科研产出
枯草芽孢杆菌Ya-1对辣椒枯萎病的防治及其对根际真菌群落的影响
《生物技术通报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：探究生防菌枯草芽孢杆菌Ya-1对辣椒枯萎病的防治效果，及对辣椒受尖孢镰刀菌侵染后根际真菌群落和多样性的影响。以枯草芽孢杆菌Ya-1为接种菌，探究了枯草芽孢杆菌Ya-1对辣椒枯萎病的防治效果，并通过高通量测序研究了接种前，接种后10 d,20 d时受尖孢镰刀菌侵染后辣椒根际真菌群落变化。与FOC处理（C）相比，Ya-1+FOC（D）在第10天和第20天的相对防治效果分别为77.93%和77.26%。同时接种枯草芽孢杆菌Ya-1和辣椒枯萎病菌组真菌α多样性在10 d和20 d时真菌香农指数均高于接种辣椒枯萎病菌组。在进行处理后真菌群落组成发生了显著变化，同一时间点处理组和对照组真菌群落具有显著差异，接种辣椒枯萎病菌组和同时接种辣椒枯萎病菌和枯草芽孢杆菌Ya-1组也具有显著差异（P ＜0.05）。各处理土壤优势真菌种群分别为子囊菌门、接合菌门、担子菌门。在10 d和20 d，接种病原菌（OTU＿1）相对丰度在接种辣椒枯萎病原菌组和同时接种辣椒枯萎病菌组和枯草芽孢杆菌Ya-1组间具有显著差异，相比较接种辣椒枯萎病原菌组，OTU＿1相对丰度降低，被孢霉菌（Mortierella）的相对丰度升高。相比较对照组，接种辣椒枯萎病菌处理后连接数减少，而在加入枯草芽孢杆菌Ya-1处理后，正连接数降低。枯草芽孢杆菌Ya-1处理对辣椒枯萎病有较好的防治效果，同时它也改变了接种病原菌辣椒根际真菌群落多样性和结构，降低了真菌群落的复杂度和根际土壤中病原菌的丰度。
关键词： 枯草芽孢杆菌 辣椒枯萎病 微生物群落 辣椒 根际 真菌
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镉污染对稻田土壤真菌群落结构及多样性的影响
《南方农业学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：[目的]探究镉胁迫对稻田土壤真菌群落结构及其多样性的影响,为阐释镉胁迫对稻田土壤微生物多样性的影响机制提供科学依据.[方法]以湖南某镉矿周边3个镉污染程度(高、中和低)的稻田土壤为研究对象,采集土壤样品,测定土壤养分含量,利用Illumina MiSeq高通量测序技术探究土壤真菌群落结构,对比分析不同镉污染组土壤真菌群落多样性和群落结构差异.[结果]稻田土壤的真菌α多样性随着镉污染水平升高逐渐降低,高镉组(总镉含量>3.0 mg/kg)α多样性显著低于中镉组(总镉含量0.3~3.0 mg/kg)和低镉组(总镉含量?3.0 mg/kg)(P?0.05,下同),但中镉组和低镉组之间的差异较小.高镉组与中、低镉组土壤样品间真菌群落具有显著差异.在门水平上,子囊菌门(Ascomycota)、担子菌门(Basidiomycota)和被孢霉门(Mortierellomycota)在所有样品组中均属优势菌门,相对丰度在51.09%~81.93%.韧伞属(Hypholoma)、篮状菌属(Talaromyces)、Meliniomyces属在高镉组的相对丰度显著高于中镉组和低镉组,可能是潜在的耐镉菌.有机质、pH、碱性氮、有效磷、有效钾、总磷、总镉及有效镉均与土壤真菌群落结构呈极显著正相关(P?0.01).[结论]高浓度镉污染可降低稻田土壤真菌群落α多样性并改变土壤真菌群落结构.pH、碱性氮、有效磷、有效钾、总磷、有机质、总镉及有效镉均与土壤真菌群落结构显著相关,是影响土壤真菌群落结构的主要驱动因子.
