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茶树CsActin1基因密码子偏性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 刘振 1 ; 杨培迪 1 ; 成杨 1 ; 杨阳 1 ;

作者机构: 1.湖南省茶叶研究所

关键词: 茶树(Camellia sinensis);肌动蛋白;密码子偏性

期刊名称: 茶叶通讯

ISSN: 1009-525X

年卷期: 2014 年 41 卷 04 期

页码: 13-17

摘要: 运用CUSP、Codon W、CHIPS程序分析茶树肌动蛋白基因Cs Actin1的密码偏性,并将其与茶树基因组密码子偏性比较,以及与其它9种植物肌动蛋白基因进行基于密码子偏性和CDS序列的聚类分析。结果显示,Cs Actin1相对密码子使用度(RSCU)与茶树基因组比较,只有6种氨基酸的密码子偏性一致,且没有如茶树基因组一样偏好使用A/T结尾的密码子,肌动蛋白基因基于RSCU的聚类结果与基于CDS序列的聚类结果虽存在差异,但都能在一定程度上反映物种间的亲缘关系。

  • 相关文献

[1]13种植物actin基因的密码子使用特性分析. 杨培迪,刘振,成杨,杨阳. 2016

[2]密码子偏性分析方法及茶树中密码子偏性研究进展. 刘振,杨培迪,成杨,杨阳. 2016

[3]茶树密码子用法分析. 杨阳,刘振,杨培迪. 2011

[4]茶树肌动蛋白基因密码子偏性分析. 赵洋,LIU Zhen,刘振,YANG Pei-di. 2014

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