文献类型: 中文期刊
作者: 吴小明 1 ; 胡颖 2 ;
作者机构: 1.湖北第二师范学院/植物抗癌活性物质提纯与应用湖北省重点实验室
2.武汉大学/杂交水稻国家重点实验室
关键词: 大豆;类成束阿拉伯半乳糖蛋白;理化性质;结构特征;生物信息学分析
期刊名称: 河南农业科学
ISSN: 1004-3268
年卷期: 2017 年 46 卷 03 期
页码: 34-40
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 基于已公布的大豆基因组数据库,鉴定大豆类成束阿拉伯半乳糖蛋白(fasciclin-like arabinogalactan proteins,FLAs)基因,并对其基本理化性质、保守基序、功能域、系统发生树、蛋白质二级结构等进行综合分析。结果显示,从大豆基因组中共鉴定出33个FLAs,其编码的蛋白质氨基酸长度在237~455 aa,分子质量在25.483 0~50.578 5 ku,理论等电点在4.33~9.56。亚细胞定位分析显示,Gm FLAs均定位在质膜上(其中Gm FLA4/25也可定位在叶绿体中)。Gm FLAs含有1~2个该家族的保守成束蛋白质结构域(fasciclin domains,FAS)。系统进化分析显示,大豆和拟南芥FLAs的同源性不高。Gm FLAs二级结构均由α螺旋、无规则卷曲和延伸链等元件组成,其中,延伸链的比例最低,无规则卷曲比例最高。
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