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水稻种子耐厌氧萌发全基因组关联分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘利成 1 ; 李小湘 2 ; 黎用朝 2 ; 潘孝武 2 ; 闵军 2 ; 刘三雄 2 ; 刘文强 2 ; 胡敏 2 ; 段永红 2 ; 余亚莹 2 ; 张海清 1 ;

作者机构： 1.湖南农业大学农学院

2.湖南省农业科学院水稻研究所/农业部长江中下游籼稻遗传育种重点实验室

关键词： 水稻;厌氧萌发;全基因组关联分析

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2021 年 006 期

页码： 1644-1650

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究通过解析水稻芽期耐淹性的遗传基础,挖掘相关QTL,筛选优良单株,为分子标记辅助育种提供优异种质和理论支撑。选取318份国内外水稻种质资源,在正常有氧和厌氧条件下测定种子萌发期的胚芽鞘长度,并计算相对胚芽鞘长度,通过整合基因型和表型数据进行全基因组关联分析。318份水稻种质间相对胚芽鞘长度差异明显,相对胚芽鞘长度的平均值为-0.238,中位值为-0.342,最低值为-0.923,最高值为3.069。全基因组关联分析共鉴定到83个SNP与种子耐厌氧萌发性状显著相关。通过合并距离较近的SNP,共鉴定到27个耐厌氧萌发QTL,3个QTL与已报道的耐厌氧萌发QTL位置相近。其中qAG4-2与耐厌氧萌发性状的关联度较高,共有20个候选基因位于qAG4-2内,其中1个基因在厌氧条件下相对于正常有氧条件上调表达,2个基因下调表达。本研究挖掘的控制水稻耐厌氧萌发的QTL及优异种质资源将为水稻耐厌氧育种提供重要支撑。

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