科研产出
玉竹主要栽培品种遗传多样性研究
《中药材 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：目的:研究中药材玉竹栽培种的遗传多样性,为玉竹品种资源保护及利用提供依据.方法:收集湘玉竹及其他产地玉竹栽培种资源,以黄精属37种植物和同科植物竹根七为近源物种,利用叶绿体基因条形码psbA-trnH序列进行基原鉴定,并结合基于基因分型测序(Genotyping-by-Sequencing,GBS)的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)对主要栽培种进行遗传多样性分析.结果:玉竹Polygonatum odoratum与其他品种的psbA-trnH序列存在一定差异,但湘玉竹Y1~Y6栽培品种间差异不明显.基于SNP位点的遗传分析,能将玉竹不同栽培种进行更好地区分,分群特征与栽培选择历史及植物形态有明显相关.结论:湘玉竹栽培种遗传相似度较高,基于SNP位点分析对玉竹栽培种有一定鉴别能力,为玉竹栽培种的基原鉴定和品种选育提供遗传信息.
关键词： 玉竹 psbA-trnH序列 基因分型测序(GBS) 遗传多样性
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DNA条形码在黄精属药用植物鉴定与遗传多样性分析中的应用
《植物科学学报 》 2022 北大核心 CSCD
摘要：黄精属(Polygonatum)的许多物种具有重要的药用价值,但目前缺乏能够准确、高效地鉴定黄精属药用植物的DNA条形码.本研究通过对ITS、trnK-matK、rbcL、psbA-trnH和psbK-psbl序列进行扩增和测序,并从ITS序列中提取ITS2序列,共获得黄精属7个药用物种23份样品的138条序列.进一步比较6个DNA条形码对黄精属药用植物的鉴定效率,并验证所筛选条形码的可靠性.结果显示:trnK-matK的种内和种间变异重合少且有较明显的条形码间隙,其他5个序列的种内和种间变异重合多且无条形码间隙;BLAST结果表明trnK-matK的鉴定效率最高(85.7%),系统发育树显示trnK-matK的鉴定能力最强,能将全部12个多花黄精样品聚在一支,并能区分黄精、滇黄精、玉竹、点花黄精和湖北黄精;AMOVA分析结果揭示trnK-matK的群体遗传分化指数(Fst)最高,适用于区分黄精属物种间差异.因此,trnK-matK最适用于黄精属药用植物的分子鉴定.
关键词： 黄精属 DNA条形码 遗传多样性 ITS matK rbcL psbA-trnH psbK-psbl
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