科研产出
辣椒CaBRI1基因克隆与功能分析
《分子植物育种 》 2023 北大核心 CSCD
摘要：为了解辣椒CaBRI1基因结构特征及功能，本研究以辣椒自交系6421为实验材料，克隆CaBRI1基因，对其进行生物信息学分析、亚细胞定位、表达模式分析，并采用病毒沉默（VIGS）初步验证该基因在辣椒中的功能。结果表明，CaBRI1编码区序列长3 642 bp，编码1 213个氨基酸；CaBRI1蛋白包含6个亮氨酸重复与1个磷酸激酶结构域，具有2个跨膜区域，N端跨膜螺旋可能为信号肽。洋葱表皮细胞GFP瞬时表达结果显示CaBRI1定位于细胞膜。RT-qPCR分析表明，6421同一发育时期不同组织中CaBRI1表达量存在显著差异，且都为茎尖中表达量最高。VIGS沉默6421中CaBRI1后，沉默植株发育迟缓、株高变矮，CaBRI1表达量显著下降。本研究结果可为进一步阐明CaBRI1在辣椒中的生物学功能提供参考。
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菲律宾稻瘟病菌生理小种中AVR-Pita及其同源基因的序列与功能分析
《中国生物防治学报 》 2018 北大核心 CSCD
摘要：根据已克隆的AVR-Pita及其同源基因序列设计4对引物,对来自菲律宾的74个稻瘟病单孢菌株DNA进行PCR扩增和序列分析,研究了与水稻抗病基因Pi-ta互作的稻瘟病菌无毒基因AVR-Pita及其同源基因序列多态性与进化关系。结果显示,在42个菌株中扩增出AVR-Pita1基因目的条带,31个菌株中扩增出AVR-Pita3基因目的条带,55个菌株中扩增出AVR-Pita4基因目的条带,但所有供试菌株均未扩增出AVR-Pita2基因目的条带。对PCR产物进行测序分析,发现AVR-Pita1基因在菲律宾的生理小种中存在序列多态性,可划分为5个单倍型,共有10个多态性位点;AVR-Pita3和AVR-Pita4基因序列较保守,序列比对后没有发现多态性。对不同单基因系接种鉴定,发现除第3种AVR-Pita1单倍型外,含有AVR-Pita1单倍型1、2、4及5的生理小种均不能与Pi-ta基因互作,从而使Pi-ta单基因系IRBLta-CT2在接种后表现为感病。以上试验结果说明AVR-Pita1基因变异性较强,且序列改变后会导致基因功能的变化。
关键词： 稻瘟病菌 AVR-Pita及其同源基因 序列分析 功能分析
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