科研产出
柑橘香橙素生成途径关键酶黄烷酮-3-羟化酶特性分析及原核表达
《食品科学技术学报 》 2021
摘要：香橙素是柑橘类黄酮的重要组成,黄烷酮-3-羟化酶是香橙素生成途径中的关键作用酶。对黄烷酮-3-羟化酶的特点进行总结与分析并在大肠杆菌中进行表达。首先从NCBI数据库筛选了来自柑橘、陆地棉、玉米、水母雪莲和欧芹的5种f3h,对其进行理化性质、蛋白质二三级结构、序列比对等生物信息学分析并以大肠杆菌为宿主进行表达。发现5种来源的f3h,其基因开放阅读框为1 032～1 119 bp,编码343～372个氨基酸,蛋白分子质量为38.89～41.45 kDa,理论等电点在5.43～5.96,且不同物种F3H的理化性质、结构域和蛋白质结构也有一定的相似性。通过构建大肠杆菌表达体系发现:黄烷酮-3-羟化酶均能进行原核表达,除去来源于水母雪莲的F3H未检测到香橙素的生成,其余4种F3H均能将柚皮素转化为香橙素且产物生成量不同,其中ZmF3H生成量最高达20.12mg/L。
关键词： 柑橘 黄烷酮-3-羟化酶 生成途径 特征分析 原核表达
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辣椒热激蛋白HSP90家族基因鉴定及分析
《园艺学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：借助生物信息学工具对辣椒热激蛋白HSP90家族基因进行鉴定,并分析其理化性质、结构特征、系统进化关系以及在各组织器官和高温胁迫下的表达模式.结果表明,辣椒基因组中含有7个HSP90家族基因,分布于5条染色体上,内含子数2~19不等,含有5个保守基序;系统进化关系分析显示辣椒7个HSP90家族基因分为3组;亚细胞定位结果显示辣椒HSP90蛋白定位于细胞质与内质网中;基于已发表的转录组数据进行组织表达分析,HSP90在不同组织中的表达模式不同;高温处理可不同程度地激活HSP90的表达.
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辣椒EST-SSR位点的鉴定和特征分析
《江苏农业学报 》 2011 北大核心 CSCD
摘要：SSR标记因数量丰富、多态性高、重复性好、在基因组上分布均匀,以及呈共显性遗传等特点而被广泛地应用于遗传育种研究[1]。随着功能基因组学的发展,公共序列数据库中的EST(表达序列标签)数量在不断增加,为SSR标记的鉴定和开发提供了丰富的序列资源。对拟南芥、水稻等模式作物基因组的全序列分析结果表明,SSR位点在转录区的发生频率要远高于非转录区[2-3]。因此,利用EST序列开发SSR标记,具有开发过程简单、成本低、效率高等优点[4]。
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