科研产出
克里曼丁红橘果皮色泽变异差异片段的克隆
《分子植物育种 》 2020 北大核心 CSCD
摘要:为分析克里曼丁红橘果皮色泽变异的分子机理,本研究以克里曼丁红橘橙黄色芽变植株为材料,利用SRAP分子标记对其进行分析,100对引物中,成功扩增并克隆得到了2条差异片段.其中从黄色克里曼丁样品中扩增出一条长474 bp的差异片段,与甜橙基因组中Cs1g22940.1部分序列完全一致;另外从红色克里曼丁样品中扩增出一条长323 bp的差异片段,与甜橙基因组中Cs4g12370部分序列完全一致.取12个不同果皮色泽的柑橘品种对两对引物的扩增结果进行验证,结果表明,323 bp的差异片段更有可能与果皮色泽相关.本研究为分析柑橘果皮色泽差异提供了科学依据.
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张家界部分杂柚品种基于SRAP分子标记的亲缘关系分析
《分子植物育种 》 2017 北大核心 CSCD
摘要:采用SRAP分子标记技术对包含张家界地区4个杂柚品种在内的9个柑橘品种进行遗传多样性及亲缘关系分析。结果表明:45对引物共扩增得到467个条带,其中多态性条带354个,多态性百分率为75.8%,因此SRAP可以作为柚类资源亲缘关系研究的有效标记。在遗传相似系数0.623 1处,供试材料可区分为两大组,第一组为沙田柚、慈利香柚、菊花芯柚、慈利金香柚,第二组包括慈利菠萝香柚、大分4号、慈利水柚子、大红甜橙、兴山酸橙。聚类结果表明4个柚类杂种中,慈利香柚和慈利金香柚与沙田柚及菊花芯柚的亲缘关系较近,而与大红甜橙、兴山酸橙及大分4号的亲缘关系则相距较远;而慈利菠萝香柚和慈利水柚子则刚好相反,它们更偏向于大红甜橙、兴山酸橙及大分4号,而与张家界主栽的两个柚类品种的亲缘关系则较远。
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SSR、SRAP、ISSR分子标记在茶树品种亲本鉴定上的比较分析
《茶叶科学 》 2014 北大核心 CSCD
摘要:为鉴定湘波绿2号的父本,同时为茶树亲本鉴定和亲缘关系分析等研究提供分子标记参考,本研究采用SSR、SRAP、ISSR 3种分子标记体系,在对湘波绿2号与其母本和5个可能父本进行亲缘关系分析基础上,比较了这3种分子标记体系的多态性条带比率(PPB)、多态性信息含量(PIC)、多样性指数(DI)、引物解析强度(Rp)、分子标记指数(MI)等指标。29对SSR引物共检测到等位位点83个,平均每对引物2.86个,引物PPB、PIC、DI、Rp、MI平均值分别为77.01%、0.55、0.29、1.31、0.95。17对SRAP引物共检测到等位位点139个,平均每对引物8.18个,引物PPB、PIC、DI、Rp、MI平均值分别为71.70%、0.84、0.15、3.65、3.59。10个ISSR引物共检测到等位位点90个,平均每个引物9.00个,引物PPB、PIC、DI、Rp、MI平均值分别为69.76%、0.85、0.15、4.21、4.71。3种标记体系的MI、Rp、PIC趋势一致,ISSR最高,依次为SRAP和SSR,而PPB和DI正好相反。以上结果表明,ISSR和SRAP标记具有较高的标记效率,而SSR标记具有丰富的多态性。不同分子标记体系获得的品种间相似系数有所不同,但湘波绿2号与湘波绿和福鼎大白茶聚为一类,说明湘波绿2号与其关系较近,湘波绿可能为湘波绿2号的父本。
关键词: 茶树 亲本鉴定 SSR标记 SRAP标记 ISSR标记
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湖南柚类资源及近缘种的SRAP遗传多样性分析
《湖南农业科学 》 2013
摘要:利用SRAP标记研究了46份湖南柚类地方种质资源及近缘种的遗传多样性与亲缘关系。结果表明:17对SRAP引物组合从供试材料中共检测出283条扩增带,平均每对引物组合可检测到16.6条;其中多态性条带235条,多态性比例83.0%;基因多态性信息量(PIC)变幅为0.431 7~0.770 0,平均为0.544 3;获得了22个SRAP特异性标记。UPGMA聚类结果显示,46份柚类资源及近缘种在欧式遗传距离0.795时分成7个组群,其中40份柚类品种被归类为5个组群,主要由沙田柚品种群、文旦柚品种群和杂种柚品种群组成,聚类结果呈现出明显的地域生态特征。
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