文献类型: 中文期刊
作者: 李磊 1 ; 韩小霞 1 ; 邢俊杰 1 ; 李玲龙 1 ; 阳志刚 1 ; 罗秀娟 1 ; 李丁 1 ; 谢灵灵 1 ; 曹孟良 1 ;
作者机构: 1.中南大学
关键词: 东乡野生稻;液体质粒文库;长片段高保真PCR;生物信息学
期刊名称: 湖南农业大学学报(自然科学版)
ISSN: 1007-1032
年卷期: 2009 年 35 卷 02 期
页码: 111-115
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 利用NBS保守结构域获得的探针及基于RecA文库富集方法的试剂盒筛选东乡野生稻液体pCAMBIA1301质粒文库,杂交筛选获得阳性克隆,在NCBI上进行BLASTN序列比对后,设计相关引物,扩增获得编码区,并利用生物信息学方法预测其编码蛋白序列,与已克隆的NBS-LRR类抗性基因建立进化树.结果分析表明,其预测蛋白除了部分氨基酸缺失及2个氨基酸不同外,与粳稻大部分序列一致,分子进化树表明其与粳稻、拟南芥RPS2基因的关系最近.
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