科研产出
拟南芥和番茄斑萎病毒NSs蛋白互作的转录组分析
《分子植物育种 》 2024 北大核心 CSCD
摘要:为了研究番茄斑萎病毒NSs蛋白在番茄斑萎病毒与植物互作中发挥的作用,本研究以转NSs基因拟南芥和生态型拟南芥为研究对象,使用Illumina RNA-seq测序平台进行转录组测序,利用生物信息学方法分析NSs对植物转录水平影响。结果显示,转基因和生态型拟南芥共有1 258个差异表达基因。其中966个差异表达基因富集到Gene Ontology (GO),主要涉及细胞组分、代谢过程和酶活性等功能。517个差异表达基因富集到KEGG通路中,NSs主要降低了苯丙烷生物合成、植物激素信号转导、植物病原体相互作用等通路基因的表达,这些通路都与植物防御病原微生物侵染相关。101个差异表达基因被鉴定为转录因子,分属于39个转录因子家族,包括调控苯丙烷生物合成的MYB家族和调控生长素信号转导AUX/IAA转录因子家族。研究发现,NSs蛋白与拟南芥的互作是一个复杂的过程,NSs影响了拟南芥的次生代谢、激素调节、防御反应等多项生物功能,这为后续深入研究NSs在番茄斑萎病毒与宿主植物互作中发挥的作用以及番茄斑萎病毒的防治提供参考依据。
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水稻抗瘟性分类及品种与病菌谱系互作
《湖南农业大学学报(自然科学版) 》 2005 北大核心 CSCD
摘要:选用两对引物XLRRfor/XLRRrev和S1/AS3对23个水稻品种进行RGA-PCR指纹聚类分析,以80%的相似性可将23个品种分成9类;进一步对这23个品种进行抗瘟性表型聚类分析.结果表明,虽然两种方法划分的品种组别数相同,有2个组别的品种组成也相同,但多数组别的品种组成有差异,即存在R-基因与抗性表型不一致的现象.因此,RGA-PCR指纹分析法与传统的抗性表型鉴定法相结合才能获得准确、可靠的抗性信息.品种RGA和抗性表型相似组别与病菌谱系之间没有明确的对应关系,但就单个品种而言,某些品种与一些病原菌谱系出现即皆亲和或皆非亲和的互作现象.
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水稻近等基因系与白叶枯病菌互作的生理指标研究
《植物保护学报 》 1999 北大核心 CSCD
摘要:用抗水稻白叶枯病的近等基因系CBB3(Xa—3)、CBB4(Xa—4)、CBB12(Xa—12)和感病轮回亲本沈农1033与两个致病力不同的白叶枯病菌株75—1、76—25组成非亲和性和亲和性反应的组合。以无菌水模拟接种为对照,成株期剪叶接种后分别在不同时间取样测定叶片的苯丙氨酸解氨酶(PAL)、过氧化物酶(PO)和超氧化物歧化酶(SOD)活性。PAL活性在处理后48h达到高峰,且接种病菌后的酶活性增长率与品系的抗病性成正相关;病菌和模拟接种都刺激水稻叶片PO活性上升,接种病菌,PO呈双峰曲线,抗病品系比感病品种的上升速度快;接种病菌后抗病品系的SOD活性上升,但很快下降,然后再上升,感病品种则下降,且始终低于模拟接种的活性。
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