科研产出
内蒙古赤峰地区辣椒病毒种类鉴定及其遗传进化特征
《福建农业学报 》 2024 CSCD
摘要：【目的】系统检测内蒙古赤峰市辣椒主产区病毒发生种类，并分析病毒的遗传分化情况，以期为该地区辣椒病毒病精准防控提供理论依据。【方法】从内蒙古赤峰地区4个辣椒主产区采集疑似病毒侵染的辣椒样本47份，采用sRNA高通量测序技术结合生物信息学分析，以及常规RT-PCR检测，明确侵染辣椒的病毒种类及复合侵染情况；采用常规Sanger测序测定常规RT-PCR扩增片段序列，进行遗传进化分析。【结果】内蒙古赤峰地区4个辣椒主产区辣椒混合病样的sRNA高通量测序，共检测到6种病毒，常规RT-PCR共验证到其中4种病毒；4个地区病毒种类存在明显差异，松山区城子乡优势种类为蚕豆萎蔫病毒2(Broad bean wilt virus 2,BBWV2)和马铃薯Y病毒（Potato virus Y, PVY），喀喇沁旗锦山镇为PVY和辣椒轻斑驳病毒（Pepper mild mottle virus, PMMoV）；宁城县和喀喇沁旗西桥镇为BBWV2；复合侵染类型以2种病毒复合侵染为主，复合侵染率最高达61.54%。对测定的序列系统发育分析表明，赤峰地区4个辣椒产区的PMMoV和BBWV2存在遗传分化，PVY可能出现了新的遗传型。【结论】内蒙古赤峰地区不同辣椒主产区发生的病毒种类、检出率和病毒复合侵染种类均存在明显差异。
关键词： 内蒙古赤峰地区 辣椒病毒病 sRNA高通量测序 RT-PCR 复合侵染 系统发育分析
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湖南省多花黄精炭疽病病原鉴定及其药剂筛选
《西南农业学报 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：【目的】自2017年以来，湖南省多花黄精上发生了一种叶部病害，为明确引起该病害的病原，拟筛选出适宜的防治药剂。【方法】利用组织分离法对病叶进行分离纯化，经形态学观察，基于rDNA内转录间隔区（ITS）、肌蛋白（ACT）、几丁质合成酶（CHS-1）和甘油醛-3-磷酸脱氢酶（GPDH）多基因的系统发育分析以及柯赫氏法则验证对病原菌进行鉴定。在此基础上通过菌丝生长速率法测定5种杀菌剂对该病原菌的室内毒力。【结果】通过组织分离法在湖南省4个多花黄精种植苗圃的带病黄精叶片上分离到16株形态一致的菌株，通过对菌株菌落形态和培养特征观察确认其为炭疽菌。对其中的菌株CLHJY4-3进行分子鉴定确定该病原菌为白蜡树炭疽菌（Colletotrichum spaethianum）。通过致病性测定，完成柯赫氏法则验证。该病原菌菌丝平均生长速率为1.1 cm/d。分生孢子长18.4～25.0μm,宽3.9～5.3μm;刚毛深褐色，具2～3隔，长79～107μm。室内毒力测定结果表明，在5种药剂中，咪鲜胺对该菌菌丝生长的抑制作用最强，EC50为0.031μg/mL,其次为吡唑醚菌酯和戊唑醇，EC50分别为0.049和0.252μg/mL。甲基硫菌灵和多菌灵的抑制作用相对较差，EC50分别为2.911和1.763μg/mL。【结论】本研究确定了湖南多花黄精叶斑病为炭疽病，病原为白蜡树炭疽菌，并筛选到咪鲜胺和吡唑醚菌酯为对该病原菌抑菌效果较好的杀菌剂。
关键词： 炭疽菌 多花黄精 系统发育分析 柯赫氏法则 杀菌剂
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湖北和广西辣椒脉斑驳病毒的检测及 遗传多样性分析
《南方农业学报 》 2020 北大核心 CSCD
摘要：[目的]研究辣椒脉斑驳病毒(Pepper veinal mottle virus,PVMV)的分布及遗传变异,为明确该病毒在我国的流行扩散分子机制提供理论依据.[方法]利用特异性引物反转录PCR(RT-PCR)检测从湖北宜昌及广西南宁和百色采集的48份疑似感染PVMV的辣椒样本;采用常规Sanger测序测定PCR产物序列,序列采用MEGA 5.0构建系统发育进化树,采用RDP等算法分析其可能的重组事件;采用DnaSP v5分析病毒株系不同群体之间的基因流及基因差异.[结果]从48份辣椒样本中检测到5份样本被PVMV侵染,检出率10.42%.基因同源性比对分析结果表明,测定的PVMV湖北和广西分离物CP基因序列同源性在97.00%以上,与其他地区分离物的同源性为91.73%~98.78%.系统发育分析表明,湖北(YC)和广西(NN)PVMV分离物与我国台湾PVMV分离物的亲缘关系最近.重组分析表明,PVMV广西分离物NN10有2个重组事件.[结论]湖北和广西辣椒的PVMV检测结果表明,该病毒已扩散至湖北和广西;基因突变可能是PVMV湖北分离物遗传变异的主要方式之一;而基因重组和基因突变可能是PVMV广西分离物遗传变异的重要因子.
关键词： 辣椒脉斑驳病毒 RT-PCR 系统发育分析 重组 湖北 广西
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湖南和福建辣椒上辣椒脉斑驳病毒的检测及系统发育分析
《江苏农业科学 》 2016 北大核心
摘要：辣椒脉斑驳病毒(Chilli veinal mottle virus,ChiVMV),目前在我国仅有在海南黄灯笼辣椒上严重危害的报道。利用湖南省和福建省采集的辣椒样本,检测辣椒ChiVMV的检出率,并克隆ChiVMV的CP基因序列,用邻近法构建了系统进化树,分析其遗传进化情况。结果表明,辣椒的ChiVMV省检出率湖南省为25%,福建省为20%;克隆了湖南省和福建省ChiVMV CP基因各1个,系统发育表明,湖南省和福建的ChiVMV株系与源于韩国ChiVMV株系聚在一个亚簇,而与我国其他地区ChiVMV亲缘关系较远,表明侵染辣椒的ChiVMV在我国进一步扩展,且存在遗传分化趋势。
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