文献类型： 中文期刊
作者： 李桑桑 1 ; 胡荣 1 ; 罗香文 2 ; 李诗君 1 ; 卜珊 1 ; 张宇 2 ; 刘勇 1 ; 张松柏 1 ;
作者机构： 1.湖南大学研究生院隆平分院
2.湖南省农业科学院植物保护研究所
关键词： 辣椒脉斑驳病毒;RT-PCR;系统发育分析;重组;湖北;广西
期刊名称： 南方农业学报
ISSN： 2095-1191
年卷期： 2020 年 51 卷 007 期
页码： 1693-1698
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： [目的]研究辣椒脉斑驳病毒(Pepper veinal mottle virus,PVMV)的分布及遗传变异,为明确该病毒在我国的流行扩散分子机制提供理论依据.[方法]利用特异性引物反转录PCR(RT-PCR)检测从湖北宜昌及广西南宁和百色采集的48份疑似感染PVMV的辣椒样本;采用常规Sanger测序测定PCR产物序列,序列采用MEGA 5.0构建系统发育进化树,采用RDP等算法分析其可能的重组事件;采用DnaSP v5分析病毒株系不同群体之间的基因流及基因差异.[结果]从48份辣椒样本中检测到5份样本被PVMV侵染,检出率10.42%.基因同源性比对分析结果表明,测定的PVMV湖北和广西分离物CP基因序列同源性在97.00%以上,与其他地区分离物的同源性为91.73%~98.78%.系统发育分析表明,湖北(YC)和广西(NN)PVMV分离物与我国台湾PVMV分离物的亲缘关系最近.重组分析表明,PVMV广西分离物NN10有2个重组事件.[结论]湖北和广西辣椒的PVMV检测结果表明,该病毒已扩散至湖北和广西;基因突变可能是PVMV湖北分离物遗传变异的主要方式之一;而基因重组和基因突变可能是PVMV广西分离物遗传变异的重要因子.
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