科研产出
甘薯种质资源花青素积累的遗传多态性分析
《植物遗传资源学报 》 2019 北大核心 CSCD
摘要：甘薯种质资源中花青素的积累呈现极为丰富的形态学多态性,作为花青素天然原料开发具有明显的优势,因而开展花青素积累的遗传多态性研究对优质专用型甘薯新品种的选育具有重要参考意义。本研究以66份来源不同的甘薯种质资源为材料,分析了不同生长位点之间花青素积累的关联性,并针对主要花青素合成基因设计TRAP等分子标记,探索了该表型多态性产生的原因。结果表明:(1)甘薯薯块和叶片的花青素积累性状在形态学上相对独立,与其他生长位点无必然关系;薯皮色、须根色与须根根原基色之间紧密关联。(2)TRAP分子标记分析表明花青素合成途径IbCHS、IbDFR等基因在甘薯基因组中存在多个拷贝,不同种质资源之间存在较大遗传多态性差异;转录因子IbMYB1-2a/b仅与薯块花青素积累直接相关,且并非所有紫心甘薯存在IbMYB1-2a/b基因。(3)研究筛选出CHSRV1/AN4引物组合为较理想的TRAP分子标记,能较好地区分66份甘薯种质资源,相对于形态学标记,其聚类分析图能更客观地反映甘薯种质资源之间的遗传关系。本研究为培育茎叶菜用型和紫心甘薯新品种提供了研究基础,也为追溯紫心甘薯起源提供了重要线索。
关键词： 花青素积累 遗传多态性 形态学多态性 TRAP分子标记 聚类分析
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四个杂交水稻骨干恢复系的多态性分析
《福建农业学报 》 2014
摘要：选取均匀分布于水稻12条染色体上的134对SSR(Simple Sequence Repeats,SSR)标记,对明恢63、明恢86、航1号和航2号等4个具有相似遗传背景的水稻骨干恢复系进行遗传多态性分析。结果表明,经航天诱变选育的"航1号、航2号"与原种明恢86之间存在不同程度的遗传多样性。在筛选的134对SSR引物中,具有多态性标记为39对,多态性频率为29.10%。每个标记位点的平均等位基因数为2.10个,变幅为1~4个,平均多态性信息含量指数(PIC)为0.37。聚类分析结果表明,当以0.87为阀值时可将航天诱变选育的"航1号、航2号"与原种"明恢86"区分开。其中在标记RM234两侧邻近的7个含有重要基因区段的SSR标记中有5个标记存在多态性,表明明恢86在航天诱变过程中可能在具有重要生物学功能的基因座发生了突变,再经系统选育成航1号、航2号优良恢复系,为航天诱变中因发生有利变异而选育新品种提供分子证据。
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辣椒多态性EST-SSR标记开发及连锁图谱构建
《湖南农业大学学报(自然科学版) 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：采用SSR检索程序,从辣椒221 037条unigenes中筛选到17 319个SSR位点,设计了10 468对引物,并对其进行E-PCR多态性检测。结果表明,1 538对引物具有多态性,其中554条辣椒EST序列能匹配到番茄基因组上,构成了12条辣椒EST-SSR连锁群,平均每条连锁群含45.75个EST-SSR。对匹配到番茄基因组上的EST-SSR进行GO(gene ontology)分类,结果有481条EST序列被分类,其中以初生代谢、细胞代谢、生物合成过程为主,分别占34.13%、28.35%、25.82%。在KEGG map中,91条EST序列共涉及到76条代谢途径(KEGG),约67条序列参与新陈代谢途径,32条序列参与次生代谢产物合成途径。
湖南省部分柚及近缘种遗传多态性的SRAP分析
《经济林研究 》 2009
摘要：采用新型分子标记SRAP技术对湖南省32份柚类及近缘种进行遗传多态性分析。筛选110对引物,选取稳定的12对引物扩增基因组DNA,各引物组合产生10～23条扩增带,共获得172条带,其中150条为多态性条带,每对引物平均提供12.5个标记信息。由UPGMA方法得到的聚类分析结果表明SRAP标记是一种能够较好的区分柚类种质的分子标记。
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