科研产出
醇类化合物对欧洲林蛙蝌蚪毒性的QSAR研究
《山东农业科学 》 2017
摘要：采用分子描述符计算软件PCLIENT获得123个醇类有机小分子化合物的1 666个理化性质参数,通过相关性分析与逐步线性回归筛选,最终获得14个分子描述符。基于保留的14个关键理化性质,分别以多元线性回归(MLR)、偏最小二乘回归(PLS)与支持向量回归(SVR)构建醇类化合物对欧洲林蛙蝌蚪毒性的QSAR模型。结果表明:3种模型的独立预测决定系数Q2从初始的-163.350、-0.019、0.686分别提升到0.860、0.903与0.936,剔除无关描述符能显著提升模型的预测精度;基于SVR的训练拟合精度和独立预测精度均较好,表明其泛化能力强,鲁棒性好;SVR模型独立测试集预测值和真实值比较结果证明最终筛选出的14个描述符具有较好的显著性,模型具有较好的稳健性。本方法在有毒化合物等QSAR研究领域有较广泛应用前景。
关键词： 醇类化合物 欧洲林蛙蝌蚪 描述符筛选 支持向量回归 定量构效关系
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基于均匀设计与支持向量回归的柑桔大实蝇成虫诱杀剂配方优化
《中国南方果树 》 2017 北大核心
摘要：以柑桔大实蝇Bactrocera minax雌成虫为对象,借助Y型嗅觉仪,采用均匀设计和支持向量回归方法,对由柠檬烯、乙酸、乙酸乙酯、红糖、乙醇、柠檬酸、橙汁和5%高效氯氟氰菊酯水乳剂组成的诱杀剂进行了优化。结果表明,经过共20个处理的两轮室内筛选即准确地找到最优配比,将诱杀剂对柑桔大实蝇雌虫的引诱率由改进前的50.0%提高到76.7%,优化效果明显。同时发现,在引诱成分中,柠檬烯、柠檬酸和乙酸具有更加重要的作用,单位配方(按100mL水溶剂计)的最适用量分别为1.50mL、1.00g和1.00mL。
关键词： 柑桔大实蝇 诱杀剂 Y型嗅觉仪 均匀设计 支持向量回归 配方优化
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基于均匀设计与支持向量回归的莲子皮原花青素提取研究
《粮食加工 》 2016
摘要：以莲子皮中的原花青素为对象,以研究室前期发展的多因素多水平配方优化实验设计与分析方法 UDSVR为指导,以原花青素提取的单因素试验的初始条件为基础,对溶剂体积分数、提取温度、提取时间、质量浓度和pH值5个因素进行优化,经过2轮36组试验,获得了莲子皮原花青素提取率的满意配方,使单因素试验中原花青素提取率由初始值2.9%提高到了5.87%,UD-SVR明显优于参比模型,且预测精度高、指导性强、可解释性好,该提取条件的获得不但再次证实了UD-SVR方法的可行性和高效性,同时也为莲子皮中原花青素的深入研究奠定了前期基础。
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多肽一级结构表征与抗菌肽QSAM建模
《高等学校化学学报 》 2012 SCI 北大核心
摘要：从整体上考虑多肽一级结构,提出了3种仅基于多肽氨基酸序列、计算简便、适于不等长肽和可捕获多肽上下文关联特征的多肽新描述子,即地统计学关联(GS-AA531)描述子、多尺度组分与关联(MSCC)描述子和地统计学关联与多尺度组分(GS-AA531-MSC)描述子.将其应用于2个抗菌肽体系(等长肽与不等长肽)的结构表征,并以支持向量回归建立QSAM模型.模型的拟合、留一法及独立测试结果表明,结合特征筛选的新描述子GS-AA531与GS-AA531-MSC的预测精度明显稳定且优于其它参比描述子,在多肽QSAM研究中具有广泛应用前景.
关键词： 结构表征 定量序效模型 抗菌肽 支持向量回归 特征筛选
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在QSAR中应用SVR的非线性组合预测
《计算机与应用化学 》 2009 北大核心 CSCD
摘要：为提高定量构效关系(quantitative structure-activity relationship,QSAR)模型预测的精度,以支持向量回归(support vector regression,SVR)全局与局部核函数,发展出1种非线性组合方法GK-LK-SVR,其基本思路为:依均方误差(MSE)最小原则,分别基于SVR的全局与局部核函数筛选描述符后预测,实测值与不同核函数的预测值组合成混合样本,然后再依MSE最小原则基于SVR对混合样本实施核函数寻优及子模型筛选,最后以留一法完成预测。对2种化合物QSAR建模结果表明:GK-LK-SVR方法预测精度高,有望在QSAR研究中得到广泛应用。
关键词： 非线性组合预测 定量构效关系 支持向量回归 全局核函数 局部核函数
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