东乡野生稻RPS2类候选抗病基因的克隆与分析

李磊; 韩小霞; 邢俊杰; 李玲龙; 阳志刚; 罗秀娟; 李丁; 谢灵灵; 曹孟良; 《湖南农业大学学报(自然科学版) 》 2009 北大核心 CSCD

摘要：利用NBS保守结构域获得的探针及基于RecA文库富集方法的试剂盒筛选东乡野生稻液体pCAMBIA1301质粒文库,杂交筛选获得阳性克隆,在NCBI上进行BLASTN序列比对后,设计相关引物,扩增获得编码区,并利用生物信息学方法预测其编码蛋白序列,与已克隆的NBS-LRR类抗性基因建立进化树.结果分析表明,其预测蛋白除了部分氨基酸缺失及2个氨基酸不同外,与粳稻大部分序列一致,分子进化树表明其与粳稻、拟南芥RPS2基因的关系最近.

关键词： 东乡野生稻 液体质粒文库 长片段高保真PCR 生物信息学