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氮肥减施对茶园土壤细菌群落结构的影响研究
《生物技术通报 》 2021 北大核心 CSCD
摘要：为了研究不同减氮模式对茶树地下部分细菌菌落结构的影响。设置16 kg/667 m2纯氮（减氮55.6%处理A）,26 kg/667 m2纯氮（减氮27.8%处理B）,36 kg/667 m2纯氮（常规施肥C）,不施氮（CK）共4个施氮水平,对根际及非根际0-20 cm土壤、非根际20-40 cm土壤36个样品进行16S rRNA序列测定,利用IonS5TMXL高通量测序平台对不同减氮处理的土壤细菌群落结构进行分析。试验结果表明:A、B、C三种施肥水平下,根际、非根际0-20 cm土壤及非根际20-40 cm土壤的细菌OTUs分别为505、854及835个,其中特异OTUs随着施氮量逐渐增加而降低。土壤细菌丰度和多样性分析显示施氮量为26 kg/667 m2（减氮处理B）在根际与非根际0-20 cm土壤中细菌丰度较高,细菌多样性最高,土壤碳通量的结果亦证明了减氮处理B土壤中微生物较多。施肥茶园地下部分在门水平上的优势菌基本为氮代谢相关菌类,其中共有3个优势类群,分别为变形菌门（Proteobacteria）、放线菌门（Actinobacteria）、绿弯菌门（Chloroflexi）。在属的水平上,根际土壤与非根际土壤细菌优势菌完全不同。适当减氮处理B茶园土壤中细菌菌落多样性较多,丰度较高,并主要集中在养分吸收利用的根际及周边土壤中,有利于茶园养分的高效利用。
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牛粪堆肥纤维素高效降解菌的筛选和应用
《湖南农业科学 》 2018
摘要：为解决牛粪堆肥过程中纤维素难以降解的难题,通过采用羧甲基纤维素筛选平板和刚果红染色的方法,筛选得到了1株高效降解纤维素的细菌X7,其纤维素酶活达40.02±2.87 U/mL,经鉴定为解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)。将降解菌X7配合堆肥接种剂应用于牛粪堆肥中,检测其降解和堆肥促进效果,结果表明:降解菌能提升堆肥温度,使堆肥最高温度达74℃,堆肥高温期持续16 d;添加降解菌X7后堆肥结束时的腐殖质总量达69.3 g/kg,有效提升了堆肥品质,纤维素降解率为43.51%,对照组的降解率仅为11.57%。纤维素高效降解菌X7在牛粪堆肥及纤维素降解应用方面有较大潜力。
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杨梅贮藏期真菌的分离鉴定及基于ITS序列的聚类分析
《食品安全质量检测学报 》 2018
摘要：目的分离幵鉴定杨梅贮藏期真菌。方法通过稀释涂布平板分离法以及划线纯化,从贮藏期杨梅果实中分离、纯化真菌菌种,幵结合传统形态学与ITS (internal transcribed spacer)全序列分析对其进行准确鉴定。结果最终鉴定出共14株真菌,其中1株毛霉(Mucorracemosus)、1株白地霉(Geotrichumcandidum)、1株腐皮壳属霉菌(Diaporthesp.)、1株好食链孢霉(Neurosporasitophila)、3株出芽短梗霉(Aureobasidium pullulans)、 4株酵母菌(Pichiakudriavzevii,Pichiaterricola,Hanseniasporaopuntiae,Saccharomycopsis crataegensis)以及3株青霉(Penicillium sp., Penicillium expansum, Penicillium herquei)。从进化关系上看有3类显示较近的亲缘关系,第1类为青霉属,第2类为出芽短梗霉,第3类为毕赤酵母。结论结合传统形态学与ITS全序列分析可对杨梅贮藏期真菌进行更为准确的鉴定。
关键词： 杨梅 贮藏期 真菌 ITS序列分析 聚类分析 分离 鉴定
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基于高通量测序的超级稻不同生育期土壤细菌和古菌群落动态变化
