辣椒(Capsicum annuum L.)果实发育及品质相关新microRNA的鉴定与分析

ZHANG Yuping; OU Lijun; KANG Linyu; LIU Yuhua; LV Junheng; WEI Ge; YANG Bozhi; YANG Sha; CHEN Wenchao; DAI Xiongze; LI Xuefeng; ZHOU Shudong; ZHANG Zhuqing; MA Yanqing; ZOU Xuexiao; 《辣椒杂志 》 2017

摘要：MicroRNA(miRNA)是一种非编码的小RNA,在各种生物过程中起着重要的调节作用。前人研究表明,模式植物中miRNA与果实发育相关。然而,人们对辣椒(Capsicum annuum L.)果实品质及发育相关的miRNA了解尚不清楚。本研究利用二代测序技术(Next-generation sequencing technology)比较了不同品种辣椒果实在不同发育时期的小RNA。利用miRDeep2软件从4个样本中共鉴定出了59个已知miRNA和310个新miRNA。预测了新miRNA的靶基因,共656个,并对其中402个靶基因进行了注释。GO分析和KEGG途径表明,某些靶基因与淀粉糖、氨基糖以及核糖代谢相关。qPCR表明一些miRNA的表达模式与其靶向基因相反,该结果为今后研究miRNA调控果实发育和品质形成提供了重要基础。

关键词： 辣椒(Capsicum annuum L.) miRNA 果实发育 果实品质 深度测序