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柑橘类病毒的分子鉴定与分型

文献类型: 中文期刊

作者: 韩健 1 ; 邓子牛 1 ; 舒广平 2 ; Rizza S 3 ;

作者机构: 1.湖南农业大学园艺园林学院

2.湖南省园艺研究所

3.湖南农业大学园艺园林学院国家柑橘改良中心长沙分中心Department

关键词: 柑橘;类病毒;检测;序列分析;分型

期刊名称: 中国农业科学

ISSN: 0578-1752

年卷期: 2008 年 09 期

页码: 2670-2677

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】检测湖南地区柑橘所携带的柑橘类病毒类型,并鉴定柑橘类病毒的亚型。【方法】以田间柑橘枝条韧皮部为试材,提取总RNA,反转录成cDNA,再用不同类型类病毒的特异引物进行PCR扩增,鉴定出各个样品所携带的柑橘类病毒类型;通过测序分析各类型的序列,并与国内外报道的序列进行同源性分析,确定所测样品的亚型。【结果】建立了CEVd、CVdII、CVdⅢ等柑橘类病毒的RT-PCR检测方法。在5个供试样品中检测出3种类型的柑橘类病毒,即柑橘裂皮病类病毒(citrus exocortis viroid,CEVd)、柑橘类病毒Ⅱ型(citrus viriodⅡ,CVdⅡ,又名hop stunt viroid,HSVd)和柑橘类病毒Ⅲ型(citrus viriodⅢ,CVdⅢ),其中CVdⅡ和CVdⅢ为国内首次发现。亚型分析表明CVdⅡ可能为新的亚型;CVdⅢ为b亚型,可能具有矮化功能。【结论】在中国鉴定出3种类型的柑橘类病毒,CEVd与国内已报道的序列完全一致,其中CVdⅡ和CVdⅢ为首次在中国发现;检测到的CVdⅡ可能为新的亚型。

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