高通量基因型分型技术及其在水稻中的应用

张先文; 贺治洲; 江南; 邓华凤; 李继明; 《生物技术通报 》 2017 北大核心 CSCD

摘要：作物种质资源遗传基础的深入认识与高效利用,对于品种改良和粮食安全具有重要意义。传统系谱考察的方法对指导育种实践发挥了重要作用,随着分子生物学的发展,基因组学和高通量SNP分子标记等基因型分型方法可以更便捷地对种质资源进行鉴定。就基因型分型的主要方法进行了总结,重点论述了以SNP为核心的下一代高通量测序(NGS)分型方法、竞争性等位基因特异性PCR(KASP)和SNP芯片系统,以及当前主流的SNP分析工具和数据库。同时,介绍了高通量SNP分型技术在水稻研究中的进展,并就分型技术在作物育种等领域的应用和发展趋势进行了展望。

关键词： 系谱 SNP 分型 下一代高通量测序 竞争性等位基因特异性PCR