辣椒EST-SSR位点的鉴定和特征分析

孔秋生; 陈文超; 张竹青; 邹学校; 《江苏农业学报 》 2011 北大核心 CSCD

摘要：SSR标记因数量丰富、多态性高、重复性好、在基因组上分布均匀,以及呈共显性遗传等特点而被广泛地应用于遗传育种研究[1]。随着功能基因组学的发展,公共序列数据库中的EST(表达序列标签)数量在不断增加,为SSR标记的鉴定和开发提供了丰富的序列资源。对拟南芥、水稻等模式作物基因组的全序列分析结果表明,SSR位点在转录区的发生频率要远高于非转录区[2-3]。因此,利用EST序列开发SSR标记,具有开发过程简单、成本低、效率高等优点[4]。

关键词： 辣椒 EST SSR 鉴定 特征分析