,而RF6与HXK6互作,形成新的蛋白复合体,二者育性恢复通路各自独立.以不育基因orf H79为分子标记,创制出一批新的红莲型细胞质不育系;以恢复基因Rf5,Rf6为分子标记,筛选出一批双恢复基因强恢复系,选育出高产优质多抗广适红莲型杂交水稻新组合红莲优6,粤优938和珞优8号等.红莲型杂交稻在中国长江流域、华南稻区大面积推广种植,同时在越南、印度尼西亚、马来西亚、孟加拉和菲律宾等东南亚国家引种推广并表现优异,展现出广阔的应用前景.

关键词： 杂交水稻 红莲型 细胞质雄性不育 育性恢复 种质创新

 全文链接 请求原文