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水稻穗发育相关基因酵母双杂交cDNA文库的构建

文献类型： 中文期刊

作者： 邱牡丹 1 ; 李莉 1 ; 李懿星 1 ; 王建龙 1 ;

作者机构： 1.湖南农业大学农学院;湖南杂交水稻研究中心

关键词： 水稻;穗发育相关基因;cDNA文库;酵母双杂交

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2018 年 37 卷 10 期

页码： 4322-4328

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用cDNA文库筛选与已知功能蛋白质互作蛋白质,是研究蛋白质之间相互作用的重要途径之一。本试验利用水稻武运粳7号(95-22)穗为材料,构建了一个穗发育相关基因酵母双杂交cDNA文库,试验表明,本实验构建的cDNA初级文库容量和目的文库容量分别为1.44×107 CFU/mL和9.6×106 CFU/mL,重组率均为95%;初级文库插入片段长度介于500～2 000 bp之间,目的文库插入片段长度介于1 000～2 000 bp之间,两者平均插入片段长度均在1 000 bp以上;通过NCBI数据库、RicexPro数据库和Rice Genome Annotiation Project数据库对目的文库中的19个单克隆测序分析得知,19个克隆测序序列匹配17个相应的基因,文库重复率为10.5%,其中16个基因均在穗部有表达。以上试验表明,本实验构建的cDNA文库是一个质量较高的文库,可以直接用于穗发育相关基因筛选。

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