科研产出
三种野生稻候选抗病基因的克隆与分析
《分子植物育种 》 2007 CSCD
摘要：候选抗性基因克隆策略是克隆植物新抗性基因的重要途径。根据已知NBS-LRR类抗病基因结构中的氨基酸保守区域,设计兼并引物,通过RT-PCR扩增、克隆和测序,从茶陵野生稻,东乡野生稻和小粒野生稻中共获得了11条NBS-LRR类抗病基因同源序列。通过聚类分析可将同源序列分为3类,其中茶陵野生稻中得到1类,东乡野生稻中得到2类,而小粒野生稻中得到3类。但是小粒野生稻包含有其他两种野生稻的序列。三类序列都与水稻抗病基因RPR1具有较高的同源性,有一类氨基酸序列同源性甚至高达88%,可能为其家族成员。利用电子定位将三类序列定位在水稻基因组11号染色体上RPR1附近。根据序列比对分析结果认为其中可能有1～2个新抗病基因。
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利用RT-PCR扩增和分析柑桔裂皮病类病毒
《Acta Botanica Sinica 》 1997 SCI 北大核心 CSCD
摘要：参考国外CEVd-A株中央保守区段(C区)和左端区段(T区),设计并合成引物Cl(-)、C2(+)、C3(+)、T1(-)、T2(+)。对感染 CEVd中国分离物的柑桔(Citrus L.)和香橼(Citrus medica L.)总核酸进行了cDNA第一链合成和PCR扩增,其中C1/C3、C1/C2分别能从感病香橼和柑桔总核酸中扩增出210bp和370bp左右的特异DNA,分别相当于CEVd的左半部和全长片段,T1/T2未能扩增出产物;健康香橼和柑桔总核酸中均未能扩增出产物。扩增结果用DIG标记的CEVd-cDNA探针进行了确证。扩增结果说明:CEVd中国分离物在左端T区与CEVd-A株存在差异。PAGE-银染法分析扩增产物表明:建立的RT-PCR方法可从约0.1ng柑桔总核酸中扩增出全长CEVd-cDNA。
关键词： 柑桔裂皮病类病毒 反转录PCR DIG标记cDNA探针
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