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辣椒(Capsicum annuum L.)果实发育及品质相关新microRNA的鉴定与分析

文献类型: 中文期刊

作者: ZHANG Yuping 1 ; OU Lijun 2 ; KANG Linyu ; LIU Yuhua ; LV Junheng ; WEI Ge 2 ; YANG Bozhi 2 ; YANG Sha 2 ; CHEN Wenchao 2 ; DAI Xiongze 2 ; LI Xuefeng 2 ; ZHOU Shudong 2 ; ZHANG Zhuqing 2 ; MA Yanqing 2 ; ZOU Xuexiao ;

作者机构: 1.湖南农业大学资源环境学院

2.湖南省蔬菜研究所

关键词: 辣椒(Capsicum annuum L.);miRNA;果实发育;果实品质;深度测序

期刊名称: 辣椒杂志

ISSN: 1672-4542

年卷期: 2017 年 15 卷 03 期

页码: 42-50

摘要: MicroRNA(miRNA)是一种非编码的小RNA,在各种生物过程中起着重要的调节作用。前人研究表明,模式植物中miRNA与果实发育相关。然而,人们对辣椒(Capsicum annuum L.)果实品质及发育相关的miRNA了解尚不清楚。本研究利用二代测序技术(Next-generation sequencing technology)比较了不同品种辣椒果实在不同发育时期的小RNA。利用miRDeep2软件从4个样本中共鉴定出了59个已知miRNA和310个新miRNA。预测了新miRNA的靶基因,共656个,并对其中402个靶基因进行了注释。GO分析和KEGG途径表明,某些靶基因与淀粉糖、氨基糖以及核糖代谢相关。qPCR表明一些miRNA的表达模式与其靶向基因相反,该结果为今后研究miRNA调控果实发育和品质形成提供了重要基础。

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