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资源类型: 中文期刊
关键词:全基因组分析(模糊匹配)
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猕猴桃Hsp90家族全基因组鉴定与表达分析

《安徽农业大学学报 》 2024 北大核心 CSCD

摘要:本研究旨在鉴定猕猴桃AcHsp90基因家族成员,为进一步研究AcHsp90基因的生物学功能和耐热机理奠定基础。利用生物信息学软件的方法,对猕猴桃AcHsp90基因家族成员进行鉴定和系统分析。结果表明,从猕猴桃全基因组中共鉴定出10个AcHsp90基因。基因结构和系统发育分析将AcHsp90基因分为4个类群,同一组中的AcHsp90基因具有相似的基因结构和保守结构域基序。AcHsp90基因的启动子区存在多种非生物胁迫相关顺式元件和激素反应性顺式元件。共线性分析发现AcHsp90基因存在4对片段重复事件。热胁迫表达模式的分析结果表明,AcHsp90基因在热敏型品种‘红阳’和耐热型品种‘华特’的根、茎、叶器官中均有显著性表达,但相对表达水平存在差异;与热敏型品种‘红阳’相比,耐热型品种‘华特’在热胁迫下大部分AcHsp90基因表达的峰值是滞后的。猕猴桃AcHsp90基因家族成员具有结构多样性和进化保守性,他们在热胁迫条件下表现出显著性表达模式,这意味着它们广泛参与了猕猴桃获得耐热性的过程。

关键词: Hsp90基因家族 猕猴桃 热应激 表达模式 全基因组分析

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