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辣椒多态性EST-SSR标记开发及连锁图谱构建

文献类型： 中文期刊

作者： 谢玲玲 1 ; 欧阳娴 2 ; 王运生 3 ; 邹学校 2 ;

作者机构： 1.湖南省农业科学院西瓜甜瓜研究所

2.湖南省农业科学院蔬菜研究所

3.湖南农业大学生物安全科学技术学院

关键词： 辣椒;多态性;连锁图谱;表达序列标签技术;简单重复序列

期刊名称： 湖南农业大学学报(自然科学版)

ISSN： 1007-1032

年卷期： 2012 年 38 卷 02 期

页码： 162-167

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用SSR检索程序,从辣椒221 037条unigenes中筛选到17 319个SSR位点,设计了10 468对引物,并对其进行E-PCR多态性检测。结果表明,1 538对引物具有多态性,其中554条辣椒EST序列能匹配到番茄基因组上,构成了12条辣椒EST-SSR连锁群,平均每条连锁群含45.75个EST-SSR。对匹配到番茄基因组上的EST-SSR进行GO(gene ontology)分类,结果有481条EST序列被分类,其中以初生代谢、细胞代谢、生物合成过程为主,分别占34.13%、28.35%、25.82%。在KEGG map中,91条EST序列共涉及到76条代谢途径(KEGG),约67条序列参与新陈代谢途径,32条序列参与次生代谢产物合成途径。

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