科研产出
水稻特大穗恢复系R1126株叶型性状遗传基础剖析
《杂交水稻 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：结合全基因组重测序结果和已克隆基因信息分析了水稻特大穗恢复系R1126株叶型相关基因sd1、IPA1的编码区序列,R1126的sd1基因与低脚乌尖一致,为半矮秆基因型;IPA1基因编码区序列与日本晴一致。利用株叶型差异明显的黄华占和R1126为亲本构建F2群体,对控制株叶型相关性状的QTL进行了初步定位,共定位到21个QTL,分布于第3,4,6,8,9和12染色体的7个区间。其中,第8染色体RM80—RM447区间的贡献率最大,对剑叶宽、倒2叶长、倒2叶宽、倒2叶重、倒3叶长、倒3叶重、茎周长、秆重的贡献率分别为4.34%,19.55%,1.99%,36.41%,13.07%,9.92%,36.53%和8.92%;其次是第4染色体的RM303—RM6748区间,对剑叶宽、倒2叶宽、倒3叶宽、倒3叶重、茎周长、倒2节间长、秆重的贡献率分别为23.8%,31.56%,6.87%,19.25%,1.97%,13.9%和17.13%。这2个区间为主效或多效性QTL聚集区间,其增效QTL均来自R1126。
关键词： 水稻 株叶型性状 全基因组重测序 基因比对 QTL定位
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水稻牛蛙生态种养对稻飞虱防效及水稻产量的影响
《中国生物防治学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：于2011年在湖南优质稻试验示范基地,开展了稻田放养牛蛙的生态种养试验,比较分析了两种放养蛙密度对稻飞虱的控制效果及其对水稻产量的影响.结果表明:稻田每公顷放养牛蛙900只和1500只的小区,对稻飞虱的防控效果为60%~70%,效果较好,且对天敌蜘蛛和黑肩绿盲蝽的影响较小;放养牛蛙对二化螟和稻纵卷叶螟没有防控效果;水稻结实率比空白对照分别提高了13.8%和15.8%,较化学防治区分别降低了6.2%和4.1%;水稻产量与空白对照均存在显著差异,而放养900只牛蛙.hm 2稻田的水稻产量显著低于化学防治区.
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水稻茸毛基因GL6的遗传学分析与精细定位
《科学通报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：叶片表面茸毛是水稻形态学特征上的一个重要农艺性状,对水稻的生长及生理特性有着重要的影响.应用叶片具有茸毛特征的水稻品种75-1-127,无茸毛水稻品种明恢63,光身稻品种Lemont,9311分别杂交产生F1及F1自交产生的F2群体对水稻茸毛基因进行遗传学分析,结果表明,水稻茸毛性状为一对细胞核基因控制的显性性状.应用75-1-127/明恢63的F2隐性分离群体,结合分离群体分析法(BSA)和隐性群体分析法(RCA),并通过Mapmaker3.0/MapDraw软件分析,将水稻茸毛基因GL6初步定位在水稻第6号染色体上,位于SSR标记RM20491和RM20547之间,且两标记与该茸毛基因的相对遗传距离分别为7.2和2.2cM.进一步构建大的F2分离群体并同时挖掘新的SSR标记及插入缺失InDel标记用于茸毛基因GL6的精细定位,将茸毛基因GL6精细定位在插入缺失标记InDel-106和InDel-115之间,且两标记与该茸毛基因的相对遗传距离分别为0.3和0.1cM,结合GeneBank数据库分析,在该精细定位区域内,对应粳稻日本晴和籼稻9311的物理距离分别为79和116.82kb,分别注释有7个和8个预测基因,为进一步的基因克隆和功能研究奠定了基础.
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水稻缺素胁迫下实时荧光定量RT-PCR的内参基因的选择
《农业生物技术学报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：营养元素的吸收和利用是影响水稻产量的重要决定因素。利用qRT-PCR进行缺素胁迫下水稻功能基因的表达分析时,应当筛选适合于缺素胁迫下qRT-PCR分析的内参基因。本研究以缺乏氮、磷、钾、钙、镁、硫6种大量元素1周和2周的水稻(Oryza sativa L.ssp.japonica)幼苗组成的缺素样品池为材料,选取12个水稻管家基因作为缺素条件下qRT-PCR的候选内参基因,利用geNorm软件分析缺素条件下各基因总体表达的稳定性并筛选出适合于缺素处理下qRT-PCR分析的内参基因eIF4a,确定用于缺素条件下内参校正的最佳基因数量组合为2个。根据比较分析多种内参基因组合在不同缺素处理下的实际校正结果,证明内参基因的最佳组合对于缺素条件下qRT-PCR分析的重要性以及校正结果的有效性。最后,验证了eIF4a单基因校正的可行性与有效性,为geNorm软件提供了有益的改进和补充,这为水稻缺素胁迫下qRT-PCR分析的提供了参考和借鉴。
关键词： 荧光定量RT-PCR 内参基因 水稻 缺素 geNorm
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稻曲病菌UV-2菌株细菌人工染色体文库构建及分析
《微生物学通报 》 2013 北大核心 CSCD
摘要：【目的】稻曲病(Rice false smut)是由稻曲病菌[Villosiclava virens(Cooke)Tak.]引起的严重危害水稻的真菌病害。构建稻曲病菌UV-2的大片段DNA细菌人工染色体(Bacterial artificial chromosome,BAC)文库,为致病相关基因的鉴定及在图位克隆、比较基因组学等方面的研究奠定基础。【方法】以幼嫩菌丝为材料制备大分子基因组DNA包埋块,用Hind III部分酶解后经脉冲凝胶电泳筛选,回收大片段DNA并与pIndigoBAC536-S载体连接,连接产物转化大肠杆菌菌株DH10B T1 Phage-Resistant细胞后进行蓝白斑筛选,白色菌落捡入384孔板置于80°C低温保存。【结果】成功构建UV-2菌株的高质量、高覆盖度的BAC文库,该文库共含10 368个克隆,平均插入片段为124.4 kb,空载率小于1%,约覆盖该菌基因组的36.8倍。【结论】克服了真菌大分子基因组DNA制备难控制的技术难题,建立了首个稻曲病菌的BAC文库。该文库已作为一种公共基因组资源向研究者开放(http://GResource.hzau.edu.cn)。
关键词： 大分子DNA 细菌人工染色体 水稻 稻曲病 稻曲病菌
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