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辣椒β–酮脂酰辅酶A合酶基因家族的鉴定与表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 易婷 1 ; 张志硕 1 ; 汤冰倩 1 ; 谢玲玲 1 ; 邹学校 1 ;

作者机构： 1.湖南大学研究生院隆平分院;湖南省蔬菜研究所;湖南农业大学园艺园林学院

关键词： 辣椒;KCS基因家族;基因表达

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2020 年 02 期

页码： 370-380

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为深入了解β–酮脂酰辅酶A合酶(β-ketoacyl-CoAsynthase,KCS)基因家族在辣椒基因组中的特征,利用生物信息学方法鉴定所有KCS基因家族成员,对基因染色体定位、系统发育关系、基因结构、蛋白保守基序和组织表达模式等进行分析,并通过qRT-PCR方法检测基因在高温、低温和NaCl胁迫下的响应。从辣椒基因组中共鉴定出22个KCS家族基因,其不均匀地分布在辣椒的9条染色体上;系统发育分析表明辣椒KCS基因家族可分为4组,每组含有不同数量的基因;该家族成员含有0～3个内含子,保守基序有6～14个;KCS家族基因具有不同的表达模式;高温、低温和NaCl处理可以抑制或激活该家族成员的表达。

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