科研产出
拟南芥和番茄斑萎病毒NSs蛋白互作的转录组分析
《分子植物育种 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为了研究番茄斑萎病毒NSs蛋白在番茄斑萎病毒与植物互作中发挥的作用，本研究以转NSs基因拟南芥和生态型拟南芥为研究对象，使用Illumina RNA-seq测序平台进行转录组测序，利用生物信息学方法分析NSs对植物转录水平影响。结果显示，转基因和生态型拟南芥共有1 258个差异表达基因。其中966个差异表达基因富集到Gene Ontology (GO)，主要涉及细胞组分、代谢过程和酶活性等功能。517个差异表达基因富集到KEGG通路中，NSs主要降低了苯丙烷生物合成、植物激素信号转导、植物病原体相互作用等通路基因的表达，这些通路都与植物防御病原微生物侵染相关。101个差异表达基因被鉴定为转录因子，分属于39个转录因子家族，包括调控苯丙烷生物合成的MYB家族和调控生长素信号转导AUX/IAA转录因子家族。研究发现，NSs蛋白与拟南芥的互作是一个复杂的过程，NSs影响了拟南芥的次生代谢、激素调节、防御反应等多项生物功能，这为后续深入研究NSs在番茄斑萎病毒与宿主植物互作中发挥的作用以及番茄斑萎病毒的防治提供参考依据。
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细胞色素P450酶CYP3A4与双酚A的相互作用研究
《分析科学学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：通过光谱法与计算机模拟,研究了细胞色素P450酶CYP3A4与双酚A(BPA)之间的相互作用.光谱实验结果表明,随着BPA浓度的增加,CYP3A4-BPA荧光强度增加,紫外吸收峰上升且伴随红移现象.计算实验的热力学参数发现ΔG<0,即反应可以自发进行;ΔH>0、ΔS>0说明疏水作用力为二者间的主要作用力.同时研究发现,作用后蛋白质的构象发生了变化,β-折叠与无规则卷曲的含量降低,β-转角与β-反向平行的含量升高.分子对接与分子动力学模拟相互印证,进一步分析了CYP3A4与BPA之间的结合空腔,以及结合过程中蛋白质构象发生的变化.
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增苗节氮对晚稻生物学特性及产量的影响
《湖南农业科学 》 2020
摘要：针对目前湖南部分地区水稻生产中氮肥施用过量的问题,以湘晚籼12号为试验材料,设置以施氮量为主区、抛栽密度为副区的裂区试验,分析两因素及其互作对晚稻生产的影响.结果表明:施氮量与抛栽密度的交互作用不显著,但对水稻产量有较大影响;在施氮量9 kg/667m~2、抛栽密度2.6万株/667m~2模式下,晚稻理论产量最高,为572.29 kg/667m~2;通过二次多项式回归分析施氮量、抛栽密度密度与产量间的关系可知,产量最高为562.26 kg/667m~2时,对应的施氮量为10.33 kg/667m~2、抛栽密度为2.6万株/667m~2,比常规施氮量节省13.92%.这说明合理减少氮肥用量、提高抛秧密度可实现水稻稳产、氮肥高效利用.
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基于分子模拟和光谱法分析漆酶与甲酚的相互作用
《分析测试学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：该文运用计算模拟与光谱法研究了甲酚与漆酶的相互作用。首先,计算模拟表明漆酶与3种甲酚同分异构体都能发生相互作用,分子对接研究结果表明漆酶与甲酚同分异构体能以氢键和疏水作用力相结合,且结合位点相似。通过分子动力学模拟比较漆酶结合甲酚前后残基的柔性差异,验证了分子对接结合位点的可靠性。其次,选取计算模拟中结果较好的间甲酚,利用光谱法探究间甲酚与漆酶的荧光猝灭机制及结合前后漆酶二级结构的变化。荧光猝灭实验证实漆酶与间甲酚间是形成非荧光复合物的静态猝灭,与分子对接结果一致。红外光谱研究结果表明,漆酶与间甲酚结合后二级结构发生变化,其内部的β-转角和β-反向平行结构向β-折叠、无规则卷曲和α-螺旋结构转化,这与分子动力学模拟结果相呼应。该研究为利用漆酶转化环境中甲酚污染物提供了理论基础与数据支持。
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耕作方式和稻草还田对双季稻田CH4和N2O排放的影响
《农业工程学报 》 2014 CSCD
