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水稻转录因子NF-YB家族的生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 余东 1 ; 孙志忠 1 ; 孙学武 2 ; 谭炎宁 2 ; 盛夏冰 1 ; 段美娟 3 ; 袁定阳 1 ;

作者机构： 1.null

2.国家杂交水稻工程技术研究中心

3.湖南农业大学农学院

关键词： 水稻;转录因子;NF-YB基因家族;生物信息学

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2018 年 18 期

页码： 5849-5861

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 转录因子NF-YB (nuclear factor-YB)家族是核因子Y (nuclear factor Y, NF-Y)家族的一个亚家族,在调控胚发育、形态建成、开花时间、株高、穗粒数等方面,尤其是在非生物胁迫应答中发挥着重要的作用。为揭示水稻NF-YB基因家族的信息及特征,加快基因家族功能挖掘进程,本研究利用生物信息学手段对该基因家族及其编码蛋白进行分析。结果表明,水稻中共有13个NF-YB基因,在染色体上分布不均匀,所编码的蛋白都定位在细胞核,且不含跨膜结构域或信号肽。多重序列比对,二级结构,三级结构以及基序分析表明,该家族成员保守性较高,均含有高度保守的CBF/NF-Y结构域。进化分析表明NF-YB家族基因的分化早于物种的分化。磷酸化位点和互作蛋白网络分析初步预测了家族成员的互作蛋白网络。本研究为后期NF-YB家族成员的功能研究,加快家族基因的实际应用进程提供了帮助。

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