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茶组植物种间关系的cpDNA、rDNA ITS和mtDNA序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 赵洋 1 ; 杨培迪 1 ; 成杨 1 ; 刘本英 1 ; 李游勇 1 ; 杨阳 2 ;

作者机构： 1.;湖南省农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心湖南分中心;云南省农业科学院茶叶研究所

2.;湖南省农业科学院茶叶研究所国家茶树改良中心湖南分中心;云南省农业科学院茶叶研究所;

关键词： 茶树;种间关系;cpDNA;mtDNA;序列分析

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2018 年 01 期

页码： 27-33

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】DNA序列分析在物种系统进化、分类和鉴定等方面展示出了强大的生命力。【方法】本研究对来源于cpDNA、rDNA ITS和mtDNA序列的15对引物在茶组植物的5种2变种共16份资源中进行了种间关系研究。【结果】在15对引物中,来自cpDNA的6对引物有5对完成了扩增与测序,来自rDNA ITS的3对引物均未得到单一目的片度,来自mtDNA序列的6对引物中,共有4对完成了扩增与测序。对在种间存在位点差异的8对引物序列比对:序列长度最长的为390F-1326R(859 bp),最短的为orf25(446 bp);品种间变异位点最多的为rbcla-rev(24个),最少的为nad4L/orf25(2个)。位点变异率最高的为rbcla-rev(4.76%),最低为nad4L/orf25(0.37%),cpDNA的碱基变异率平均值(2.91%)要远高于mtDNA(0.55%);8对引物在茶变种内发生变异的位点共有9个,占总位点数的0.19%;不同变种间发生变异的位点有90个,占总位点数的1.85%;将8对引物测序得到的序列拼接,按照MP法构建了分子系统树,可以将参试的16份茶树资源分为3大类。【结论】本研究为DNA序列分析在茶组植物中的应用提供了参考。

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