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高通量基因型分型技术及其在水稻中的应用

文献类型： 中文期刊

作者： 张先文 1 ; 贺治洲 1 ; 江南 1 ; 邓华凤 1 ; 李继明 1 ;

作者机构： 1.杂交水稻国家重点实验室湖南杂交水稻研究中心湖南省农业科学院;华智水稻生物技术有限公司;湖南农业大学生物科学技术学院

关键词： 系谱;SNP;分型;下一代高通量测序;竞争性等位基因特异性PCR

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2017 年 33 卷 12 期

页码： 67-73

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 作物种质资源遗传基础的深入认识与高效利用,对于品种改良和粮食安全具有重要意义。传统系谱考察的方法对指导育种实践发挥了重要作用,随着分子生物学的发展,基因组学和高通量SNP分子标记等基因型分型方法可以更便捷地对种质资源进行鉴定。就基因型分型的主要方法进行了总结,重点论述了以SNP为核心的下一代高通量测序(NGS)分型方法、竞争性等位基因特异性PCR(KASP)和SNP芯片系统,以及当前主流的SNP分析工具和数据库。同时,介绍了高通量SNP分型技术在水稻研究中的进展,并就分型技术在作物育种等领域的应用和发展趋势进行了展望。

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[6]SNP分子标记的研究及其应用进展. 肖层林,王伟平. 2012

[7]Mapping of a major QTL for salt tolerance of mature field-grown maize plants based on SNP markers. Zhao, Yanxin,Zhang, Ruyang,Xing, Jinfeng,Duan, Minxiao,Li, Jingna,Wang, Naishun,Wang, Wenguang,Zhang, Shasha,Zhang, Huasheng,Shi, Zi,Song, Wei,Zhao, Jiuran,Chen, Zhihui. 2017

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