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RT-PCR克隆籼稻叶绿素a/b结合蛋白基因全长cDNA及序列的in silico分析

文献类型: 中文期刊

作者: 余东 1 ; 谭炎宁 1 ; 孙志忠 1 ; 孙学武 2 ;

作者机构: 1.湖南杂交水稻研究中心

2.中南大学研究生院隆平分院

关键词: 水稻;叶绿素a/b结合蛋白基因;克隆;in silico分析

期刊名称: 基因组学与应用生物学

ISSN: 1674-568X

年卷期: 2012 年 31 卷 02 期

页码: 80-84

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 根据日本晴cab4基因序列(GenBank:AK104499.1)设计引物,用RT-PCR的方法从籼稻9311中克隆了叶绿素a/b结合蛋白基因的全长cDNA,命名为cab-9311(cab gene from 9311)。insilico分析表明:cab-9311与cab4基因同源性为99%,编码的蛋白含有244个氨基酸,与cab4基因编码的蛋白同源性为98%。蛋白分子质量为26.9kD,理论等电点为6.52。第54位~第216位氨基酸是一个典型的叶绿素a/b结合蛋白功能域(chlorophyll a/bbinding domain)。跨膜分析和蛋白质三级预测显示,该蛋白在C端有一个典型的跨膜区。亚细胞定位分析表明该蛋白定位于叶绿体,是一个叶绿体内囊体膜上的锚定蛋白。

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