文献类型: 中文期刊
作者: 刘振 1 ; 赵洋 1 ; 杨培迪 1 ; 成杨 1 ; 唐怀廷 2 ; 杨阳 1 ;
作者机构: 1.湖南省农业科学院茶叶研究所/国家茶树改良中心湖南分中心
2.张家界西莲茶业有限责任公司
关键词: 茶树;三倍体;叶绿体基因组;基因组测序;系统发育关系;叶绿体SSR;‘西莲1号’
期刊名称: 茶叶通讯
ISSN:
年卷期: 2023 年 002 期
页码: 166-175
摘要: 三倍体茶树品种‘西莲1号’是桑植白茶产业发展的主推品种,与湖南现有茶树品种相比具有很强的特异性。为揭示‘西莲1号’的分类和演化地位,项目采用叶绿体(Chloroplast,cp)全基因组测序技术进行了‘西莲1号’全基因组测序,并对其所有的SSR标记进行了开发与筛选。结果表明:(1)‘西莲1号’叶绿体基因组全长为157 038 bp,GC含量为37.30%,为一个四分体结构,包括1个大的单拷贝(LSC)、一个小的单拷贝(SSC)和一对反向重复序列(IR),长度分别为86 612 bp、18 282 bp和26 072 bp。cpDNA共注释得到132个基因,其中unigenes有114个,包含80个编码基因,30个tRNA基因和4个rRNA基因。(2)共鉴定出245个简单序列重复(SSR),通过筛选有15个SSR具有较高的多态性。获得了cpDNA基因组20个氨基酸的偏好密码子,‘西莲1号’密码子偏好以A/T碱基结尾。(3)基因选择压力分析表明,与茶组其他资源相比,6个基因(accD、ndhC、petB、rpl16、rpoC1、rpoC2)可能处于正选择状态。(4)基于叶绿体基因组序列构建了基于22份茶组植物的系统发育树,聚类结果显示‘西莲1号’与其他栽培型茶树品种(Camellia sinensis var. sinensis)处于系统发育树的末端,属于进化的茶树资源类型。
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