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基于SSR标记的太湖稻区常规粳稻DNA指纹图谱构建及遗传相似性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 孙海燕 1 ; 杨志刚 1 ; 沈宗根 1 ; 汤俊 1 ; 端木银熙 2 ;

作者机构： 1.常熟理工学院

2.国家杂交水稻工程技术研究中心

关键词： 常规粳稻;DNA指纹构图谱;遗传相似性;太湖地区

期刊名称： 南方农业学报

ISSN： 2095-1191

年卷期： 2015 年 46 卷 01 期

页码： 9-14

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】构建太湖稻区粳稻(Oryza sativa L.Subsp.Japonica)DNA指纹图谱,分析粳稻品种间的遗传相似性,为其育种和种子纯度鉴定提供参考。【方法】以19份太湖地区优质常规粳稻品种为材料,利用分布于水稻12条染色体上的24对SSR引物构建其DNA指纹图谱,并分析其遗传相似性。【结果】24对引物在19份粳稻品种中共检测到99个等位基因,每对SSR引物检测到等位基因1~7个,平均为4.1个。筛选获得能完全区分19份粳稻材料的4对核心引物(RM190、RM18、RM297、RM5414),其在19份粳稻中可扩增获得22个多态性片段;以RM190和RM18区分鉴别粳稻材料的能力最强,可以区别鉴定6个粳稻品种,RM297和RM5414仅能鉴别2个粳稻品种,RM297能鉴别常农粳5号和宁9103,RM5414能区分南粳47和常粳10-9。19份粳稻品种间的遗传相似系数变幅为0.408~0.857,平均为0.605,遗传相似系数在0.500~0.700的材料占81.87%。UPGMA聚类分析结果显示,在遗传相似系数0.550处,19份粳稻材料可聚为两大类群;在遗传相似系数0.620和0.570处,两大类群均可分为两个亚群。【结论】太湖地区常规粳稻品种遗传背景相似度高,遗传多样性不够丰富,有待进一步加强引进和利用新的基因资源,创新水稻育种材料。

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[1]太湖地区24份杂交粳稻DNA指纹图谱的构建及遗传相似性分析. 孙海燕,顾雯雯,王淑园,罗兵,杨志刚,沈宗根,端木银熙. 2014

[2]太湖地区10份抗褐飞虱粳稻SSR指纹图谱的构建及遗传相似性分析. 孙海燕,高阳,杨志刚,沈宗根. 2015

[3]江苏省杂交粳稻与常规粳稻新品种主要品质性状和抗病性的比较分析. 钟卫国,胡江,周勇,孙菊英,端木银熙,梁国华,钱前. 2014

[4]江苏省杂交粳稻与常规粳稻新品种主要性状比较. 钟卫国,李标,潘斌清,端木李玲,俞良,胡江,端木银熙,梁国华,钱前. 2017

[5]湖南同名地方稻资源SSR标记及表现型的比较分析. 肖军治,段永红,刘文强,潘孝武,闵军,陆婷婷,盛新年,黎用朝. 2014

[6]农户保存与种质库保存的同近名地方稻品种的遗传多样性研究. 金建楚,李小湘,黎用朝,潘孝武,刘文强,段永红,余亚莹,盛新年,赵文锦,魏秀彩. 2018

[7]农户保存与种质库保存的同近名地方稻品种的遗传多样性研究（英文）. 金建楚,李小湘,黎用朝,潘孝武,刘文强,段永红,余亚莹,盛新年,赵文锦,魏秀彩. 2018

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