摘要：稻田温室气体(甲烷和氧化亚氮)排放强度受多种田间管理的影响,以往对各种措施间的交互效应研究较少。为此,该研究利用改进的静态箱-气相色谱法进行了连续4个生长季的湖南典型双季稻田温室气体排放强度观测,旨在分析耕作和稻草还田2种措施的交互效应并探寻多措施联合减缓温室气体排放强度的途径。试验设4个处理:翻耕(CWS,conventional tillage without straw residue)、免耕(NWS,no till without straw residue)、免耕高茬还田(HN,no till with high stubble straw residue)和翻耕高茬还田(HC,conventional tillage with high stubble straw residue)。结果表明,耕作和稻草还田2种措施对稻田甲烷排放有显著的交互效应(P<0.05),但对氧化亚氮交互效应不显著。2种措施对稻田温室气体排放强度的影响有明显的季节和年际变异。多生长季平均而言,各处理甲烷排放顺序为HC>HN>CWS>NWS(HC显著高于HN,HN和CWS差异不显著),水稻产量顺序为CWS>HN>HC>NWS(HN和CWS差异不显著),而温室气体排放强度(greenhouse gas intensity)顺序为HC>CWS>HN>NWS(HN显著低于HC和CWS,P<0.05)。可见,“免耕高茬还田”模式能抵消翻耕处理的高温室气体排放,并能比 NWS 处理提高水稻产量,显著减缓双季稻田温室气体排放强度。在保护性耕作和农田碳库提升的需求下,该模式应被予以高度重视。该研究可为中国双季稻主产区温室气体排放强度减缓措施的选择提供科学支撑。
耕作方式和稻草还田对双季稻田CH_4和N_2O排放的影响
《农业工程学报 》 2014 EI 北大核心 CSCD
摘要：稻田温室气体(甲烷和氧化亚氮)排放强度受多种田间管理的影响,以往对各种措施间的交互效应研究较少。为此,该研究利用改进的静态箱-气相色谱法进行了连续4个生长季的湖南典型双季稻田温室气体排放强度观测,旨在分析耕作和稻草还田2种措施的交互效应并探寻多措施联合减缓温室气体排放强度的途径。试验设4个处理:翻耕(CWS,conventional tillage without straw residue)、免耕(NWS,no till without straw residue)、免耕高茬还田(HN,no till with high stubble straw residue)和翻耕高茬还田(HC,conventional tillage with high stubble straw residue)。结果表明,耕作和稻草还田2种措施对稻田甲烷排放有显著的交互效应(P<0.05),但对氧化亚氮交互效应不显著。2种措施对稻田温室气体排放强度的影响有明显的季节和年际变异。多生长季平均而言,各处理甲烷排放顺序为HC>HN>CWS>NWS(HC显著高于HN,HN和CWS差异不显著),水稻产量顺序为CWS>HN>HC>NWS(HN和CWS差异不显著),而温室气体排放强度(greenhouse gas intensity)顺序为HC>CWS>HN>NWS(HN显著低于HC和CWS,P<0.05)。可见,"免耕高茬还田"模式能抵消翻耕处理的高温室气体排放,并能比NWS处理提高水稻产量,显著减缓双季稻田温室气体排放强度。在保护性耕作和农田碳库提升的需求下,该模式应被予以高度重视。该研究可为中国双季稻主产区温室气体排放强度减缓措施的选择提供科学支撑。
水稻抗瘟性分类及品种与病菌谱系互作
《湖南农业大学学报(自然科学版) 》 2005 北大核心 CSCD
摘要：选用两对引物XLRRfor/XLRRrev和S1/AS3对23个水稻品种进行RGA-PCR指纹聚类分析,以80%的相似性可将23个品种分成9类;进一步对这23个品种进行抗瘟性表型聚类分析.结果表明,虽然两种方法划分的品种组别数相同,有2个组别的品种组成也相同,但多数组别的品种组成有差异,即存在R-基因与抗性表型不一致的现象.因此,RGA-PCR指纹分析法与传统的抗性表型鉴定法相结合才能获得准确、可靠的抗性信息.品种RGA和抗性表型相似组别与病菌谱系之间没有明确的对应关系,但就单个品种而言,某些品种与一些病原菌谱系出现即皆亲和或皆非亲和的互作现象.
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水稻近等基因系与白叶枯病菌互作的生理指标研究
《植物保护学报 》 1999 北大核心 CSCD
摘要：用抗水稻白叶枯病的近等基因系CBB3(Xa—3)、CBB4(Xa—4)、CBB12(Xa—12)和感病轮回亲本沈农1033与两个致病力不同的白叶枯病菌株75—1、76—25组成非亲和性和亲和性反应的组合。以无菌水模拟接种为对照,成株期剪叶接种后分别在不同时间取样测定叶片的苯丙氨酸解氨酶(PAL)、过氧化物酶(PO)和超氧化物歧化酶(SOD)活性。PAL活性在处理后48h达到高峰,且接种病菌后的酶活性增长率与品系的抗病性成正相关;病菌和模拟接种都刺激水稻叶片PO活性上升,接种病菌,PO呈双峰曲线,抗病品系比感病品种的上升速度快;接种病菌后抗病品系的SOD活性上升,但很快下降,然后再上升,感病品种则下降,且始终低于模拟接种的活性。
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