文献类型: 中文期刊
作者: 刘振 1 ; 杨培迪 1 ; 成杨 1 ; 杨阳 1 ;
作者机构: 1.湖南省茶叶研究所
关键词: 茶树(Camellia sinensis);肌动蛋白;密码子偏性
期刊名称: 茶叶通讯
ISSN: 1009-525X
年卷期: 2014 年 41 卷 04 期
页码: 13-17
摘要: 运用CUSP、Codon W、CHIPS程序分析茶树肌动蛋白基因Cs Actin1的密码偏性,并将其与茶树基因组密码子偏性比较,以及与其它9种植物肌动蛋白基因进行基于密码子偏性和CDS序列的聚类分析。结果显示,Cs Actin1相对密码子使用度(RSCU)与茶树基因组比较,只有6种氨基酸的密码子偏性一致,且没有如茶树基因组一样偏好使用A/T结尾的密码子,肌动蛋白基因基于RSCU的聚类结果与基于CDS序列的聚类结果虽存在差异,但都能在一定程度上反映物种间的亲缘关系。
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[2]密码子偏性分析方法及茶树中密码子偏性研究进展. 刘振,杨培迪,成杨,杨阳. 2016
[3]茶树密码子用法分析. 杨阳,刘振,杨培迪. 2011
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