拟南芥和番茄斑萎病毒NSs蛋白互作的转录组分析

宋晓宇; 史晓斌; 王利敏; 陈彤; 程森祥; 《分子植物育种 》 2024 北大核心 CSCD

摘要：为了研究番茄斑萎病毒NSs蛋白在番茄斑萎病毒与植物互作中发挥的作用，本研究以转NSs基因拟南芥和生态型拟南芥为研究对象，使用Illumina RNA-seq测序平台进行转录组测序，利用生物信息学方法分析NSs对植物转录水平影响。结果显示，转基因和生态型拟南芥共有1 258个差异表达基因。其中966个差异表达基因富集到Gene Ontology (GO)，主要涉及细胞组分、代谢过程和酶活性等功能。517个差异表达基因富集到KEGG通路中，NSs主要降低了苯丙烷生物合成、植物激素信号转导、植物病原体相互作用等通路基因的表达，这些通路都与植物防御病原微生物侵染相关。101个差异表达基因被鉴定为转录因子，分属于39个转录因子家族，包括调控苯丙烷生物合成的MYB家族和调控生长素信号转导AUX/IAA转录因子家族。研究发现，NSs蛋白与拟南芥的互作是一个复杂的过程，NSs影响了拟南芥的次生代谢、激素调节、防御反应等多项生物功能，这为后续深入研究NSs在番茄斑萎病毒与宿主植物互作中发挥的作用以及番茄斑萎病毒的防治提供参考依据。

关键词： 番茄斑萎病毒 NSs 互作 转录组测序