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菲律宾稻瘟病菌生理小种中AVR-Pita及其同源基因的序列与功能分析

文献类型： 中文期刊

作者： 甘玉姿 1 ; 肖贵 1 ; 邓启云 1 ; 吴俊 1 ; 柏斌 1 ; 卢向阳 1 ; 周波 1 ;

作者机构： 1.湖南农业大学生物科学技术学院;湖南杂交水稻研究中心;国际水稻研究所

关键词： 稻瘟病菌;AVR-Pita及其同源基因;序列分析;功能分析

期刊名称： 中国生物防治学报

ISSN： 2095-039X

年卷期： 2018 年 03 期

页码： 488-498

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据已克隆的AVR-Pita及其同源基因序列设计4对引物,对来自菲律宾的74个稻瘟病单孢菌株DNA进行PCR扩增和序列分析,研究了与水稻抗病基因Pi-ta互作的稻瘟病菌无毒基因AVR-Pita及其同源基因序列多态性与进化关系。结果显示,在42个菌株中扩增出AVR-Pita1基因目的条带,31个菌株中扩增出AVR-Pita3基因目的条带,55个菌株中扩增出AVR-Pita4基因目的条带,但所有供试菌株均未扩增出AVR-Pita2基因目的条带。对PCR产物进行测序分析,发现AVR-Pita1基因在菲律宾的生理小种中存在序列多态性,可划分为5个单倍型,共有10个多态性位点;AVR-Pita3和AVR-Pita4基因序列较保守,序列比对后没有发现多态性。对不同单基因系接种鉴定,发现除第3种AVR-Pita1单倍型外,含有AVR-Pita1单倍型1、2、4及5的生理小种均不能与Pi-ta基因互作,从而使Pi-ta单基因系IRBLta-CT2在接种后表现为感病。以上试验结果说明AVR-Pita1基因变异性较强,且序列改变后会导致基因功能的变化。

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