《农业现代化研究 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：为阐明超级稻生长不同生育期土壤细菌和古菌群落特征及其影响因素,选取湖南高产区(湖南隆回)和低产区(湖南宁乡)两个水稻种植区,利用Illumina Mi Seq高通量测序技术分别对超级稻移栽前,分蘖期、抽穗期、收获期的稻田土壤进行16S r DNA分析,并解析土壤性质对细菌和古菌群落的影响。结果表明:高产生态区土壤微生物多样性在超级稻生育期显著大于移栽前(P<0.05),而低产生态区各时期间差异不显著(P>0.05)。两个生态区的共同优势细菌为Proteobacteria、Acidobacteria、Chloroflexi和Verrucomicrobia,而Bacteroidetes只是高产区的优势细菌类群。Chloroflexi在低产区相对丰度显著大于高产区(P<0.05),Bacteroidetes和Proteobacteria的相对丰度则在高产区显著大于低产区(P<0.05),Acidobacteria和Verrucomicrobia的相对丰度在两种生产区差异不显著(P>0.05)。低产区古菌数量显著大于高产区(P<0.05),是高产区的2.8~5.5倍。低产区和高产区相对优势古菌群分别是泉古菌门(Crenarchaeota)和广古菌门(Euryarchaeota)。随生育期的变化,Crenarchaeota、Euryarchaeota、Acidobacteria和Verrucomicrobia的相对丰度呈先减少后增加的趋势,Bacteroidetes和Proteobacteria呈下降趋势,Chloroflexi呈先上升后降低的趋势。RDA分析表明,Proteobacteria的动态变化主要受土壤有机质含量影响,而Bacteroidetes主要受土壤速效磷驱动。高产区和低产区细菌和古菌群落动态变化的主控因子分别是土壤速效氮和速效磷。研究表明,超级稻高产和低产生态区土壤细菌和古菌群落结构差异明显,且随生育期有一定变化,说明土壤速效养分含量是影响土壤细菌和古菌群落的主要因素。
关键词： 超级稻 细菌 古菌 高通量测序 高产区 低产区 生育期
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湖南省水稻推广品种种子寄藏真菌检测
《作物研究 》 2017
摘要：为明确湖南省目前水稻推广品种种子携带真菌情况,本试验通过保湿培养结合镜检的方法对150个湖南推广的品种种子带菌情况进行了调查。结果表明:常规稻种子中带菌率最低的是‘黄华占’,仅0.18%,带菌率最高的是‘湘早籼17号’,为6.35%;两系杂交稻种子中‘八两优18’和‘奥两优69’带菌率最低,均为0.27%,‘株两优819’带菌率最高,为7.13%;三系杂交稻种子‘益优701’、‘金优463’和‘中优177’均不带菌,‘珞优8号’品种带菌率最高达11.65%。从种子带菌部位来看,颖壳带菌率远远高于米粒。检出的种子携带的寄生菌有胡麻斑菌、鞘腐菌、黑粉菌、弯孢霉、镰刀菌、黑孢霉,未检出稻瘟病菌;检出的种子携带的腐生菌有毛霉、曲霉、青霉、链格孢等。这些种子携带的真菌有可能作为病害的初侵染来源或在水稻育秧期间造成烂秧。
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表达dsRNA的细菌提取液可抑制黄瓜花叶病毒对烟草的侵染
《植物病理学报 》 2008 北大核心 CSCD
摘要：利用RT-PCR分别克隆了CMV P3613株系的RNA2片段、MP(movement protein)基因片段及CMV AN株系的CP(coat protein)基因片段。以CP基因为中间间隔序列,分别构建了含有RNA2片段和MP基因反向重复片段的原核表达载体。体外转录试验表明:两个载体转录后都能形成预期大小的dsRNA。经过IPTG诱导,在大肠杆菌HT115(DE3)菌株中可表达产生预期大小的核酸片段,经DNase和RNaseA消化处理,证实为dsRNA。将表达病毒基因dsRNA的细菌超声破碎后处理烟草,进行保护和治疗试验,结果表明:表达CMV MP基因和RNA2片段dsRNA的细菌破碎液能够诱导烟草对CMV产生抗性。接种病毒60d后,保护效果试验病株率分别为45%和60%,治疗效果试验病株率分别为75%和85%,而其他对照发病率均为100%。本研究结果证明了利用RNA沉默的原理,构建具有反向重复序列的原核表达载体,用细菌表达dsRNA的粗提取物可防治CMV对烟草的侵染。
关键词： 黄瓜花叶病毒 RNA沉默 双链RNA表达 细菌 保护 病毒侵染
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